More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6338 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
145 aa  296  6e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  86.33 
 
 
141 aa  246  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  71.74 
 
 
146 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  71.74 
 
 
146 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  71.74 
 
 
146 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  69.12 
 
 
154 aa  188  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  68.89 
 
 
144 aa  186  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  67.65 
 
 
148 aa  182  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  66.43 
 
 
150 aa  181  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  70.68 
 
 
139 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  70.4 
 
 
147 aa  179  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  66.67 
 
 
147 aa  177  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  69.85 
 
 
156 aa  176  1e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  68.8 
 
 
148 aa  174  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  67.97 
 
 
147 aa  172  9.999999999999999e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  62.32 
 
 
160 aa  170  6.999999999999999e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  71.79 
 
 
150 aa  169  7.999999999999999e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  63.04 
 
 
143 aa  169  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  68.55 
 
 
147 aa  169  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  73.11 
 
 
144 aa  169  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  68.85 
 
 
149 aa  167  4e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  63.04 
 
 
156 aa  167  6e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  66.12 
 
 
153 aa  163  9e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  64.46 
 
 
151 aa  163  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  63.49 
 
 
155 aa  159  8.000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  70.59 
 
 
148 aa  159  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  65.15 
 
 
147 aa  153  8e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  63.21 
 
 
134 aa  134  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2622  AraC family transcriptional regulator  74.71 
 
 
144 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  63.11 
 
 
142 aa  127  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  54.81 
 
 
148 aa  127  6e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  60.87 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  53.38 
 
 
158 aa  119  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  52.03 
 
 
150 aa  118  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  52.63 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  47.93 
 
 
164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  52.99 
 
 
168 aa  108  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  47.11 
 
 
144 aa  106  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  44.62 
 
 
153 aa  105  2e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  43.94 
 
 
164 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  44.52 
 
 
162 aa  104  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  43.22 
 
 
156 aa  103  9e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  46.09 
 
 
150 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  46.09 
 
 
150 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  46.09 
 
 
150 aa  103  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  44.96 
 
 
168 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  44.88 
 
 
182 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  44.96 
 
 
168 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  46.28 
 
 
144 aa  101  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 
140 aa  100  8e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  44.17 
 
 
168 aa  98.6  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  45.6 
 
 
176 aa  98.2  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  47.47 
 
 
250 aa  86.7  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 
299 aa  85.5  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  44.33 
 
 
297 aa  85.5  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 
265 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  36.09 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0874  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
296 aa  84.3  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 
299 aa  84  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  42.98 
 
 
255 aa  83.6  8e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  41.3 
 
 
281 aa  82  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  35.85 
 
 
204 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  39.22 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 
513 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  41.84 
 
 
292 aa  79.7  0.00000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
304 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  38.98 
 
 
261 aa  77.8  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  35.34 
 
 
134 aa  77.8  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  40.78 
 
 
112 aa  77.4  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6385  transcriptional regulator, AraC family  44.33 
 
 
256 aa  76.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00774423 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  40.78 
 
 
133 aa  76.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 
306 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  38.78 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 
311 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  38.14 
 
 
291 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  41.76 
 
 
261 aa  74.7  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 
299 aa  73.9  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
291 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 
311 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 
300 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 
311 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 
290 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 
291 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 
311 aa  73.6  0.0000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 
293 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
291 aa  73.6  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5508  helix-turn-helix domain-containing protein  34.48 
 
 
158 aa  72.8  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4871  AraC family transcriptional regulator  45.05 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412804  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  41.24 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  37.11 
 
 
291 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0401  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  40.62 
 
 
255 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 
327 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2162  transcriptional regulator, AraC family  40.38 
 
 
284 aa  72.4  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.637504 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 
322 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  34.34 
 
 
293 aa  72  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  37.27 
 
 
250 aa  71.6  0.000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
293 aa  72  0.000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.949603 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>