More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1284 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 168 aa  348  2e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  54.1 
 
 		 162 aa  133  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  48.44 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  38.73 
 
 		 156 aa  110  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  45.16 
 
 		 168 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  45.83 
 
 		 141 aa  102  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  44.72 
 
 		 157 aa  102  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  43.59 
 
 		 158 aa  101  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  38.52 
 
 		 145 aa  101  5e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  36.67 
 
 		 134 aa  99.4  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  45 
 
 		 513 aa  97.4  9e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 150 aa  95.9  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  43.97 
 
 		 144 aa  95.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  47.17 
 
 		 150 aa  94.4  7e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  50.52 
 
 		 145 aa  93.2  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 150 aa  92  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 146 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 146 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  40.83 
 
 		 146 aa  91.3  5e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  40.83 
 
 		 140 aa  91.3  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  47.12 
 
 		 147 aa  90.9  8e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  39.67 
 
 		 144 aa  90.5  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  38.52 
 
 		 164 aa  90.1  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  43.48 
 
 		 139 aa  90.1  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  40.17 
 
 		 153 aa  89.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  47 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  39.85 
 
 		 156 aa  89  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  41.74 
 
 		 148 aa  89  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  45 
 
 		 145 aa  89  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 153 aa  88.2  4e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  42.61 
 
 		 160 aa  88.6  4e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 		 144 aa  88.6  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  36.88 
 
 		 176 aa  88.2  5e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 142 aa  87.8  6e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  40.68 
 
 		 168 aa  87.8  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 156 aa  87.8  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  50.56 
 
 		 148 aa  87.8  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  45.83 
 
 		 151 aa  86.7  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 282 aa  86.7  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  46.24 
 
 		 309 aa  86.3  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  39.64 
 
 		 278 aa  85.9  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  39.83 
 
 		 168 aa  86.3  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  40.57 
 
 		 112 aa  85.5  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  40.57 
 
 		 133 aa  85.1  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 		 148 aa  85.1  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 154 aa  84.7  5e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 155 aa  83.6  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 147 aa  83.6  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  45.26 
 
 		 149 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  42.59 
 
 		 147 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  44 
 
 		 143 aa  82.8  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  39.39 
 
 		 331 aa  82  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  41.24 
 
 		 291 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  44.9 
 
 		 147 aa  81.6  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  48.35 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  41.94 
 
 		 291 aa  80.5  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  37.82 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  39.17 
 
 		 182 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 285 aa  79.7  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 274 aa  79  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  31.93 
 
 		 300 aa  78.6  0.00000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  36.63 
 
 		 297 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  40.37 
 
 		 322 aa  79  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5551  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 133 aa  78.6  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 293 aa  77.8  0.00000000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  39.05 
 
 		 297 aa  77.4  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  35.24 
 
 		 272 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 261 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  35.71 
 
 		 515 aa  77  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  34.58 
 
 		 296 aa  77.4  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 338 aa  75.9  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0516  PAS sensor protein  31.25 
 
 		 255 aa  75.9  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 322 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  41.94 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 291 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2987  transcriptional regulator fragment  35.16 
 
 		 111 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1494  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2914  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  33.33 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.431589  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3221  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 198 aa  75.5  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 293 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 302 aa  75.5  0.0000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  39.78 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7695  transcriptional regulator  35.92 
 
 		 324 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.529732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2380  transcriptional regulator, AraC family  39.78 
 
 		 300 aa  74.7  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0838291  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  37.63 
 
 		 255 aa  74.3  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2642  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 198 aa  73.9  0.0000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000194016 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 204 aa  74.3  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  41 
 
 		 134 aa  74.3  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 306 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  31.97 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 		 250 aa  73.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  35.96 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  30.21 
 
 		 287 aa  73.9  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>