More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1950 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_1950  transcriptional regulator  100 
 
 		 341 aa  685    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1140  AraC family transcriptional regulator  55.95 
 
 		 322 aa  355  6.999999999999999e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1576  transcriptional regulator, AraC family  54.55 
 
 		 331 aa  311  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1937  transcriptional regulator, AraC family  52.61 
 
 		 331 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1655  ThiJ/PfpI domain-containing protein  52.88 
 
 		 332 aa  305  8.000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.491569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2367  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 311 aa  296  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.923255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5636  transcriptional regulator, AraC family  48.09 
 
 		 319 aa  291  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3312  AraC family transcriptional regulator  46.54 
 
 		 318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3933  AraC family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4903  AraC family transcriptional regulator  45.48 
 
 		 315 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.208419 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7234  transcriptional regulator, AraC family  47.64 
 
 		 297 aa  268  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0446957 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 368 aa  266  5e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0465  transcriptional regulator, AraC family  43.3 
 
 		 367 aa  266  5e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2664  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 368 aa  265  7e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0165303  normal  0.567946 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  42.95 
 
 		 368 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 368 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0305  AraC family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 319 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00276318 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4021  AraC family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 353 aa  264  1e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.322888  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6166  putative transcriptional regulator  43.37 
 
 		 367 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.165565  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5747  transcriptional regulator AraC family  43.31 
 
 		 317 aa  265  1e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.807364  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71070  AraC family transcriptional regulator  43.37 
 
 		 367 aa  264  1e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0325  AraC family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 315 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.416285 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4910  AraC family transcriptional regulator  47.3 
 
 		 388 aa  264  2e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.45379  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  42.99 
 
 		 367 aa  264  2e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 314 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 314 aa  263  3e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  42.63 
 
 		 368 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1100  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 334 aa  262  4.999999999999999e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0397278 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  42.68 
 
 		 367 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  45.31 
 
 		 314 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2915  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  44.26 
 
 		 325 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.904255  normal  0.163293 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0490  transcriptional regulator  42.32 
 
 		 364 aa  260  3e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5229  transcriptional regulator  44.26 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.35662  normal  0.0289181 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0987  transcriptional regulator  44.3 
 
 		 375 aa  256  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2922  transcriptional regulator  41.29 
 
 		 337 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1567  AraC family transcriptional regulator  41.29 
 
 		 337 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.226821  normal  0.377129 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3290  AraC family transcriptional regulator  45.4 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  44.01 
 
 		 314 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4999  AraC family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 314 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4474  AraC family transcriptional regulator  44.98 
 
 		 314 aa  255  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2488  AraC family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0329  AraC family transcriptional regulator  42.81 
 
 		 314 aa  253  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0599  transcriptional regulator  45.31 
 
 		 326 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3735  helix-turn-helix domain-containing protein  42.77 
 
 		 343 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.43988 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4511  transcriptional regulator, AraC family  44.81 
 
 		 341 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.88084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3394  transcriptional regulator, AraC family  40.26 
 
 		 334 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2444  transcriptional regulator  42.53 
 
 		 331 aa  251  1e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0668048  hitchhiker  0.000772272 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4030  transcriptional regulator, AraC family  42.44 
 
 		 343 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.364388 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0829  transcriptional regulator  43.83 
 
 		 317 aa  249  5e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.351289 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2126  AraC family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 361 aa  248  8e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3990  transcriptional regulator, AraC family  42.12 
 
 		 344 aa  248  8e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1270  transcriptional regulator  39.74 
 
 		 334 aa  248  9e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314543  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0848  AraC family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 361 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1960  AraC family transcriptional regulator  44.01 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0759  AraC family transcriptional regulator  44.01 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0988  AraC family transcriptional regulator  44.01 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0692  AraC family transcriptional regulator  44.01 
 
 		 314 aa  247  2e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71170  AraC family transcriptional regulator  43.42 
 
 		 336 aa  246  3e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0489  AraC family transcriptional regulator  44.01 
 
 		 336 aa  246  4e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1850  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 314 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.999636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6176  putative transcriptional regulator  43.09 
 
 		 336 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3287  AraC family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 331 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.242748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5109  AraC family transcriptional regulator  39.94 
 
 		 330 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0905505  normal  0.0237076 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2590  transcriptional regulator AraC family  37.74 
 
 		 337 aa  239  5e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001535  transcriptional regulator AraC family  37.62 
 
 		 318 aa  238  1e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1525  HTH-type transcriptional regulator  41.27 
 
 		 339 aa  238  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.199497 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 339 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3170  transcriptional regulator  43.32 
 
 		 327 aa  238  2e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1865  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 332 aa  236  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2821  transcriptional regulator  42.86 
 
 		 324 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0498  transcriptional regulator  41.83 
 
 		 316 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1319  AraC family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 332 aa  235  9e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2253  AraC family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 321 aa  232  8.000000000000001e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2406  transcriptional regulator, AraC family  36.99 
 
 		 339 aa  232  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0277312 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1111  AraC family transcriptional regulator  39.03 
 
 		 339 aa  229  4e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000893396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2152  transcriptional regulator, AraC family  36.68 
 
 		 340 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.49496 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2064  AraC family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 335 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.405224  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3665  AraC family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 401 aa  227  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  normal  0.253179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4061  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 401 aa  226  4e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.135508  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1794  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 338 aa  226  4e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112719  hitchhiker  0.00342809 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6285  AraC family transcriptional regulator  38.8 
 
 		 337 aa  222  7e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.716439 
 
 
-
 
NC_003296  RS02029  transcriptional regulator transcription regulator protein  40.52 
 
 		 343 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130887 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2234  AraC family transcriptional regulator  42.07 
 
 		 335 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.498713 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2238  AraC family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.390455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0347  transcriptional regulator, AraC family  39.47 
 
 		 322 aa  220  3e-56  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5693  transcriptional regulator, AraC family  37.58 
 
 		 336 aa  219  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.114959 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5086  AraC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 371 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.754601 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5199  AraC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 341 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3282  AraC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 371 aa  219  7e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3545  AraC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 341 aa  217  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1687  AraC family transcriptional regulator  37.09 
 
 		 345 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0447832  normal  0.915417 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0469  AraC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 369 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0739  AraC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0711  AraC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0570  transcriptional regulator  40.19 
 
 		 371 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1007  AraC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 365 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.809611  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3304  AraC family transcriptional regulator  40.97 
 
 		 338 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.176571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1980  AraC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 341 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.433985  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2105  AraC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 421 aa  216  4e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1869  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 341 aa  216  4e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>