More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2740 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2955  transcriptional regulator, AraC family  97.15 
 
 
317 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.012422  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2740  transcriptional activator FtrA  100 
 
 
317 aa  657    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.187912 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  59.05 
 
 
321 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  58.41 
 
 
321 aa  395  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  55.87 
 
 
324 aa  385  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  55.52 
 
 
324 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  56.19 
 
 
318 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  54.92 
 
 
321 aa  381  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  56.19 
 
 
318 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  55.21 
 
 
324 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  56.19 
 
 
318 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  55.84 
 
 
320 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  55.21 
 
 
324 aa  383  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  55.84 
 
 
320 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  56.19 
 
 
318 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  56.19 
 
 
318 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  55.87 
 
 
318 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  55.52 
 
 
320 aa  381  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1760  transcriptional activator FtrA  56.19 
 
 
318 aa  372  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  51.59 
 
 
333 aa  338  9.999999999999999e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  48.26 
 
 
331 aa  329  3e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  49.68 
 
 
326 aa  326  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1234  AraC family transcriptional regulator  48.41 
 
 
335 aa  325  7e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  49.68 
 
 
329 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  51.68 
 
 
333 aa  317  2e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  48.23 
 
 
329 aa  315  9e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1985  transcriptional activator FtrA  47.1 
 
 
333 aa  315  9e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0670847 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  48.08 
 
 
333 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2150  transcriptional activator FtrA  46.96 
 
 
330 aa  309  4e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.077741  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  49.03 
 
 
322 aa  308  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  46.35 
 
 
333 aa  305  5.0000000000000004e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6432  AraC family transcriptional regulator  45.98 
 
 
332 aa  301  1e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  43.77 
 
 
328 aa  275  6e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  42.09 
 
 
324 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  42.36 
 
 
350 aa  269  4e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  43.23 
 
 
340 aa  268  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  42.99 
 
 
320 aa  266  2.9999999999999995e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  41.48 
 
 
326 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  41.48 
 
 
326 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  41.48 
 
 
326 aa  265  1e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  41.16 
 
 
333 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  43.4 
 
 
321 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  39.68 
 
 
326 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  40.97 
 
 
325 aa  257  1e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  41.16 
 
 
333 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  40.95 
 
 
346 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3331  transcriptional regulator, AraC family  43.37 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  40.84 
 
 
322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  42.06 
 
 
350 aa  253  3e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  40.32 
 
 
348 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  40.82 
 
 
347 aa  250  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  41.46 
 
 
327 aa  249  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  41.48 
 
 
338 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  42.3 
 
 
330 aa  248  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  38.66 
 
 
326 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  41.59 
 
 
342 aa  246  3e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  40.58 
 
 
344 aa  245  6e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.49 
 
 
330 aa  245  6.999999999999999e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  41.48 
 
 
338 aa  245  8e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  40.84 
 
 
341 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  40.84 
 
 
341 aa  245  9e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 
349 aa  244  9.999999999999999e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  39.69 
 
 
332 aa  242  6e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  40.32 
 
 
339 aa  242  7e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  38.68 
 
 
327 aa  241  9e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  41.48 
 
 
333 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  39.23 
 
 
356 aa  239  2.9999999999999997e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  39.68 
 
 
320 aa  239  4e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  42.63 
 
 
337 aa  239  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  38.51 
 
 
334 aa  239  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  42.63 
 
 
331 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  40.19 
 
 
331 aa  238  8e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  40.19 
 
 
331 aa  238  8e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  38.87 
 
 
330 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  41.39 
 
 
314 aa  236  4e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  37.34 
 
 
317 aa  235  7e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3112  ThiJ/PfpI domain protein  38.34 
 
 
321 aa  235  9e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.226454  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4599  transcriptional regulator, AraC family  40.13 
 
 
332 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  38.44 
 
 
320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  41.4 
 
 
313 aa  232  6e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  38.98 
 
 
334 aa  231  1e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  40.32 
 
 
337 aa  230  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  40.25 
 
 
328 aa  230  3e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4043  transcriptional regulator, AraC family  39.42 
 
 
321 aa  229  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  40.73 
 
 
323 aa  229  5e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 
331 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 
332 aa  229  6e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  36.71 
 
 
317 aa  228  1e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  36.13 
 
 
318 aa  226  3e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 
342 aa  226  4e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  41.48 
 
 
315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  37.82 
 
 
362 aa  225  7e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2327  transcriptional regulator  35.56 
 
 
316 aa  224  1e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.223293  normal  0.02817 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  39.74 
 
 
325 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 
335 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 
335 aa  223  4e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 
316 aa  223  4e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 
313 aa  222  4.9999999999999996e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 
335 aa  222  6e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  36.45 
 
 
335 aa  222  8e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>