More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2465 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2465  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 313 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0193  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  75.08 
 
 		 305 aa  486  1e-136  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3735  AraC-like transcriptional regulator  65.99 
 
 		 302 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00901057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2738  AraC family transcriptional regulator  64.26 
 
 		 302 aa  394  1e-108  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0912908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3135  AraC family transcriptional regulator  63.23 
 
 		 302 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3240  putative transcriptional regulator  61.17 
 
 		 310 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38040  AraC family transcriptional regulator  60.48 
 
 		 329 aa  362  3e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.110886  hitchhiker  0.0035496 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2638  AraC family transcriptional regulator  56.4 
 
 		 315 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4465  AraC family transcriptional regulator  55.21 
 
 		 309 aa  330  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320825  normal  0.923094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1036  AraC family transcriptional regulator  56.66 
 
 		 306 aa  328  7e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.280924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4417  AraC family transcriptional regulator  58.36 
 
 		 306 aa  312  4.999999999999999e-84  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.756326  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1395  AraC family transcriptional regulator  57.73 
 
 		 306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4328  AraC-like transcriptional regulator  57.73 
 
 		 306 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3015  AraC-like transcriptional regulator  48.6 
 
 		 300 aa  272  6e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.451833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2814  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00480171  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4375  AraC-like transcriptional regulator  47.5 
 
 		 312 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3538  transcriptional regulator, AraC family  43.65 
 
 		 314 aa  261  6.999999999999999e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1091  putative AraC-type regulatory protein  47.69 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3127  AraC family transcriptional regulator  47.23 
 
 		 312 aa  259  5.0000000000000005e-68  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2251  AraC family transcription regulator  47.04 
 
 		 390 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0923  AraC family transcriptional regulator  47.04 
 
 		 327 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.139126  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1153  AraC family transcriptional regulator  47.04 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.922844  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1528  AraC family transcriptional regulator  47.04 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.836546  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1008  AraC family transcriptional regulator  47.04 
 
 		 325 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.351707  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0088  AraC family transcriptional regulator  47.04 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.90451  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0115  AraC family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 306 aa  255  5e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3981  transcriptional regulator, AraC family  45.32 
 
 		 311 aa  255  8e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1745  AraC family transcriptional regulator  47.42 
 
 		 331 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.334108  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3357  AraC family transcriptional regulator  45.05 
 
 		 303 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.784583  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0771  transcriptional regulator, AraC family  45.3 
 
 		 303 aa  249  3e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.594317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1890  AraC family transcriptional regulator  44.08 
 
 		 310 aa  249  5e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3759  AraC family transcriptional regulator  43.95 
 
 		 320 aa  248  9e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.831602  hitchhiker  0.00901781 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0864  AraC family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.13712 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0833  transcriptional regulator, AraC family  43.25 
 
 		 302 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0780  transcriptional regulator, AraC family  43.21 
 
 		 305 aa  242  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001029  transcriptional regulator  41.76 
 
 		 307 aa  242  5e-63  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2498  transcriptional regulator, AraC family  43.43 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0467728  normal  0.479782 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1054  AraC family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 311 aa  240  2e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.597722 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3237  AraC family transcriptional regulator  43.73 
 
 		 322 aa  238  6.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0111  AraC family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 320 aa  237  2e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00655283  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2755  transcriptional regulator, AraC family  42.16 
 
 		 302 aa  236  4e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.877904 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0164  transcriptional regulator, AraC family  45.17 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2576  AraC-like transcriptional regulator  43.88 
 
 		 313 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.289552 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1083  AraC family transcriptional regulator  44.33 
 
 		 314 aa  232  6e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0360  AraC family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 313 aa  229  6e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000460662  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1434  AraC family transcriptional regulator  41.44 
 
 		 312 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.458798  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3606  AraC-like transcriptional regulator  47.14 
 
 		 295 aa  227  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4209  AraC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 308 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.378308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1968  transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4732  AraC family transcriptional regulator  45.39 
 
 		 308 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.583037  normal  0.778769 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0625  transcription regulator protein  47.19 
 
 		 321 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6669  AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 338 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0360176  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5449  AraC family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 307 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0109166 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6190  AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.636005  normal  0.381887 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5825  AraC family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.667262  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0968  transcriptional regulator, AraC family  42.34 
 
 		 302 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3531  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 307 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4835  AraC family transcriptional regulator  43 
 
 		 307 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108272 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3941  AraC-like transcriptional regulator  40.96 
 
 		 303 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0722182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3775  AraC-like transcriptional regulator  41.2 
 
 		 318 aa  218  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.795213 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3202  AraC family transcriptional regulator  40.61 
 
 		 303 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.647622  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2598  transcriptional regulator, AraC family  43.96 
 
 		 320 aa  215  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5491  transcriptional regulator, AraC family  42.4 
 
 		 320 aa  216  5.9999999999999996e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2981  AraC family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.873527 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2712  AraC family transcriptional regulator  45.49 
 
 		 299 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.974943 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7736  AraC family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2599  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 315 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.39443 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2611  AraC family transcriptional regulator  41.96 
 
 		 299 aa  213  3.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0430862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2236  AraC family transcriptional regulator  40.75 
 
 		 272 aa  211  1e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1698  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 302 aa  211  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4483  AraC-like transcriptional regulator  39.16 
 
 		 336 aa  209  4e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000135378 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0694  transcriptional regulator, AraC family  42.49 
 
 		 303 aa  209  5e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.78426 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3397  transcriptional regulator, AraC family  44.11 
 
 		 311 aa  209  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.973047  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3052  AraC family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 298 aa  208  9e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6605  AraC family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 354 aa  207  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0589608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0723  AraC family transcriptional regulator  40.8 
 
 		 331 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.065718 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0109  AraC-like transcriptional regulator  42.39 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00170035  hitchhiker  0.00915457 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3720  transcriptional regulator, AraC family  36.81 
 
 		 296 aa  206  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.44403  normal  0.422333 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3330  AraC-like transcriptional regulator  41.67 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.537439 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2739  transcriptional regulator, AraC family  39.04 
 
 		 307 aa  206  6e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1453  AraC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 299 aa  205  9e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6202  AraC family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 373 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00724324 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5835  AraC family transcriptional regulator  40.73 
 
 		 326 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2474  AraC family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.446232  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6678  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 373 aa  203  3e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.41036  normal  0.11497 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5657  AraC family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 299 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760832 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2399  AraC family transcriptional regulator  40.6 
 
 		 323 aa  201  9.999999999999999e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.33789 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3546  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  37.45 
 
 		 302 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.137001 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4647  AraC family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 299 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.951834 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1820  AraC family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 284 aa  200  3e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3721  AraC family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 299 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0850692  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2738  AraC-type transcriptional regulator domain protein  39.86 
 
 		 330 aa  199  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2948  transcriptional regulator, AraC family  38.78 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0708341 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  38.35 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32460  transciption regulator, AraC-family  41.84 
 
 		 269 aa  196  4.0000000000000005e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1284  AraC family transcriptional regulator  33.22 
 
 		 297 aa  194  1e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.960401  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1163  AraC-type transcriptional regulator domain protein  35.98 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000040891  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1947  AraC-like transcriptional regulator  39.42 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2598  transcription regulator protein  38.49 
 
 		 299 aa  192  6e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3543  helix-turn-helix, AraC type:AraC-type transcriptional regulator, N-terminal  38.38 
 
 		 295 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0733434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>