More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2345 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 148 aa  298  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  81.43 
 
 		 139 aa  230  5e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  82.48 
 
 		 147 aa  221  3e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  85.38 
 
 		 156 aa  219  7e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  78.17 
 
 		 146 aa  215  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  78.17 
 
 		 146 aa  215  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  78.17 
 
 		 146 aa  215  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  79.56 
 
 		 150 aa  210  4.9999999999999996e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  75.37 
 
 		 160 aa  209  1e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  75.56 
 
 		 143 aa  208  2e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  80 
 
 		 147 aa  205  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  72.73 
 
 		 156 aa  205  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  73.38 
 
 		 148 aa  204  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  78.63 
 
 		 149 aa  204  4e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  80.71 
 
 		 144 aa  200  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  78.29 
 
 		 148 aa  200  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  76.8 
 
 		 147 aa  197  5e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  74.07 
 
 		 147 aa  195  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  73.28 
 
 		 151 aa  191  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  76.23 
 
 		 153 aa  192  2e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  76.09 
 
 		 147 aa  182  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  68.09 
 
 		 141 aa  179  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  67.36 
 
 		 145 aa  179  2e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  73.5 
 
 		 155 aa  172  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  72.73 
 
 		 134 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  62.31 
 
 		 144 aa  157  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  63.08 
 
 		 154 aa  156  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2622  AraC family transcriptional regulator  85.39 
 
 		 144 aa  151  4e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  62.5 
 
 		 150 aa  136  8.999999999999999e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  55.65 
 
 		 142 aa  128  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  52.17 
 
 		 157 aa  118  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  47.97 
 
 		 150 aa  115  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  48.82 
 
 		 158 aa  113  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  53.04 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  50.39 
 
 		 145 aa  110  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  44 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  44.26 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  52.25 
 
 		 168 aa  109  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  46.28 
 
 		 150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  44.54 
 
 		 140 aa  107  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  46.3 
 
 		 156 aa  107  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  44.09 
 
 		 168 aa  107  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  43.8 
 
 		 144 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  44.09 
 
 		 168 aa  106  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  45.6 
 
 		 176 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  53.66 
 
 		 162 aa  104  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  44.63 
 
 		 144 aa  103  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 182 aa  101  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 		 153 aa  95.5  2e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 168 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  46.08 
 
 		 145 aa  88.2  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  47.06 
 
 		 322 aa  87  7e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  44 
 
 		 299 aa  83.6  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 306 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 		 112 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 		 133 aa  82.4  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  37.07 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  39.05 
 
 		 513 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  37.84 
 
 		 250 aa  80.1  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 327 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  40.78 
 
 		 300 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 204 aa  78.2  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 293 aa  78.2  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  48.1 
 
 		 292 aa  77.8  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  36.73 
 
 		 291 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 311 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 291 aa  77  0.00000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  40.38 
 
 		 287 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 311 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 311 aa  76.6  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0874  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 296 aa  77  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1456  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 320 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1484  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 290 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 		 289 aa  76.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  40.38 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 301 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 312 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  33.93 
 
 		 298 aa  75.9  0.0000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  41.24 
 
 		 292 aa  75.9  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 291 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  36.19 
 
 		 306 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 291 aa  74.7  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 299 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 		 291 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 291 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 309 aa  73.9  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 281 aa  74.3  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 304 aa  73.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 301 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  37.17 
 
 		 265 aa  73.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  39.8 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 305 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  39.18 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 304 aa  73.2  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  38.83 
 
 		 301 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  37.25 
 
 		 346 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>