More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2914 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007963  Csal_2914  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 318 aa  644    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3282  helix-turn-helix domain-containing protein  45.88 
 
 		 307 aa  268  7e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2332  transcriptional regulator, AraC family  32.18 
 
 		 311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000141159  normal  0.457995 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  29.07 
 
 		 308 aa  163  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2943  helix-turn-helix domain-containing protein  27.12 
 
 		 307 aa  158  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0314532  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4153  transcriptional regulator, AraC family  25.7 
 
 		 309 aa  132  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.24804 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0450  AraC family transcriptional regulator  23.37 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0724332  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1968  transcriptional regulator, AraC family  29.76 
 
 		 321 aa  82.8  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1434  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3135  AraC family transcriptional regulator  25.67 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  29.18 
 
 		 299 aa  80.5  0.00000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0193  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  27.24 
 
 		 305 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 314 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1284  AraC family transcriptional regulator  20.88 
 
 		 297 aa  79.3  0.00000000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.960401  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0164  transcriptional regulator, AraC family  29.91 
 
 		 307 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1054  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 311 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1829  AraC family transcriptional regulator  29.04 
 
 		 319 aa  78.6  0.0000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.362007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  40.37 
 
 		 331 aa  78.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  29.26 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0599  transcriptional regulator  36.13 
 
 		 326 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6320  transcriptional regulator, AraC family  37.59 
 
 		 294 aa  78.2  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.636258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0829  transcriptional regulator  31.52 
 
 		 317 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.351289 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  31.88 
 
 		 345 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4511  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 341 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 314 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4594  transcriptional regulator, AraC family  37.59 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.571926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0661  AraC family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.260355  normal  0.315435 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0499  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 339 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00811586 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1036  AraC family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 306 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.280924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0360  AraC family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 313 aa  76.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000460662  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1163  AraC-type transcriptional regulator domain protein  21.45 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000040891  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1799  AraC family transcriptional regulator  27.66 
 
 		 299 aa  76.3  0.0000000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000057295  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4999  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3202  AraC family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.647622  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2339  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 303 aa  75.9  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.295664 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3735  AraC-like transcriptional regulator  24.53 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00901057  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4474  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 314 aa  75.9  0.0000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3170  transcriptional regulator  42.16 
 
 		 327 aa  75.9  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 338 aa  75.9  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3941  AraC-like transcriptional regulator  28.97 
 
 		 303 aa  75.1  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0722182  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 1201 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  36.08 
 
 		 134 aa  74.3  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0489  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 336 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2126  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 361 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6605  AraC family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0589608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  25.78 
 
 		 302 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4420  AraC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 325 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.863458  hitchhiker  0.00323313 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38040  AraC family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110886  hitchhiker  0.0035496 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0988  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3287  AraC family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 331 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1960  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0759  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0692  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 314 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4938  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 305 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  40.43 
 
 		 250 aa  73.9  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0848  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 361 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  33.64 
 
 		 513 aa  74.3  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  39.56 
 
 		 316 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 337 aa  73.9  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  43.02 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 353 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  37.19 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1931  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0129269  hitchhiker  0.0018191 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3240  putative transcriptional regulator  26.64 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1820  AraC family transcriptional regulator  24.01 
 
 		 284 aa  73.2  0.000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3997  transcriptional regulator  34.11 
 
 		 316 aa  72.8  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.564896  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4765  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 312 aa  72.8  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.485121  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1850  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 314 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.999636  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  30.3 
 
 		 331 aa  72.8  0.000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 		 265 aa  72.8  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1385  AraC family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1477  AraC family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 214 aa  72.8  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698473  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  34.78 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3056  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 344 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.351096  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 255 aa  72.4  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2465  AraC family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 313 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1993  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 508 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.04683  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0648  helix-turn-helix domain-containing protein  34.34 
 
 		 354 aa  72  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.369087 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  39.52 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2105  putative sigma54 specific transcriptional regulator  39.6 
 
 		 497 aa  71.6  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.619214  normal  0.0553697 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  31.68 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3759  AraC family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 320 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.831602  hitchhiker  0.00901781 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5835  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 326 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 154 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6202  AraC family transcriptional regulator  29.72 
 
 		 373 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724324 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4417  AraC family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756326  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5280  AraC family transcriptional regulator  26.39 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.910974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2221  transcriptional regulator  37.37 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0692  transcriptional regulator, AraC family  30.32 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  38.04 
 
 		 156 aa  71.6  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1919  AraC family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.480868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>