More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4484 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  100 
 
 
361 aa  744    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  66.04 
 
 
341 aa  455  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  66.77 
 
 
331 aa  455  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  49.04 
 
 
321 aa  317  2e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  47.62 
 
 
319 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  46.84 
 
 
319 aa  306  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  46.03 
 
 
319 aa  300  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  47.48 
 
 
333 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  43.08 
 
 
319 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  40.91 
 
 
344 aa  276  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  41.85 
 
 
316 aa  271  1e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 
348 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 
328 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  42.81 
 
 
358 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  41.01 
 
 
317 aa  259  5.0000000000000005e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0227  AraC family transcriptional regulator  44.19 
 
 
324 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  40.19 
 
 
327 aa  241  1e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  41.77 
 
 
328 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  41.53 
 
 
321 aa  239  4e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  39.74 
 
 
328 aa  237  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  37.09 
 
 
341 aa  236  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 
329 aa  233  3e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  40.95 
 
 
319 aa  233  5e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  37.46 
 
 
356 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  37.19 
 
 
349 aa  231  2e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 
336 aa  229  4e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 
387 aa  223  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  39.12 
 
 
338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  39.04 
 
 
334 aa  219  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 
322 aa  218  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 
362 aa  218  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  34.98 
 
 
336 aa  218  1e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  38.94 
 
 
330 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5148  AraC family transcriptional regulator  41.51 
 
 
328 aa  218  2e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0642429  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  37.85 
 
 
324 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  38.44 
 
 
338 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  37.85 
 
 
324 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  37.85 
 
 
324 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 
322 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  36.71 
 
 
321 aa  216  5e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 
345 aa  215  8e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  38.32 
 
 
338 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  36.39 
 
 
348 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  35.69 
 
 
334 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 
330 aa  211  1e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  39.24 
 
 
346 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  39.24 
 
 
343 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  39.24 
 
 
369 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  39.24 
 
 
346 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.24 
 
 
369 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  39.24 
 
 
346 aa  211  2e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  39.24 
 
 
374 aa  211  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  36.59 
 
 
334 aa  210  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  36.62 
 
 
334 aa  209  4e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  35.89 
 
 
334 aa  210  4e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  36.39 
 
 
320 aa  209  5e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  37.46 
 
 
320 aa  209  5e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  35.02 
 
 
325 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
322 aa  209  8e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 
344 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  37.58 
 
 
338 aa  208  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  38.96 
 
 
338 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  36.06 
 
 
345 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  36.06 
 
 
344 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  36.06 
 
 
344 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 
321 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 
321 aa  206  6e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 
344 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  35.22 
 
 
344 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  35.22 
 
 
344 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  35.22 
 
 
344 aa  205  8e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  35.76 
 
 
325 aa  205  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  36.34 
 
 
327 aa  205  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  37.5 
 
 
338 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 
321 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  33.74 
 
 
354 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 
334 aa  204  2e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  34.98 
 
 
327 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  35.44 
 
 
341 aa  204  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 
323 aa  204  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1880  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
327 aa  203  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  38.85 
 
 
326 aa  203  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  36.65 
 
 
372 aa  203  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  38.34 
 
 
327 aa  203  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  38.06 
 
 
311 aa  202  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  34.85 
 
 
341 aa  202  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  34.89 
 
 
326 aa  202  9.999999999999999e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4745  AraC family transcriptional regulator  37.34 
 
 
336 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  36.08 
 
 
335 aa  202  9.999999999999999e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3422  AraC family transcriptional regulator  37.34 
 
 
336 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4095  AraC family transcriptional regulator  37.34 
 
 
336 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  34.83 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  34.48 
 
 
320 aa  200  3e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2164  transcriptional regulator  36.42 
 
 
340 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.0201995 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  35.22 
 
 
324 aa  196  5.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  36.89 
 
 
322 aa  196  7e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 
315 aa  195  9e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  35.44 
 
 
342 aa  194  1e-48  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  36.83 
 
 
346 aa  195  1e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 
321 aa  194  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>