More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1599 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1599  transcriptional regulator  100 
 
 		 361 aa  738    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.97604  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0622  transcriptional regulator  41.87 
 
 		 340 aa  268  8e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.553854  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1643  transcriptional regulator, AraC family  41.57 
 
 		 351 aa  262  8e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.671722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0189  transcriptional regulator, AraC family  39.63 
 
 		 360 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.166962 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  40.37 
 
 		 347 aa  246  4e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2573  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  39.76 
 
 		 345 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3712  transcriptional regulator  36.2 
 
 		 336 aa  217  2.9999999999999998e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.990015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2142  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 324 aa  192  9e-48  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0897  transcriptional regulator  34.12 
 
 		 335 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0125  transcriptional regulator  33.23 
 
 		 325 aa  190  4e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2846  AraC family transcriptional regulator  33.43 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5008  putative transcriptional regulator  36.14 
 
 		 332 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.250322  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4411  helix-turn-helix domain-containing protein  33.75 
 
 		 334 aa  186  8e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.321471  normal  0.2451 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4536  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0920  AraC family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  34.55 
 
 		 336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4697  transcriptional regulator  34.44 
 
 		 331 aa  182  9.000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207414  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5041  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 331 aa  181  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00544571 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57630  AraC family transcriptional regulator  36.39 
 
 		 299 aa  181  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.963773 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2675  transcriptional regulator, AraC family  39.29 
 
 		 344 aa  180  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.307401  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 332 aa  179  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1313  AraC family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 306 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.459937  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3263  transcriptional regulator, AraC family  32.33 
 
 		 326 aa  179  8e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.380473 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 341 aa  178  1e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3787  transcriptional regulator  29.36 
 
 		 321 aa  178  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.113221 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4427  transcriptional regulator, AraC family  35.77 
 
 		 336 aa  177  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.326492  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2301  transcriptional regulator  29.81 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0634001 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1489  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.44 
 
 		 323 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.616641 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1778  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.93 
 
 		 325 aa  177  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.545321  normal  0.0235367 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4121  helix-turn-helix, AraC type  37.15 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3506  AraC family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 330 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.939341  normal  0.0589755 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2599  AraC family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 343 aa  172  6.999999999999999e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2234  AraC family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 330 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.962439 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4589  AraC family transcriptional regulator  32.01 
 
 		 333 aa  172  9e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  30.56 
 
 		 329 aa  171  1e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 332 aa  171  3e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2426  transcriptional regulator, AraC family  29.66 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.971153  normal  0.0916341 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3344  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.58 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.430093 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5208  transcriptional regulator, AraC family  27.91 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000934033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1857  AraC family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 338 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18222 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3975  transcriptional regulator  31.19 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2762  transcriptional regulator, AraC family  31.08 
 
 		 332 aa  167  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0171097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1918  transcriptional regulator, AraC family  38.21 
 
 		 327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  28.79 
 
 		 326 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1229  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.15 
 
 		 327 aa  162  7e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.134279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3759  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.32 
 
 		 326 aa  161  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  32.12 
 
 		 330 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 		 322 aa  159  9e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1705  helix-turn-helix domain-containing protein  28.24 
 
 		 320 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.29723  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1772  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.3 
 
 		 293 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0120296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0564  AraC family transcriptional regulator  34.05 
 
 		 285 aa  157  3e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.682443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1182  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  30.16 
 
 		 324 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.904069 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1733  transcriptional regulator, AraC family  30.65 
 
 		 322 aa  156  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05287  transcriptional activator FtrA  32.84 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0974  helix-turn-helix domain-containing protein  32.79 
 
 		 314 aa  152  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.998994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4511  transcriptional regulator, AraC family  33.46 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.64274 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  31.29 
 
 		 331 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0442  hypothetical protein  28.92 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 348 aa  146  6e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  30.95 
 
 		 324 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  34.06 
 
 		 328 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  30.61 
 
 		 324 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  29.8 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  33.22 
 
 		 322 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  30.42 
 
 		 324 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  30.22 
 
 		 317 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  30.17 
 
 		 324 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  33.45 
 
 		 327 aa  143  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  30.2 
 
 		 318 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  30.2 
 
 		 318 aa  143  6e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  30.07 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  30.2 
 
 		 318 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  30.2 
 
 		 318 aa  143  6e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  30.07 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  30.2 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  30.2 
 
 		 318 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3467  AraC family transcriptional regulator  29.97 
 
 		 323 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0104  AraC family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 328 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  34.39 
 
 		 344 aa  141  1.9999999999999998e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  29.72 
 
 		 320 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  30.24 
 
 		 316 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  29.86 
 
 		 321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 338 aa  140  3.9999999999999997e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  32.53 
 
 		 356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 327 aa  139  8.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 333 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  29.17 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  29.14 
 
 		 317 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 333 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  25.93 
 
 		 330 aa  137  3.0000000000000003e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  29.9 
 
 		 333 aa  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  30.39 
 
 		 329 aa  136  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0068  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 347 aa  137  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0711239 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4194  AraC family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 335 aa  136  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0109567  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 329 aa  136  6.0000000000000005e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0072  transcriptional regulator  27.25 
 
 		 347 aa  135  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000158985 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 336 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  28.44 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>