More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5407 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5407  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 313 aa  615  1e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.439375  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6692  transcriptional regulator, AraC family  67.63 
 
 		 313 aa  410  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.178977 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2003  AraC family transcriptional regulator  64.35 
 
 		 342 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5151  AraC family transcriptional regulator  60.26 
 
 		 316 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.479428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3394  transcriptional regulator  57.28 
 
 		 320 aa  332  5e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.482598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3383  transcriptional regulator  57.28 
 
 		 320 aa  332  5e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.690138  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3445  transcriptional regulator  57.28 
 
 		 320 aa  332  5e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.68449 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5440  AraC family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 315 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5422  AraC family transcriptional regulator  58.65 
 
 		 315 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0424919  normal  0.013013 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4847  AraC family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 315 aa  328  9e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0230  transcriptional regulator  56.09 
 
 		 315 aa  325  7e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.964133 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4763  AraC family transcriptional regulator  57.37 
 
 		 315 aa  318  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316833  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2197  AraC family transcriptional regulator  57.19 
 
 		 314 aa  313  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0092  AraC family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 312 aa  285  8e-76  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0049  transcriptional regulator, AraC family  47.12 
 
 		 322 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0282  AraC family transcriptional regulator  48.56 
 
 		 342 aa  281  9e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 340 aa  281  9e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4080  transcriptional regulator  49.05 
 
 		 348 aa  280  2e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0089  AraC family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 312 aa  277  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450491 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3109  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 320 aa  276  4e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.59349 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2659  AraC family transcriptional regulator  48.4 
 
 		 333 aa  275  9e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1334  putative transcriptional regulator  48.25 
 
 		 317 aa  268  7e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15150  putative transcriptional regulator  48.25 
 
 		 317 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.414846  hitchhiker  0.0000298096 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0475  AraC family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 350 aa  266  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625315  normal  0.0311111 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3631  transcriptional regulator, AraC family  50.31 
 
 		 327 aa  264  2e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1693  AraC family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 321 aa  263  3e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.69841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8035  AraC family transcriptional regulator  49.36 
 
 		 333 aa  262  4.999999999999999e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.511507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4316  transcriptional regulator, AraC family  48.9 
 
 		 320 aa  261  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7121  transcriptional activator FtrA  48.56 
 
 		 328 aa  261  8e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0749123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5943  transcriptional regulator  48.72 
 
 		 338 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.295801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1097  ThiJ/PfpI domain protein  47.83 
 
 		 350 aa  260  2e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0266562  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2641  AraC family transcriptional regulator  49.36 
 
 		 338 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2002  AraC family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.513633  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2612  AraC family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 341 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0686  AraC family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 330 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334624 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4085  transcriptional regulator, AraC family  47.62 
 
 		 331 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.825112  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4197  transcriptional regulator, AraC family  47.62 
 
 		 331 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.855071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2532  AraC family transcriptional regulator  48.4 
 
 		 333 aa  256  3e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.607958 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2157  AraC family transcriptional regulator  48.09 
 
 		 346 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.256833  hitchhiker  0.00609835 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3963  AraC family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 335 aa  256  4e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  49.05 
 
 		 320 aa  255  7e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0488  AraC family transcriptional regulator  43.63 
 
 		 335 aa  255  8e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0514  transcriptional regulator, AraC family  47.76 
 
 		 334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1218  transcriptional regulator, AraC family  46.84 
 
 		 323 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2364  transcriptional regulator, AraC family  46.08 
 
 		 322 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5328  transcriptional activator FtrA  49.68 
 
 		 324 aa  253  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.417039 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3836  AraC family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 335 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6340  transcriptional regulator, AraC family  46.67 
 
 		 326 aa  252  6e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351976 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2631  transcriptional regulator  48.29 
 
 		 347 aa  252  6e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0133443  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4725  AraC family transcriptional regulator  47.94 
 
 		 332 aa  252  6e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0489  transcriptional regulator, AraC family  49.04 
 
 		 325 aa  249  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3780  transcriptional regulator, AraC family  42.99 
 
 		 335 aa  249  5e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2051  transcriptional regulator, AraC family  48.39 
 
