More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_1762 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 155 aa  308  2e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  74.8 
 
 		 147 aa  192  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  72.44 
 
 		 139 aa  191  2e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  69.06 
 
 		 147 aa  191  3e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  72.66 
 
 		 160 aa  190  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  73.28 
 
 		 150 aa  190  8e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  69.34 
 
 		 146 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  69.34 
 
 		 146 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  69.34 
 
 		 146 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  66.67 
 
 		 148 aa  187  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  62.32 
 
 		 143 aa  184  4e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  71.09 
 
 		 156 aa  184  4e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  73.95 
 
 		 149 aa  184  4e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  73.28 
 
 		 147 aa  182  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  74.58 
 
 		 151 aa  182  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  71.94 
 
 		 153 aa  177  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  69.83 
 
 		 147 aa  175  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  65.93 
 
 		 156 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  71.55 
 
 		 148 aa  173  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  73.64 
 
 		 147 aa  169  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  61.59 
 
 		 141 aa  166  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  69.77 
 
 		 144 aa  166  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  62.77 
 
 		 145 aa  161  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  72.32 
 
 		 148 aa  158  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  62.4 
 
 		 144 aa  149  1e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  57.25 
 
 		 154 aa  149  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  66.96 
 
 		 134 aa  143  7.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  59.68 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2622  AraC family transcriptional regulator  54.67 
 
 		 144 aa  137  7e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  55.17 
 
 		 148 aa  121  3e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  55.36 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  48.57 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  48.8 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  47.54 
 
 		 145 aa  109  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  45.32 
 
 		 150 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  41.98 
 
 		 156 aa  107  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  53.27 
 
 		 158 aa  105  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  44.93 
 
 		 176 aa  104  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  44.27 
 
 		 164 aa  104  6e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  41.84 
 
 		 168 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  39.55 
 
 		 164 aa  102  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  41.84 
 
 		 168 aa  101  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  50.46 
 
 		 168 aa  101  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  42.62 
 
 		 144 aa  100  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  40.15 
 
 		 140 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  40.88 
 
 		 144 aa  97.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 182 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  49.07 
 
 		 162 aa  93.6  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  41.8 
 
 		 153 aa  93.2  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 168 aa  88.2  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 299 aa  79  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 145 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 306 aa  77.4  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0874  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 296 aa  77.4  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  39.8 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  39.8 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  36.23 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  31.82 
 
 		 134 aa  76.6  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  41 
 
 		 322 aa  75.1  0.0000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 304 aa  73.6  0.0000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  36.11 
 
 		 324 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  46.75 
 
 		 112 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 290 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  46.75 
 
 		 133 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  36.45 
 
 		 265 aa  72  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 513 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 293 aa  70.9  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 327 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1089  helix-turn-helix domain-containing protein  31.48 
 
 		 298 aa  70.9  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99301  hitchhiker  0.00294409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  35.35 
 
 		 291 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  40.66 
 
 		 255 aa  70.5  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 291 aa  70.5  0.000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  40.2 
 
 		 281 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  33.67 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 292 aa  70.1  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34440  transcriptional regulator MtlR  33.93 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000688741  normal  0.560291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  38.1 
 
 		 250 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2926  transcriptional regulator MtlR  33.93 
 
 		 287 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.795893  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4871  AraC family transcriptional regulator  43.48 
 
 		 308 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.412804  normal  0.401729 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  35.35 
 
 		 291 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 292 aa  68.9  0.00000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 293 aa  68.6  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 332 aa  68.2  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 427 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0133  AraC family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 315 aa  68.2  0.00000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.13686 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  29.52 
 
 		 282 aa  68.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  34.38 
 
 		 297 aa  68.2  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  35.35 
 
 		 291 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1982  two component transcriptional regulator, AraC family  32.38 
 
 		 544 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184696  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 291 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 299 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 316 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>