More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2157 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 250 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  29.38 
 
 		 266 aa  103  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1003  DNA-binding response regulator  29.61 
 
 		 250 aa  92  8e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5544  histidine kinase  27.91 
 
 		 1306 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1172  AraC family DNA-binding response regulator  30.1 
 
 		 250 aa  90.5  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.409048  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 281 aa  87.4  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  36.54 
 
 		 286 aa  86.7  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1574  histidine kinase  27.71 
 
 		 1378 aa  85.9  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.455228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6369  histidine kinase  28.1 
 
 		 1366 aa  85.1  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 261 aa  84  0.000000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1010  histidine kinase  26.99 
 
 		 1347 aa  84.3  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0363668  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1317  ATP-binding region ATPase domain protein  28.92 
 
 		 1370 aa  83.2  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 255 aa  82.8  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.3 
 
 		 1396 aa  81.6  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0565  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 289 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 289 aa  80.5  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 519 aa  80.5  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 223 aa  80.5  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  35.77 
 
 		 296 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  27.62 
 
 		 259 aa  80.1  0.00000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  27.09 
 
 		 1366 aa  79.3  0.00000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1205  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 440 aa  79.3  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.909691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  36.27 
 
 		 303 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3088  AraC family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.530109  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  40.4 
 
 		 296 aa  78.6  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  36.63 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 250 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  45.12 
 
 		 160 aa  77.8  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  43.01 
 
 		 296 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 281 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1489  histidine kinase  31.92 
 
 		 1404 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639294  normal  0.537564 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 277 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4605  two component transcriptional regulator, AraC family  29.02 
 
 		 271 aa  76.6  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2946  transcriptional regulator, AraC family  39.6 
 
 		 324 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1435  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1836  two component AraC family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 1341 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 112 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1408  helix-turn-helix domain-containing protein  39.6 
 
 		 324 aa  77  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 		 289 aa  77  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 329 aa  76.3  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  37.62 
 
 		 293 aa  76.6  0.0000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2836  AraC family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 296 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00254989  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  36.89 
 
 		 157 aa  76.6  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0220  two component transcriptional regulator, AraC family  26.67 
 
 		 934 aa  76.3  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.497584  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  28.9 
 
 		 322 aa  75.9  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 513 aa  75.9  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 		 133 aa  76.3  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  35.29 
 
 		 316 aa  75.9  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 530 aa  76.3  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2648  response regulator receiver  24.88 
 
 		 1363 aa  75.9  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 277 aa  75.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 156 aa  75.9  0.0000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3772  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  33.05 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1735  histidine kinase  28.11 
 
 		 1343 aa  75.5  0.0000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.260049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 		 1201 aa  75.5  0.0000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  25.93 
 
 		 330 aa  75.5  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1399  helix-turn-helix domain-containing protein  38.61 
 
 		 324 aa  75.5  0.0000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.953379  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2102  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 304 aa  75.1  0.0000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1797  DNA-binding response regulator/sensor histidine kinase  27.27 
 
 		 961 aa  75.1  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4604  two component transcriptional regulator, AraC family  30.52 
 
 		 281 aa  75.1  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.514268  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3497  AraC family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 198 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.27794  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 538 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  40.43 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  39.05 
 
 		 148 aa  75.1  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2193  transcriptional regulator, AraC family  43.01 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000412725 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1284  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.960401  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3262  response regulator receiver protein  25.43 
 
 		 257 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  35.42 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  34.69 
 
 		 331 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3807  AraC family two component transcriptional regulator  27.15 
 
 		 289 aa  73.9  0.000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 142 aa  74.3  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6385  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 256 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1459  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  32.2 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164097 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35140  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.939049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 299 aa  73.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1944  histidine kinase  25.1 
 
 		 1278 aa  73.6  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.866742 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2267  two component transcriptional regulator, AraC family  29.82 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3751  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  33.05 
 
 		 198 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000128468 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  33 
 
 		 297 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2180  helix-turn-helix domain-containing protein  35.64 
 
 		 281 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.971115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 305 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  32.59 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2369  transcriptional regulator  33.68 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4087  two component transcriptional regulator, AraC family  39.39 
 
 		 350 aa  72.8  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3840  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  32.2 
 
 		 198 aa  73.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  33.65 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4560  histidine kinase  27.49 
 
 		 1313 aa  72.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.498007  normal  0.022289 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3232  transcriptional regulator, AraC family  34.71 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0599312  hitchhiker  0.0000105754 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  37.93 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0347  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  39.36 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0415  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 288 aa  72.8  0.000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.547266  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>