More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2605 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  100 
 
 
319 aa  651    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  60.95 
 
 
317 aa  384  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  53.63 
 
 
327 aa  350  2e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 
341 aa  324  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  51.1 
 
 
356 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  50.32 
 
 
328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  48.57 
 
 
319 aa  297  1e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  49.53 
 
 
328 aa  297  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  49.36 
 
 
321 aa  296  3e-79  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  49.04 
 
 
319 aa  296  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  44.97 
 
 
358 aa  295  5e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  48.25 
 
 
319 aa  295  8e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  49.37 
 
 
322 aa  294  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  46.84 
 
 
331 aa  293  4e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  46.86 
 
 
336 aa  287  2e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  43.08 
 
 
361 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  46.25 
 
 
327 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  46.65 
 
 
321 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  48.4 
 
 
319 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  47.8 
 
 
324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  47.8 
 
 
324 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  47.48 
 
 
324 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  46.52 
 
 
322 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  45.94 
 
 
344 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  46.47 
 
 
321 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  46.47 
 
 
321 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  46.47 
 
 
321 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  44.38 
 
 
341 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  45.62 
 
 
345 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  45.62 
 
 
344 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  45.62 
 
 
344 aa  279  4e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  47.15 
 
 
334 aa  278  7e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  46.25 
 
 
362 aa  278  8e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  45.19 
 
 
341 aa  278  9e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  45.59 
 
 
344 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  45.59 
 
 
344 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  50.79 
 
 
326 aa  277  2e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5148  AraC family transcriptional regulator  52.5 
 
 
328 aa  277  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0642429  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  45.59 
 
 
344 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  45.59 
 
 
344 aa  277  2e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  46.69 
 
 
338 aa  276  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  45.31 
 
 
336 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  47.47 
 
 
322 aa  276  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  45.19 
 
 
321 aa  275  5e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  46.42 
 
 
333 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.37 
 
 
338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  43.91 
 
 
344 aa  273  3e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  45.19 
 
 
348 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  42.01 
 
 
330 aa  271  8.000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1880  AraC family transcriptional regulator  48.55 
 
 
327 aa  271  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  48.41 
 
 
320 aa  269  5e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  46.37 
 
 
338 aa  268  8e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  45.19 
 
 
325 aa  268  8e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  43.17 
 
 
334 aa  268  1e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  46.23 
 
 
387 aa  267  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  46.69 
 
 
338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  44.79 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  45.57 
 
 
342 aa  263  3e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  44.48 
 
 
339 aa  262  6e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  45.71 
 
 
312 aa  262  6.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  43.53 
 
 
325 aa  260  2e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  46.96 
 
 
327 aa  260  2e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  45.18 
 
 
345 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  44.48 
 
 
330 aa  258  7e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  45.77 
 
 
323 aa  258  1e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  42.81 
 
 
316 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  43.03 
 
 
332 aa  257  2e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
351 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  45.57 
 
 
369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  45.57 
 
 
346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  44.58 
 
 
363 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  45.57 
 
 
346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  45.57 
 
 
369 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  45.57 
 
 
346 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  45.57 
 
 
343 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  45.57 
 
 
374 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  43.22 
 
 
329 aa  253  4.0000000000000004e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  42.28 
 
 
329 aa  252  6e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  45.66 
 
 
310 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  45.48 
 
 
327 aa  251  1e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  44 
 
 
334 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  42.81 
 
 
341 aa  250  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  45.94 
 
 
357 aa  249  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 
338 aa  249  4e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  43.95 
 
 
335 aa  248  9e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  43.08 
 
 
334 aa  248  1e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  38.2 
 
 
354 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  43.67 
 
 
320 aa  247  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  42.24 
 
 
331 aa  247  2e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  42.31 
 
 
315 aa  246  3e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  46.49 
 
 
437 aa  246  4e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
334 aa  245  6e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  42.09 
 
 
320 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  39.81 
 
 
344 aa  245  9e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  46.78 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  44.09 
 
 
311 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  44.09 
 
 
311 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  43.81 
 
 
324 aa  242  5e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  38.92 
 
 
349 aa  240  2e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  39.94 
 
 
348 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>