More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3774 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 349 aa  726    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  65.66 
 
 		 344 aa  467  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  56.68 
 
 		 372 aa  402  1e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  47.88 
 
 		 334 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  38.92 
 
 		 330 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  42.99 
 
 		 331 aa  243  3.9999999999999997e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  40.42 
 
 		 336 aa  241  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  40.92 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  42.07 
 
 		 327 aa  237  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  41.36 
 
 		 338 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  39.94 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  39.88 
 
 		 334 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  40.06 
 
 		 324 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 324 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 324 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  39.63 
 
 		 327 aa  229  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 341 aa  228  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 387 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  40.31 
 
 		 356 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  38.44 
 
 		 322 aa  225  7e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 		 338 aa  225  8e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  40.67 
 
 		 341 aa  223  4e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  38.7 
 
 		 329 aa  222  8e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  36.84 
 
 		 319 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  40.43 
 
 		 374 aa  219  7e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  39.17 
 
 		 334 aa  219  7e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 343 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  40.43 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  40.43 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  35.76 
 
 		 354 aa  218  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 346 aa  218  1e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  38.2 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  38.77 
 
 		 326 aa  217  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  38.2 
 
 		 341 aa  216  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  41.07 
 
 		 330 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  38.12 
 
 		 322 aa  215  7e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  39.38 
 
 		 338 aa  215  9e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  38.04 
 
 		 336 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  36.86 
 
 		 327 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  36.68 
 
 		 317 aa  213  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  39.51 
 
 		 338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  39.09 
 
 		 329 aa  212  7e-54  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  38.34 
 
 		 333 aa  211  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.31 
 
 		 344 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  38.31 
 
 		 345 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.31 
 
 		 344 aa  210  2e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  39.69 
 
 		 327 aa  210  2e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 344 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  39.08 
 
 		 323 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  38.2 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  37.99 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  38.14 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  37.99 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  37.99 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 325 aa  207  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  39.2 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  37.72 
 
 		 362 aa  206  4e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 321 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  38.12 
 
 		 321 aa  206  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 321 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 321 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 321 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  37.04 
 
 		 321 aa  205  7e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 321 aa  206  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 321 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 321 aa  205  7e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  37.38 
 
 		 328 aa  205  8e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  37.58 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 335 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  38.06 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 321 aa  203  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 320 aa  203  4e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 348 aa  202  5e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 338 aa  201  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  38.12 
 
 		 342 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  37.38 
 
 		 341 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  37.93 
 
 		 319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 321 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  36.53 
 
 		 338 aa  199  5e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 336 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  36.34 
 
 		 334 aa  199  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 334 aa  199  7.999999999999999e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  36.36 
 
 		 334 aa  198  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  37.26 
 
 		 320 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  36.86 
 
 		 320 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3120  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 324 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  36.12 
 
 		 327 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  36.56 
 
 		 328 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  37.7 
 
 		 349 aa  195  9e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1880  AraC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 327 aa  195  1e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>