More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4820 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4820  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 274 aa  566  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0166  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 284 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4722  AraC family transcriptional regulator  32.25 
 
 		 285 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1299  AraC family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.736083 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0667  helix-turn-helix domain-containing protein  32.01 
 
 		 297 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.145223  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3295  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 		 285 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3708  AraC family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3718  AraC family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 305 aa  125  1e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0847  AraC family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 280 aa  122  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6066  transcriptional regulator, AraC family  29.3 
 
 		 289 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  24.81 
 
 		 302 aa  80.5  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  40.21 
 
 		 261 aa  80.1  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 316 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 361 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 154 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 261 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  24.32 
 
 		 300 aa  77.4  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0758  AraC family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 278 aa  75.1  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  27.12 
 
 		 296 aa  74.3  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 281 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  34.86 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3557  AraC family transcriptional regulator  28.96 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  29.09 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  34.91 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 290 aa  72  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 266 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  33.66 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2950  transcriptional regulator, AraC family  28.37 
 
 		 268 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0105763  normal  0.912836 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 292 aa  70.5  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 112 aa  70.1  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  30.77 
 
 		 308 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1477  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.000537918  unclonable  0.00000296813 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 306 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5154  helix-turn-helix domain-containing protein  39.05 
 
 		 120 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5244  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 337 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0526  transcriptional regulator, AraC family  39.29 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000198595  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  29.79 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 133 aa  68.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4119  transcriptional regulator, AraC family  34.29 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.840918  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2987  transcriptional regulator fragment  30.61 
 
 		 111 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1494  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 150 aa  68.6  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0228  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 123 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.654381 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1862  transcriptional regulator, AraC family  33.61 
 
 		 300 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 204 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2911  transcriptional regulator, AraC family  23.85 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3221  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7250  transcriptional regulator AraC family  32.41 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.76914  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3231  transcriptional regulator, AraC family  24.57 
 
 		 250 aa  67.8  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  29.81 
 
 		 297 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  29.81 
 
 		 272 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  31.07 
 
 		 302 aa  67.4  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2914  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  31.91 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.431589  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3702  transcriptional regulator, AraC type  30.48 
 
 		 308 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1993  transcriptional regulator, AraC family  30.97 
 
 		 508 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.04683  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  43.37 
 
 		 144 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2431  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  27.86 
 
 		 294 aa  67.4  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.690566  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0224  response regulator receiver protein  32.08 
 
 		 537 aa  67  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  34.34 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 318 aa  66.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2914  AraC family transcriptional regulator  41.25 
 
 		 318 aa  66.2  0.0000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  39.08 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 286 aa  66.6  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 168 aa  66.6  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2883  AraC family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 307 aa  65.9  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0577  AraC family transcriptional regulator  33.56 
 
 		 313 aa  66.2  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0771  AraC family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 288 aa  66.2  0.0000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.472166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  33.94 
 
 		 306 aa  65.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  22.81 
 
 		 301 aa  65.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000994716  hitchhiker  0.0000611237 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0816  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 319 aa  65.5  0.0000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4842  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 337 aa  65.9  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.195064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2657  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 269 aa  65.5  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 1201 aa  65.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3022  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2380  transcriptional regulator, AraC family  39.33 
 
 		 300 aa  64.7  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0838291  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0883  AraC family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.172871 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  30.77 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1946  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 282 aa  65.1  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.609227  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  39.08 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2642  transcriptional regulator, AraC family  31.91 
 
 		 198 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194016 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1757  transcriptional regulator, AraC family  23.43 
 
 		 278 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000137432  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3367  AraC family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0586  AraC family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 276 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3537  AraC family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 276 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  30.28 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  31.31 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4098  AraC family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424275 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0574  AraC family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0798057  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1212  transcriptional regulator, AraC-family  24.71 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>