More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B0599 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0599  transcriptional regulator  100 
 
 
326 aa  667    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  97.13 
 
 
314 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  97.13 
 
 
314 aa  625  1e-178  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  96.5 
 
 
314 aa  619  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  92.68 
 
 
314 aa  598  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4474  AraC family transcriptional regulator  94.59 
 
 
314 aa  594  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4999  AraC family transcriptional regulator  94.59 
 
 
314 aa  594  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0489  AraC family transcriptional regulator  78.8 
 
 
336 aa  518  1e-146  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0848  AraC family transcriptional regulator  78.8 
 
 
361 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2126  AraC family transcriptional regulator  78.8 
 
 
361 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1850  AraC family transcriptional regulator  78.34 
 
 
314 aa  518  1e-146  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.999636  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1960  AraC family transcriptional regulator  78.66 
 
 
314 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0988  AraC family transcriptional regulator  78.66 
 
 
314 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0759  AraC family transcriptional regulator  78.66 
 
 
314 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0692  AraC family transcriptional regulator  78.66 
 
 
314 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3287  AraC family transcriptional regulator  76.13 
 
 
331 aa  497  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4511  transcriptional regulator, AraC family  76.36 
 
 
341 aa  500  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88084  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0829  transcriptional regulator  76.53 
 
 
317 aa  498  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.351289 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71170  AraC family transcriptional regulator  63.87 
 
 
336 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6176  putative transcriptional regulator  64.19 
 
 
336 aa  410  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5229  transcriptional regulator  63.34 
 
 
314 aa  410  1e-113  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.35662  normal  0.0289181 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2915  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  61.01 
 
 
325 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0329  AraC family transcriptional regulator  61.86 
 
 
314 aa  397  1e-109  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4903  AraC family transcriptional regulator  60.19 
 
 
315 aa  390  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0305  AraC family transcriptional regulator  59.42 
 
 
319 aa  385  1e-106  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0325  AraC family transcriptional regulator  59.42 
 
 
315 aa  384  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0498  transcriptional regulator  59.35 
 
 
316 aa  376  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3170  transcriptional regulator  48.9 
 
 
327 aa  294  1e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0347  transcriptional regulator, AraC family  46.47 
 
 
322 aa  280  3e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  46.13 
 
 
368 aa  275  7e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  46.13 
 
 
368 aa  275  9e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  45.81 
 
 
368 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  44.69 
 
 
334 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  46.13 
 
 
368 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  46.56 
 
 
364 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  43.87 
 
 
337 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  43.87 
 
 
337 aa  272  6e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  44.83 
 
 
367 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  44.51 
 
 
367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  43.18 
 
 
368 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  45.16 
 
 
367 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  43.65 
 
 
353 aa  267  2e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  45.16 
 
 
367 aa  267  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  44.84 
 
 
367 aa  266  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  43.31 
 
 
331 aa  261  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1950  transcriptional regulator  45.31 
 
 
341 aa  261  2e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3487  AraC family transcriptional regulator  44.3 
 
 
332 aa  259  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.1866 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5090  AraC family transcriptional regulator  43.99 
 
 
332 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.893585 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0457  transcriptional regulator  43.67 
 
 
332 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.99008  normal  0.0292699 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4565  AraC family transcriptional regulator  43.99 
 
 
332 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.644708 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1111  AraC family transcriptional regulator  42.12 
 
 
339 aa  258  7e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000893396  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1931  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
332 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.746291  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0448  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
332 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5170  AraC family transcriptional regulator  43.67 
 
 
355 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0119945  normal  0.398909 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5109  AraC family transcriptional regulator  43.67 
 
 
332 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.771046  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3197  AraC family transcriptional regulator  43.67 
 
 
355 aa  257  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0901  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
332 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0566  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
332 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.207783  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2025  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
332 aa  256  3e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1868  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
332 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0968  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
332 aa  256  5e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  41.37 
 
 
334 aa  256  5e-67  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 
345 aa  254  1.0000000000000001e-66  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  42.41 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  43.04 
 
 
375 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1528  transcriptional regulator  41.67 
 
 
335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.755279  normal  0.310325 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  43.79 
 
 
344 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3942  AraC family transcriptional regulator  45.07 
 
 
336 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.466068  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3203  transcriptional regulator  45.07 
 
 
343 aa  252  6e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.123314  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4809  transcriptional regulator  44.51 
 
 
331 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.193614  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 
332 aa  251  1e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  40.71 
 
 
332 aa  249  3e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5086  AraC family transcriptional regulator  46.93 
 
 
371 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3282  AraC family transcriptional regulator  46.93 
 
 
371 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001535  transcriptional regulator AraC family  39.41 
 
 
318 aa  249  4e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  40.99 
 
 
339 aa  249  4e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5199  AraC family transcriptional regulator  46.93 
 
 
341 aa  249  5e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3545  AraC family transcriptional regulator  46.93 
 
 
341 aa  249  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0570  transcriptional regulator  46.93 
 
 
371 aa  249  6e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  42.07 
 
 
337 aa  248  7e-65  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02029  transcriptional regulator transcription regulator protein  44.19 
 
 
343 aa  247  2e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5023  AraC family transcriptional regulator  46.28 
 
 
341 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4498  AraC family transcriptional regulator  46.28 
 
 
340 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02043  transcriptional regulator transcription regulator protein  44.19 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4823  transcriptional regulator  44.98 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  43.46 
 
 
343 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2253  AraC family transcriptional regulator  39.5 
 
 
321 aa  244  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1586  transcriptional regulator  45.31 
 
 
333 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5062  transcriptional regulator, AraC family  45.31 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.652687  normal  0.0215007 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  43.46 
 
 
344 aa  243  3e-63  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1140  AraC family transcriptional regulator  42.32 
 
 
322 aa  243  3e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5693  transcriptional regulator, AraC family  40.76 
 
 
336 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.114959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  43.14 
 
 
343 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1869  AraC family transcriptional regulator  45.63 
 
 
341 aa  240  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3021  AraC family transcriptional regulator  39.88 
 
 
361 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.826436 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0469  AraC family transcriptional regulator  45.63 
 
 
369 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3448  AraC family transcriptional regulator  43.99 
 
 
325 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0711  AraC family transcriptional regulator  45.63 
 
 
341 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1980  AraC family transcriptional regulator  45.63 
 
 
341 aa  239  4e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433985  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0739  AraC family transcriptional regulator  45.63 
 
 
365 aa  239  5e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>