 		 344 aa  249  6e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0974748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9264  transcriptional regulator, AraC family with amidase-like domain  48.46 
 
 		 328 aa  249  6e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.341665 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  45.43 
 
 		 327 aa  248  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1680  transcriptional regulator, AraC family  48.26 
 
 		 319 aa  248  8e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00886314  normal  0.186042 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5179  transcriptional regulator, AraC family  45.82 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2641  transcriptional activator FtrA  48.88 
 
 		 322 aa  247  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4426  transcriptional activator FtrA  45.83 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2856  AraC family transcriptional regulator  49.33 
 
 		 314 aa  246  3e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0527  transcriptional regulator, AraC family  44.59 
 
 		 318 aa  246  4e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6166  transcriptional regulator, AraC family  47.28 
 
 		 362 aa  246  4.9999999999999997e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0220245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5345  AraC family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5233  AraC family transcriptional regulator  46.65 
 
 		 349 aa  243  3.9999999999999997e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.896357  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5373  transcriptional activator FtrA  46.95 
 
 		 320 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.379602  normal  0.0775766 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0500  ThiJ/PfpI domain protein  45.24 
 
 		 346 aa  242  5e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.262887  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4864  transcriptional activator FtrA  47.59 
 
 		 324 aa  242  5e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.427794  hitchhiker  0.000178687 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4355  AraC family transcriptional regulator  50.5 
 
 		 356 aa  242  6e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4348  transcriptional activator FtrA  47.59 
 
 		 324 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000580095 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0778  transcriptional activator FtrA  46.95 
 
 		 324 aa  241  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.221913  normal  0.0400061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3261  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.127584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0705  AraC family transcriptional regulator  50.32 
 
 		 331 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3453  transcriptional activator FtrA  46.95 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.171159  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4913  transcriptional activator FtrA  46.95 
 
 		 320 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.860168  normal  0.680733 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3284  transcriptional activator FtrA  47.3 
 
 		 333 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.059892 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3031  transcriptional activator FtrA  46.96 
 
 		 333 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00937108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4737  transcriptional activator FtrA  46.5 
 
 		 321 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.196215 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2214  transcriptional activator FtrA  45.69 
 
 		 318 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00591748  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4403  transcriptional activator FtrA  47.76 
 
 		 333 aa  238  6.999999999999999e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0835  transcriptional activator FtrA  45.37 
 
 		 318 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1565  transcriptional activator FtrA  45.37 
 
 		 318 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0715182  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0872  transcriptional activator FtrA  45.37 
 
 		 318 aa  238  9e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.637455  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0055  transcriptional activator FtrA  45.37 
 
 		 318 aa  238  9e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00213604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0923  AraC family transcriptional regulator  44.72 
 
 		 331 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.147864  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2062  transcriptional activator FtrA  45.37 
 
 		 329 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3202  transcriptional regulator, AraC family  45.22 
 
 		 330 aa  237  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.125903  unclonable  0.000000000016632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3331  transcriptional regulator, AraC family  49.35 
 
 		 348 aa  236  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5349  AraC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 325 aa  236  3e-61  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0964  transcriptional activator FtrA  45.05 
 
 		 318 aa  236  4e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3843  transcriptional regulator, AraC family  46.73 
 
 		 339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.295718  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3699  transcriptional activator FtrA  46.3 
 
 		 324 aa  235  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.507684  normal  0.317961 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1437  AraC family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 326 aa  235  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.424387 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2289  transcriptional regulator, AraC family  45.57 
 
 		 332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0296172  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1058  transcriptional regulator, AraC family  51.31 
 
 		 322 aa  234  1.0000000000000001e-60  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4748  transcriptional regulator  41.96 
 
 		 326 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.760248  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4834  transcriptional regulator  41.96 
 
 		 326 aa  232  6e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2875  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.16 
 
 		 330 aa  231  1e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.276432  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5134  transcriptional regulator  42.32 
 
 		 326 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.479216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3587  transcriptional activator FtrA  45.4 
 
 		 329 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.116485  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0056  transcriptional activator FtrA  44.23 
 
 		 326 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>