More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2645 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 156 aa  310  4.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  80.77 
 
 		 139 aa  206  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  81.4 
 
 		 147 aa  206  1e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  77.27 
 
 		 150 aa  200  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  71.53 
 
 		 143 aa  197  3e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  75.97 
 
 		 149 aa  196  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  79.17 
 
 		 147 aa  195  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  72.18 
 
 		 160 aa  193  7e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  73.64 
 
 		 148 aa  192  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  74.81 
 
 		 147 aa  191  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  71.22 
 
 		 146 aa  190  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  71.22 
 
 		 146 aa  190  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  71.22 
 
 		 146 aa  190  5e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  86.09 
 
 		 148 aa  189  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  68.84 
 
 		 156 aa  186  7e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  77.5 
 
 		 148 aa  185  2e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  75 
 
 		 147 aa  185  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  80.87 
 
 		 144 aa  184  3e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  76.47 
 
 		 153 aa  184  3e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  73.77 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  72.41 
 
 		 155 aa  173  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  73.48 
 
 		 147 aa  170  5.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  69.12 
 
 		 145 aa  170  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  67.15 
 
 		 141 aa  169  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  63.24 
 
 		 144 aa  166  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  69.09 
 
 		 134 aa  149  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2622  AraC family transcriptional regulator  65.83 
 
 		 144 aa  147  6e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  61.6 
 
 		 154 aa  144  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  58.12 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 142 aa  114  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  46.56 
 
 		 150 aa  112  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  56.14 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  49.63 
 
 		 145 aa  110  8.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  44.26 
 
 		 144 aa  107  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  51.69 
 
 		 157 aa  107  9.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  48.82 
 
 		 168 aa  107  9.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  45.08 
 
 		 150 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  53.27 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  43.7 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  42.62 
 
 		 164 aa  101  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 		 144 aa  99.4  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  45.19 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  41.8 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  40.32 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  40.32 
 
 		 168 aa  92.4  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  43.86 
 
 		 145 aa  91.3  5e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  49.11 
 
 		 162 aa  90.1  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  41.8 
 
 		 176 aa  90.1  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  39.69 
 
 		 153 aa  89.4  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 182 aa  88.2  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 327 aa  87.8  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  43.36 
 
 		 168 aa  87.8  5e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 299 aa  86.3  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  45.63 
 
 		 322 aa  85.1  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  41.84 
 
 		 305 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 311 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  41.84 
 
 		 305 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 291 aa  81.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 311 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 311 aa  81.6  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 311 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  42.86 
 
 		 324 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  40.87 
 
 		 346 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 306 aa  79  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  37.76 
 
 		 291 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 291 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 513 aa  79  0.00000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 291 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 		 112 aa  78.2  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  41.58 
 
 		 291 aa  77.8  0.00000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  42.31 
 
 		 133 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 		 291 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 291 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 290 aa  77  0.00000000000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  38.05 
 
 		 304 aa  77  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  38.46 
 
 		 250 aa  76.3  0.0000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0874  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  40.21 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 250 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  46.84 
 
 		 292 aa  75.1  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 299 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3840  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  29.75 
 
 		 198 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  36.73 
 
 		 293 aa  74.7  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  39.39 
 
 		 300 aa  74.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  42.06 
 
 		 287 aa  73.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2162  transcriptional regulator, AraC family  37.93 
 
 		 284 aa  73.9  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.637504 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 291 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  40.21 
 
 		 293 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 315 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 315 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 315 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 251 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1459  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  29.75 
 
 		 198 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164097 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 322 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  38.83 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 134 aa  73.6  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>