More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5151 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
316 aa  633  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  66.67 
 
 
313 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  63.09 
 
 
342 aa  382  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  60.26 
 
 
313 aa  369  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  55.87 
 
 
320 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  55.87 
 
 
320 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  55.87 
 
 
320 aa  331  1e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  56.41 
 
 
315 aa  324  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  57.14 
 
 
315 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  57.14 
 
 
315 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  57.14 
 
 
315 aa  321  9.999999999999999e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  55.56 
 
 
315 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  54.6 
 
 
314 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0092  AraC family transcriptional regulator  53.53 
 
 
312 aa  294  1e-78  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0089  AraC family transcriptional regulator  54.49 
 
 
312 aa  287  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0049  transcriptional regulator, AraC family  45.51 
 
 
322 aa  281  1e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  47.62 
 
 
340 aa  267  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  48.59 
 
 
319 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  48.08 
 
 
333 aa  266  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  45.69 
 
 
350 aa  265  7e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  47.65 
 
 
330 aa  264  2e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  46.18 
 
 
323 aa  262  6e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  45.6 
 
 
327 aa  260  2e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  47.65 
 
 
346 aa  259  4e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  48.1 
 
 
327 aa  259  4e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  42.81 
 
 
321 aa  258  7e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  46.89 
 
 
332 aa  256  3e-67  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  44.05 
 
 
333 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  44.79 
 
 
328 aa  256  3e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  42.54 
 
 
342 aa  252  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  43.57 
 
 
325 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  45.11 
 
 
320 aa  251  1e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  43.63 
 
 
348 aa  251  1e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
326 aa  251  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 
335 aa  248  6e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  45.71 
 
 
324 aa  248  7e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 
335 aa  248  8e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  44.59 
 
 
326 aa  248  9e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 
335 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  44.41 
 
 
350 aa  244  9.999999999999999e-64  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  42.68 
 
 
326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  44.55 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  42.68 
 
 
326 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  39.87 
 
 
320 aa  243  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 
335 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  42.68 
 
 
326 aa  243  3e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  49.67 
 
 
322 aa  242  7e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  44.23 
 
 
317 aa  242  7e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  43.41 
 
 
329 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  42.81 
 
 
321 aa  240  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  43.61 
 
 
330 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  43.91 
 
 
317 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  45.97 
 
 
314 aa  240  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  44.97 
 
 
322 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  42.49 
 
 
318 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  43.59 
 
 
333 aa  237  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  42.77 
 
 
338 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  42.49 
 
 
318 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  42.49 
 
 
318 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5890  transcriptional activator FtrA  42.68 
 
 
321 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  42.77 
 
 
341 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  42.95 
 
 
324 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  42.77 
 
 
341 aa  237  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  42.49 
 
 
318 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  43.31 
 
 
362 aa  236  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  42.95 
 
 
324 aa  236  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  43.73 
 
 
333 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  42.95 
 
 
324 aa  236  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5345  AraC family transcriptional regulator  45.69 
 
 
318 aa  235  6e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  42.17 
 
 
318 aa  235  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  43.41 
 
 
338 aa  235  6e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  42.37 
 
 
334 aa  235  9e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4355  AraC family transcriptional regulator  45.69 
 
 
356 aa  234  1.0000000000000001e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  41.85 
 
 
318 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  46.96 
 
 
331 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  42.31 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  42.31 
 
 
320 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  41.07 
 
 
322 aa  233  3e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3344  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 
306 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.107128  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  41.08 
 
 
332 aa  232  6e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  41.67 
 
 
324 aa  232  6e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1271  transcriptional regulator, AraC family  43.87 
 
 
317 aa  232  8.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  0.171456 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  46.33 
 
 
337 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  41.99 
 
 
320 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3549  transcriptional regulator, AraC family  42.59 
 
 
337 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.757715  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 
352 aa  231  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0431  transcriptional regulator, AraC family  43.27 
 
 
320 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2087  transcriptional activator FtrA  42.04 
 
 
321 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31788  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1215  transcriptional regulator, AraC family  42.41 
 
 
356 aa  230  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.836684  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1692  transcriptional regulator, AraC family  45.04 
 
 
333 aa  230  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  43.44 
 
 
339 aa  229  4e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  43.22 
 
 
325 aa  229  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  42.22 
 
 
326 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  39.17 
 
 
318 aa  228  8e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  43.99 
 
 
329 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  41.94 
 
 
331 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  42.11 
 
 
346 aa  227  2e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  42.9 
 
 
347 aa  227  2e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1760  transcriptional activator FtrA  41.21 
 
 
318 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.813557  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4079  transcriptional regulator, AraC family  43.85 
 
 
321 aa  226  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0276978  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>