More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1553 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  100 
 
 		 331 aa  684    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  42.3 
 
 		 325 aa  237  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 330 aa  216  4e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  35.93 
 
 		 347 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  36.23 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4869  AraC family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 334 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 335 aa  211  1e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0070  transcriptional regulator  35.93 
 
 		 347 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.020859 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  37.07 
 
 		 329 aa  209  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 334 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  36.7 
 
 		 334 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 332 aa  207  2e-52  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  37.08 
 
 		 331 aa  206  3e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  37.05 
 
 		 330 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  36.62 
 
 		 336 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  36.25 
 
 		 334 aa  200  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3785  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 335 aa  199  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  34.23 
 
 		 336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  35.89 
 
 		 335 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 306 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  32.9 
 
 		 324 aa  192  5e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  30.96 
 
 		 324 aa  192  6e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  32.06 
 
 		 348 aa  192  9e-48  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  36.31 
 
 		 332 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  45.37 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3593  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 342 aa  185  9e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 328 aa  182  1e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 341 aa  179  4e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 299 aa  179  8e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  32.42 
 
 		 340 aa  169  7e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  32.33 
 
 		 351 aa  167  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  33.47 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  35.1 
 
 		 285 aa  163  3e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.91 
 
 		 326 aa  164  3e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 326 aa  164  3e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  32.4 
 
 		 336 aa  163  4.0000000000000004e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 332 aa  162  8.000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.01 
 
 		 327 aa  162  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  32.34 
 
 		 360 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  28.57 
 
 		 321 aa  160  4e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  35 
 
 		 345 aa  159  9e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  29.77 
 
 		 330 aa  158  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.32 
 
 		 325 aa  158  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  30.45 
 
 		 339 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  29.97 
 
 		 322 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  30.72 
 
 		 327 aa  157  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  31.84 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 332 aa  155  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  30.43 
 
 		 337 aa  153  4e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 343 aa  152  8e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1180  AraC family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 320 aa  152  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.688099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  31.8 
 
 		 347 aa  150  2e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5650  AraC family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 337 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  31.29 
 
 		 361 aa  150  3e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  31.56 
 
 		 320 aa  150  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.41 
 
 		 327 aa  149  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2723  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 331 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.844059  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 333 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  29.64 
 
 		 344 aa  145  1e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1506  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.570084  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6323  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 345 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.879961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 329 aa  144  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  36.12 
 
 		 331 aa  143  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0966  transcriptional regulator, AraC family  33.22 
 
 		 354 aa  142  5e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00252512 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6981  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 345 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0671274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.92 
 
 		 324 aa  142  8e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3556  transcriptional regulator  35.4 
 
 		 319 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253425 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0954  transcriptional regulator, AraC family  29.66 
 
 		 346 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  29.69 
 
 		 314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5594  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 321 aa  140  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  28.53 
 
 		 322 aa  140  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  30.04 
 
 		 326 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6821  AraC family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 324 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 344 aa  138  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  27.52 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.39 
 
 		 323 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0916  AraC family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 335 aa  136  4e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6415  AraC family transcriptional regulator  33.11 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5545  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.7737  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5910  AraC family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 320 aa  136  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  28.29 
 
 		 326 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1772  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.35 
 
 		 293 aa  134  3e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0120296 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  36.57 
 
 		 330 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2995  transcriptional regulator, AraC family  28.44 
 
 		 341 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  28.66 
 
 		 345 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  35.19 
 
 		 322 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  31.21 
 
 		 338 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  28.75 
 
 		 338 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6286  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0385  transcriptional regulator  27.76 
 
 		 334 aa  127  2.0000000000000002e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 348 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3598  transcriptional regulator, AraC family  29.77 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0167816  normal  0.0986203 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 316 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>