More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3612 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 144 aa  291  2e-78  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  94.12 
 
 		 140 aa  258  2e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  84.62 
 
 		 150 aa  249  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  84.62 
 
 		 150 aa  249  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  84.62 
 
 		 150 aa  249  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  68.79 
 
 		 164 aa  201  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  72.09 
 
 		 150 aa  193  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  61.7 
 
 		 144 aa  169  7.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  46.34 
 
 		 148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  45.3 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  47.41 
 
 		 147 aa  108  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  48.41 
 
 		 145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  43.9 
 
 		 150 aa  107  4.0000000000000004e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  46.55 
 
 		 148 aa  107  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  44.26 
 
 		 156 aa  107  8.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  42.98 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  43.8 
 
 		 139 aa  105  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  42.42 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  43.8 
 
 		 147 aa  105  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  44.17 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  46.72 
 
 		 144 aa  104  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  47.11 
 
 		 141 aa  104  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  43.7 
 
 		 151 aa  103  5e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  42.98 
 
 		 143 aa  103  9e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  42.52 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  40.74 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  46.36 
 
 		 144 aa  101  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  46.83 
 
 		 150 aa  101  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  44.55 
 
 		 147 aa  99  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  43.1 
 
 		 148 aa  98.2  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  44.55 
 
 		 148 aa  97.4  5e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  46.28 
 
 		 145 aa  97.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  41.38 
 
 		 147 aa  97.4  5e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  42.11 
 
 		 164 aa  97.1  8e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  42.74 
 
 		 155 aa  97.1  8e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 142 aa  95.5  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  42.24 
 
 		 157 aa  94.7  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  41.94 
 
 		 176 aa  92.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  44.26 
 
 		 154 aa  92.8  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  39.55 
 
 		 168 aa  90.9  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 168 aa  90.5  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  41.27 
 
 		 158 aa  90.5  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 182 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  39.55 
 
 		 168 aa  89  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0677  transposon Tn10 TetD protein  41.05 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.198694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0739  transposon Tn10 TetD protein  41.05 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.899902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0620  transposon Tn10 TetD protein  41.05 
 
 		 113 aa  86.3  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  40.16 
 
 		 162 aa  86.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  42 
 
 		 303 aa  85.9  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 261 aa  85.5  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 296 aa  84.7  4e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  42.86 
 
 		 134 aa  84.7  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  44.79 
 
 		 281 aa  84.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 		 291 aa  84  6e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 306 aa  83.6  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0693  transposon Tn10 TetD protein  40 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.808673  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0634  transposon Tn10 TetD protein  40 
 
 		 113 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  36.64 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 134 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 278 aa  80.9  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 513 aa  80.1  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 327 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  45.36 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1021  AraC family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 300 aa  79  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1078  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 113 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.531138 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2898  transcriptional regulator, AraC family  37.14 
 
 		 282 aa  78.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4171  transcriptional regulator, AraC family  34.71 
 
 		 300 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 291 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 304 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  34.65 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  42.71 
 
 		 261 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1170  transcriptional regulator, AraC family  34.71 
 
 		 300 aa  78.6  0.00000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00906983  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  38.32 
 
 		 322 aa  77.8  0.00000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 315 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 315 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 315 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 678 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0971  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 136 aa  77.4  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000205729  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 311 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 332 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 315 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  39 
 
 		 307 aa  77.4  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  41.84 
 
 		 255 aa  77  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  41.75 
 
 		 306 aa  77  0.00000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1216  AraC family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3653  helix-turn-helix domain-containing protein  39.56 
 
 		 240 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 311 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  36.3 
 
 		 153 aa  76.3  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 291 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  34.95 
 
 		 291 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2622  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0868161 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  42.16 
 
 		 299 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3895  helix-turn-helix domain-containing protein  30.56 
 
 		 282 aa  75.9  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>