More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5494 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 144 aa  289  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  66.43 
 
 		 141 aa  185  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  69.53 
 
 		 154 aa  182  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  68.89 
 
 		 145 aa  174  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  63.24 
 
 		 156 aa  166  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  62.02 
 
 		 148 aa  166  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  64.06 
 
 		 148 aa  165  2e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  69.83 
 
 		 150 aa  163  5.9999999999999996e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  59.12 
 
 		 139 aa  159  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  59.12 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  65 
 
 		 147 aa  158  2e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  63.16 
 
 		 150 aa  157  4e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  59.7 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  59.7 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  59.7 
 
 		 146 aa  155  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  56.43 
 
 		 143 aa  154  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  61.67 
 
 		 147 aa  153  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  59.54 
 
 		 147 aa  153  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  58.52 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  61.16 
 
 		 149 aa  150  8e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  61.34 
 
 		 153 aa  147  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  60.33 
 
 		 151 aa  146  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  56.62 
 
 		 156 aa  144  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  62.61 
 
 		 147 aa  142  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  62.07 
 
 		 155 aa  140  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  63.48 
 
 		 148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  62.93 
 
 		 144 aa  137  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  63.46 
 
 		 134 aa  134  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  58.47 
 
 		 142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  56.52 
 
 		 148 aa  129  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  59.48 
 
 		 157 aa  128  3e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2622  AraC family transcriptional regulator  68.24 
 
 		 144 aa  120  6e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  51.11 
 
 		 150 aa  119  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  55.93 
 
 		 158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  49.18 
 
 		 164 aa  115  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  53.08 
 
 		 145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  49.56 
 
 		 156 aa  110  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  53.91 
 
 		 168 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  44.78 
 
 		 144 aa  107  6e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  49.18 
 
 		 150 aa  107  6e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  46.72 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  47.9 
 
 		 140 aa  104  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  44 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  43.08 
 
 		 164 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 168 aa  95.1  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  39.39 
 
 		 168 aa  94  6e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  39.39 
 
 		 168 aa  93.6  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  41.54 
 
 		 176 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  38.6 
 
 		 134 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 182 aa  89.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  43.59 
 
 		 162 aa  88.2  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  42.65 
 
 		 145 aa  88.2  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  45.92 
 
 		 299 aa  85.5  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 306 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  37.74 
 
 		 297 aa  80.9  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 281 aa  80.5  0.000000000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 299 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  43.14 
 
 		 255 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  42.16 
 
 		 265 aa  79  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  43.43 
 
 		 250 aa  78.2  0.00000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 293 aa  78.2  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5508  helix-turn-helix domain-containing protein  37.27 
 
 		 158 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 311 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 290 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 322 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 311 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 311 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 315 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 315 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 315 aa  77.4  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 291 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 304 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 291 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 311 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 315 aa  77  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  38.78 
 
 		 304 aa  77  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  40.21 
 
 		 332 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 291 aa  76.6  0.00000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  39 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  38.38 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 316 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0874  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 296 aa  75.9  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 293 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 678 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  39 
 
 		 513 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  41.3 
 
 		 261 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 309 aa  74.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 261 aa  73.9  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 327 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 		 322 aa  73.2  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 329 aa  73.2  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  41 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  39.8 
 
 		 331 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  38.14 
 
 		 293 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  40.91 
 
 		 305 aa  72.8  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  36.17 
 
 		 204 aa  72.4  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4617  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 		 296 aa  71.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107807 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 291 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>