More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0441 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0441  transcriptional regulator  100 
 
 		 188 aa  378  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.586724  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0450  AraC family transcriptional regulator  48.6 
 
 		 285 aa  214  7e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0724332  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2476  transcriptional regulator, AraC family  46.99 
 
 		 286 aa  77  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 303 aa  75.1  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1993  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 508 aa  75.1  0.0000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.04683  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0803  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  45.57 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2167  AraC family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 261 aa  70.1  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.241927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  32.11 
 
 		 1366 aa  70.1  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2825  helix-turn-helix domain-containing protein  37.27 
 
 		 320 aa  68.9  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00154924  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3170  transcriptional regulator, AraC family  30.1 
 
 		 332 aa  68.6  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.777646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2508  transcriptional regulator  29.08 
 
 		 336 aa  68.2  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.207874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2739  transcriptional regulator, AraC family  39.24 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3697  two component AraC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 517 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000611836  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  40 
 
 		 330 aa  66.6  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1799  AraC family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 299 aa  67  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000057295  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4250  transcriptional regulator, AraC family  38.37 
 
 		 311 aa  65.5  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2723  AraC family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 273 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0671245 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.33 
 
 		 1396 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0117  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 281 aa  65.1  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3986  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  40.22 
 
 		 289 aa  65.1  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.542106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3150  AraC family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4747  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 320 aa  64.7  0.0000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2943  helix-turn-helix domain-containing protein  45.33 
 
 		 307 aa  64.7  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0314532  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3895  helix-turn-helix domain-containing protein  38.1 
 
 		 282 aa  64.7  0.0000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2960  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 306 aa  64.7  0.0000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0210112 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  28.68 
 
 		 291 aa  64.3  0.0000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3041  AraC family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 313 aa  64.7  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1288  AraC family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 299 aa  64.3  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0436335  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3555  AraC family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.152356 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0324  AraC family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 383 aa  63.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.645662 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2712  helix-turn-helix domain-containing protein  36.84 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.741725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1840  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 271 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000248404 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3282  helix-turn-helix domain-containing protein  39.51 
 
 		 307 aa  63.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0709  AraC family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2291  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4788  AraC family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 344 aa  62.8  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.139915  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4679  transcriptional regulator, AraC family  40.74 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603206  hitchhiker  0.000201737 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0254  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.215368  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2287  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  31.78 
 
 		 329 aa  62.8  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 537 aa  62.8  0.000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0815  AraC family transcriptional regulator  40.48 
 
 		 275 aa  62.4  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.224567  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5726  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 323 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.435974  normal  0.869518 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1500  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 		 319 aa  62.4  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.546441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2321  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 317 aa  62  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.612609 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1862  transcriptional regulator, AraC family  35.87 
 
 		 300 aa  62  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0123  conserved hypothetical protein, putative transcriptional regulator (AraC family)  36.71 
 
 		 292 aa  62  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.855779  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 306 aa  62  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1968  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 321 aa  62  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1744  AraC-like transcriptional regulator  29.94 
 
 		 299 aa  61.6  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00012602  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1633  AraC family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 386 aa  61.6  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2914  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 318 aa  61.2  0.000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1490  AraC family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.107689  normal  0.0449823 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4346  transcriptional regulator, AraC family  33.94 
 
 		 326 aa  61.6  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324951  normal  0.0157196 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  37.11 
 
 		 309 aa  61.2  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  29.06 
 
 		 299 aa  61.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 299 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  33.33 
 
 		 255 aa  61.2  0.000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0827  AraC family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 292 aa  61.2  0.000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000316121  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 313 aa  61.2  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  31.03 
 
 		 312 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0720  AraC family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 326 aa  61.2  0.000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000016714 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  35.9 
 
 		 296 aa  61.2  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6783  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4277  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 315 aa  60.5  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.421015 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  34.55 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12290  Transcriptional regulator, AraC family  33.03 
 
 		 325 aa  60.5  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4443  transcriptional activator RhaS  37.33 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6479  AraC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0252403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 304 aa  60.5  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3237  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0744536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7240  AraC family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321623  normal  0.193055 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3318  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4083  AraC family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0474473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7040  AraC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 323 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.165812  normal  0.300758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5702  transcriptional regulator, AraC family  38.27 
 
 		 319 aa  60.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.946416 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2496  helix-turn-helix domain-containing protein  34.94 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0383135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2719  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 276 aa  60.5  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.894112  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0860  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 348 aa  60.5  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1452  AraC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6376  AraC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 323 aa  60.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 332 aa  60.8  0.00000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4112  transcriptional activator RhaS  36 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 270 aa  60.1  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1585  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 		 350 aa  60.1  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4297  transcriptional activator RhaS  36 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.082999 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0309  transcriptional regulator  27.68 
 
 		 320 aa  59.7  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4135  transcriptional activator RhaS  36 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 		 322 aa  60.1  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2306  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 291 aa  59.7  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.80153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5377  AraC family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.579005  normal  0.811497 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2481  AraC family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 279 aa  60.5  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0594391  normal  0.9784 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4483  AraC-like transcriptional regulator  36.71 
 
 		 336 aa  60.1  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000135378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1330  transcriptional regulator, AraC family  39.53 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.521973  normal  0.989615 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>