More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1993 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_1993  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 508 aa  1060    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.04683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3020  histidine kinase  30.73 
 
 		 631 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000249854  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 300 aa  86.7  8e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  40.71 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0450  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 285 aa  85.1  0.000000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0724332  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  33.87 
 
 		 537 aa  84  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2718  two component transcriptional regulator, AraC family  42 
 
 		 259 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  27.23 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2291  transcriptional regulator, AraC family  32.52 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 301 aa  77  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000994716  hitchhiker  0.0000611237 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 517 aa  77  0.0000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  35.29 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  32.04 
 
 		 530 aa  75.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 304 aa  74.7  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0441  transcriptional regulator  41.18 
 
 		 188 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.586724  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5909  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 		 291 aa  74.3  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2113  two component transcriptional regulator, AraC family  32.37 
 
 		 538 aa  74.3  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.141697  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  38.54 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6879  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0489024  normal  0.393248 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  32.03 
 
 		 301 aa  73.9  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0851  AraC family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 316 aa  73.6  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5711  hypothetical protein  36.84 
 
 		 558 aa  73.6  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.739198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 302 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 513 aa  73.2  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 316 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 269 aa  72  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2914  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 318 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  43.3 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 291 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  37.76 
 
 		 291 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  34.4 
 
 		 295 aa  71.2  0.00000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  34.02 
 
 		 331 aa  70.5  0.00000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 291 aa  70.5  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5122  transcriptional regulator AraC family  33.67 
 
 		 314 aa  70.5  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.962416  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 204 aa  70.5  0.00000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1862  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5736  transcriptional regulator, AraC family  39.29 
 
 		 315 aa  70.1  0.00000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.756773 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1140  AraC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 258 aa  70.1  0.00000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  37.63 
 
 		 291 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7695  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 324 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4617  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 		 296 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107807 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 306 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 306 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15370  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  33 
 
 		 415 aa  69.7  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 286 aa  69.7  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3657  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 306 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0803  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 311 aa  70.1  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 311 aa  69.7  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 277 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2180  helix-turn-helix domain-containing protein  35.35 
 
 		 281 aa  69.7  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.971115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  30.93 
 
 		 760 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1553  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 331 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.741987 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 274 aa  68.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5716  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 304 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2033  transcriptional regulator, AraC family  32.06 
 
 		 267 aa  69.3  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 515 aa  68.6  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5827  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5610  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 302 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00190409  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1497  helix-turn-helix domain-containing protein  36.05 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.956503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 281 aa  69.3  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3164  two component AraC family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 544 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0633186  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  36.11 
 
 		 306 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0219  helix-turn-helix domain-containing protein  28.19 
 
 		 293 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.882333  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 277 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0771  two component AraC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 355 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000862622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  27.75 
 
 		 273 aa  68.6  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.88 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 154 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 291 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3104  AraC family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  33.33 
 
 		 529 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0402  transcriptional regulator, AraC family  37.29 
 
 		 311 aa  68.2  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3405  two component AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 253 aa  68.2  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.100445  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  38 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  31.88 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2356  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4871  AraC family transcriptional regulator  38.04 
 
 		 308 aa  67.4  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412804  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  37 
 
 		 303 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4820  AraC family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 274 aa  67.4  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  36.46 
 
 		 306 aa  67  0.0000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0555  AraC family DNA-binding response regulator  32.35 
 
 		 529 aa  67.4  0.0000000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 287 aa  67  0.0000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 301 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2113  two component AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 548 aa  67  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  32.35 
 
 		 292 aa  67  0.0000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2726  ATP-binding region ATPase domain protein  31.39 
 
 		 1355 aa  67  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.119041  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1428  transcriptional regulator, AraC family  32.46 
 
 		 285 aa  67  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  35.35 
 
 		 261 aa  67  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3021  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 361 aa  67  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.826436 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  32.32 
 
 		 544 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  34.38 
 
 		 301 aa  67  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0525  two component AraC family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 522 aa  66.6  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>