More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1736 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
146 aa  297  3e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
146 aa  297  3e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
146 aa  297  3e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  78.26 
 
 
139 aa  224  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  78.68 
 
 
147 aa  218  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  75.91 
 
 
160 aa  213  8e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  77.78 
 
 
149 aa  207  3e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  75.56 
 
 
150 aa  207  5e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  75.97 
 
 
151 aa  206  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  72.99 
 
 
148 aa  206  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  71.63 
 
 
156 aa  206  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  80 
 
 
147 aa  205  2e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  74.81 
 
 
147 aa  203  8e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  65.71 
 
 
143 aa  198  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  71.01 
 
 
141 aa  197  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  75.59 
 
 
148 aa  197  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  78.99 
 
 
153 aa  197  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  75 
 
 
147 aa  194  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  71.22 
 
 
156 aa  190  4e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  74.63 
 
 
144 aa  187  4e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  78.03 
 
 
147 aa  187  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  69.34 
 
 
145 aa  184  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  78.69 
 
 
148 aa  179  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  71.31 
 
 
155 aa  177  5.999999999999999e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  59.7 
 
 
154 aa  158  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  59.7 
 
 
144 aa  155  2e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2622  AraC family transcriptional regulator  82.02 
 
 
144 aa  152  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  67.57 
 
 
134 aa  151  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  63.96 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  57.14 
 
 
142 aa  120  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  47.59 
 
 
148 aa  118  1.9999999999999998e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  47.2 
 
 
150 aa  117  4.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  49.26 
 
 
145 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  44.22 
 
 
157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  45.9 
 
 
156 aa  110  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  44.72 
 
 
164 aa  110  7.000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  46.28 
 
 
150 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  46.28 
 
 
150 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  46.28 
 
 
150 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  43.7 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  42.98 
 
 
144 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  43.94 
 
 
158 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  44.53 
 
 
164 aa  104  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  43.09 
 
 
144 aa  103  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  48.21 
 
 
168 aa  103  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  42.97 
 
 
153 aa  101  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 
168 aa  100  6e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 
168 aa  100  7e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  42.4 
 
 
176 aa  97.4  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 
182 aa  92.8  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 
162 aa  93.2  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  40.83 
 
 
168 aa  91.3  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  42.57 
 
 
145 aa  88.6  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  36.11 
 
 
204 aa  84.3  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  43.56 
 
 
322 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  47.92 
 
 
292 aa  83.2  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0874  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 
296 aa  81.3  0.000000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 
513 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  33.9 
 
 
134 aa  80.1  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  40.2 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  43.56 
 
 
281 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  39.62 
 
 
133 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  39.62 
 
 
112 aa  77.8  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 
306 aa  77.4  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  38.24 
 
 
287 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  38.24 
 
 
301 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 
297 aa  76.6  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 
281 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 
281 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  40.7 
 
 
250 aa  74.7  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  41.24 
 
 
255 aa  74.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 
277 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
301 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  35.71 
 
 
291 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 
301 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  29.09 
 
 
286 aa  73.9  0.0000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 
299 aa  73.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
304 aa  73.9  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4704  putative DNA-binding protein  35.19 
 
 
274 aa  73.6  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000153171  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  33.98 
 
 
318 aa  73.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  41.41 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 
291 aa  72.8  0.000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  37.37 
 
 
309 aa  73.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  36 
 
 
327 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  37.37 
 
 
331 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  41.76 
 
 
255 aa  72.4  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4467  AraC family transcriptional regulator  35.29 
 
 
301 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
320 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 
287 aa  72.8  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
316 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  32.35 
 
 
298 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 
291 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  37.04 
 
 
301 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4495  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 
340 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  35.92 
 
 
544 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 
316 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  37.76 
 
 
324 aa  71.2  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  32.73 
 
 
305 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
299 aa  71.2  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  32 
 
 
282 aa  70.9  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>