More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_3482 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 299 aa  628  1e-179  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  39.08 
 
 		 291 aa  105  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  39.01 
 
 		 322 aa  100  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  47.66 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  41.46 
 
 		 291 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 309 aa  96.7  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 287 aa  95.9  6e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  40.65 
 
 		 291 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  29.29 
 
 		 304 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  40.71 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  45.28 
 
 		 303 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 287 aa  93.6  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  41.35 
 
 		 202 aa  93.6  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 293 aa  93.2  4e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 290 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 292 aa  93.2  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 311 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  34.36 
 
 		 293 aa  92.8  7e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 		 346 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  37.58 
 
 		 299 aa  92.4  8e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  45.19 
 
 		 312 aa  92  9e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  35.66 
 
 		 294 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 271 aa  92  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  28.95 
 
 		 293 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  36.48 
 
 		 287 aa  90.9  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 319 aa  90.1  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  34.64 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 678 aa  89.7  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  40.16 
 
 		 292 aa  89.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 223 aa  89  9e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 353 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 315 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 315 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 289 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 315 aa  88.2  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 291 aa  87.8  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 304 aa  88.2  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  35.62 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  35.62 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  41.51 
 
 		 296 aa  88.2  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 332 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 315 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  39.25 
 
 		 293 aa  87  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  37.9 
 
 		 291 aa  87  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 306 aa  87  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 322 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 307 aa  86.7  5e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 156 aa  86.3  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 291 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  28.51 
 
 		 289 aa  86.3  6e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 316 aa  85.5  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 251 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  45.92 
 
 		 144 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 176 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  40.2 
 
 		 282 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0731  AraC family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0743378  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  44 
 
 		 148 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2224  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 278 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575993  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9084  transcriptional regulator AraC family  38.46 
 
 		 315 aa  84  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 316 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  29.29 
 
 		 301 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  39.64 
 
 		 308 aa  83.2  0.000000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  34.93 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 361 aa  83.2  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  32.61 
 
 		 292 aa  82.8  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  31.21 
 
 		 296 aa  82.8  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  25.35 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  25.35 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  25.35 
 
 		 287 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  25.35 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1303  transcriptional regulator, AraC family  37.74 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.239353  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 304 aa  82.4  0.000000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 168 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  29.44 
 
 		 295 aa  82.4  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 306 aa  82.4  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6279  AraC family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.147886  normal  0.656807 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  34.62 
 
 		 310 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0816  AraC family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 319 aa  81.3  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 182 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  40.4 
 
 		 141 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  29.44 
 
 		 288 aa  80.5  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  29.8 
 
 		 318 aa  80.5  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  42.99 
 
 		 150 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  43.75 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  32.94 
 
 		 297 aa  79.7  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 295 aa  79.7  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>