More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_2399 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_2399  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 324 aa  660    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2168  transcriptional regulator, AraC family  41.29 
 
 		 320 aa  233  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2950  transcriptional regulator, AraC family  38.76 
 
 		 305 aa  222  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0811824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4371  transcriptional regulator, AraC family  40.14 
 
 		 307 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0107025  normal  0.388396 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0170  AraC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3131  transcription regulator  37.72 
 
 		 303 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.379671 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  33.97 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  34.06 
 
 		 333 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  37.35 
 
 		 321 aa  189  7e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 322 aa  187  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5056  transcriptional regulator, AraC family  35.06 
 
 		 336 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0278301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 358 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0339  transcriptional regulator, AraC family  40.47 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  35.08 
 
 		 334 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  33.86 
 
 		 317 aa  184  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 319 aa  183  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  32.12 
 
 		 341 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 387 aa  183  3e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4300  transcriptional regulator, AraC family  33.77 
 
 		 336 aa  183  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  36.68 
 
 		 338 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  33.86 
 
 		 327 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 324 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  37.06 
 
 		 312 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2923  transcriptional regulator AraC family  35.74 
 
 		 333 aa  181  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.283298  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 324 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  33.75 
 
 		 362 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 334 aa  180  4e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2618  AraC family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 333 aa  179  4e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 316 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  32.06 
 
 		 341 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 354 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 322 aa  178  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  33.23 
 
 		 330 aa  177  2e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 349 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0159  transcriptional regulator  36.67 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  35.13 
 
 		 320 aa  177  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  34.27 
 
 		 328 aa  176  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0758  transcriptional regulator  36.06 
 
 		 338 aa  176  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.182304  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 336 aa  176  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 349 aa  176  6e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 336 aa  175  8e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  30.89 
 
 		 356 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  36.16 
 
 		 331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  34.66 
 
 		 338 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 348 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  36.83 
 
 		 312 aa  172  5e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 319 aa  172  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  30 
 
 		 361 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  31.56 
 
 		 344 aa  172  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  32.18 
 
 		 321 aa  172  9e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  39.91 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  34.47 
 
 		 327 aa  171  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0075  transcriptional regulator, AraC family  37.97 
 
 		 307 aa  170  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  34.49 
 
 		 318 aa  169  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 316 aa  169  8e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  33.23 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  39.66 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 330 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 328 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3952  transcriptional regulator  34.19 
 
 		 326 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.292576  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  35.91 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  34.71 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  35.91 
 
 		 374 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  35.91 
 
 		 369 aa  167  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  31.33 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  34.71 
 
 		 311 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 321 aa  167  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 343 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  35.91 
 
 		 346 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  33.75 
 
 		 310 aa  166  4e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 342 aa  166  4e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 338 aa  166  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  36.83 
 
 		 313 aa  166  5e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  36.71 
 
 		 311 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 321 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  33.12 
 
 		 339 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 311 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  30.38 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  32.19 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  34.59 
 
 		 313 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 317 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 344 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  33.43 
 
 		 345 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 351 aa  163  3e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 344 aa  163  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  41.23 
 
 		 314 aa  163  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 338 aa  164  3e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  33.03 
 
 		 334 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>