More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0584 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  100 
 
 
164 aa  323  5e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  68.79 
 
 
144 aa  201  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  69.39 
 
 
150 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  69.39 
 
 
150 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  69.39 
 
 
150 aa  199  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  73.85 
 
 
150 aa  192  2e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  69.57 
 
 
140 aa  192  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  60.42 
 
 
144 aa  171  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  50.81 
 
 
145 aa  121  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  47.11 
 
 
141 aa  117  6e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  49.18 
 
 
144 aa  115  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 
157 aa  114  6.9999999999999995e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  45.08 
 
 
148 aa  110  6e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  46.72 
 
 
145 aa  110  7.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  49.18 
 
 
154 aa  110  8.000000000000001e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  44.72 
 
 
146 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  44.72 
 
 
146 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 
143 aa  110  9e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  44.72 
 
 
146 aa  110  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  45.69 
 
 
148 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  41.98 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  44 
 
 
150 aa  107  6e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  45.69 
 
 
147 aa  107  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  42.74 
 
 
149 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  44.63 
 
 
156 aa  107  9.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  42.74 
 
 
151 aa  107  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  48.06 
 
 
150 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  43.8 
 
 
139 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  42.62 
 
 
147 aa  104  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  40.56 
 
 
160 aa  104  6e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  45.97 
 
 
176 aa  103  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  42.42 
 
 
164 aa  103  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  44.26 
 
 
147 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  42.24 
 
 
153 aa  101  4e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  42.62 
 
 
156 aa  101  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
182 aa  99.4  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  42.54 
 
 
168 aa  99.8  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 
148 aa  99.4  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  41.38 
 
 
148 aa  98.6  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  40.52 
 
 
147 aa  99  3e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  39.53 
 
 
155 aa  99  3e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  40.52 
 
 
142 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  42.54 
 
 
168 aa  98.2  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  43.64 
 
 
144 aa  97.4  8e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  42.61 
 
 
168 aa  96.7  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  40.8 
 
 
162 aa  93.6  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  42.73 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  38.52 
 
 
168 aa  90.1  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  43.55 
 
 
153 aa  90.1  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  43.88 
 
 
134 aa  90.1  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  38.35 
 
 
145 aa  89.7  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  40.94 
 
 
158 aa  89  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 
134 aa  87.4  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  45.83 
 
 
261 aa  86.7  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  46.88 
 
 
281 aa  86.3  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 
306 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  41 
 
 
303 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  43.69 
 
 
299 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  37.04 
 
 
291 aa  81.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  37.74 
 
 
291 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2622  AraC family transcriptional regulator  46.34 
 
 
144 aa  80.5  0.00000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 
291 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0677  transposon Tn10 TetD protein  40 
 
 
113 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198694  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0620  transposon Tn10 TetD protein  40 
 
 
113 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  40 
 
 
113 aa  79  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 
291 aa  78.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
304 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  41.18 
 
 
299 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  41.12 
 
 
250 aa  77.8  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
291 aa  77.8  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 
291 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 
327 aa  77  0.00000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 
316 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  39.8 
 
 
322 aa  76.6  0.0000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
304 aa  77  0.0000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 
311 aa  77  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 
307 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  41.57 
 
 
255 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5508  helix-turn-helix domain-containing protein  35.25 
 
 
158 aa  77  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 
299 aa  75.9  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  40.78 
 
 
306 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0693  transposon Tn10 TetD protein  38.95 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 
311 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 
290 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0634  transposon Tn10 TetD protein  38.95 
 
 
113 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  35.92 
 
 
678 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 
296 aa  75.5  0.0000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1509  transcriptional regulator AraC family  36.79 
 
 
284 aa  75.1  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  37.86 
 
 
316 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 
315 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  36.46 
 
 
291 aa  75.1  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 
315 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 
315 aa  75.1  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 
291 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  36.84 
 
 
293 aa  74.7  0.0000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 
319 aa  74.3  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 
291 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>