More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2413 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 322 aa  672    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  82.64 
 
 		 291 aa  505  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  62.59 
 
 		 293 aa  386  1e-106  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  54.77 
 
 		 293 aa  338  7e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  56.45 
 
 		 289 aa  333  2e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 291 aa  198  7.999999999999999e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  37.76 
 
 		 291 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  39.6 
 
 		 293 aa  195  1e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  40.51 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  40.51 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  39.6 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  41.97 
 
 		 324 aa  193  4e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  37.59 
 
 		 291 aa  192  7e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  40.5 
 
 		 289 aa  192  7e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  38.97 
 
 		 290 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 311 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 311 aa  190  4e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  39.79 
 
 		 305 aa  186  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  38.66 
 
 		 327 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 304 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  37.09 
 
 		 291 aa  182  7e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  35.64 
 
 		 310 aa  180  2e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  37 
 
 		 291 aa  178  9e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 291 aa  176  5e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  38.03 
 
 		 305 aa  176  5e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  34.47 
 
 		 346 aa  176  6e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 315 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 315 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 315 aa  175  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 332 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  34.31 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  37.19 
 
 		 306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  33.94 
 
 		 287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 251 aa  172  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0725  AraC family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 311 aa  169  9e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0708  AraC family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  35.66 
 
 		 288 aa  167  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 287 aa  167  2e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2555  AraC family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  35.84 
 
 		 678 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  36.79 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5208  AraC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  31.8 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 299 aa  109  6e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  33.53 
 
 		 296 aa  109  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  42.18 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  42.66 
 
 		 303 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 154 aa  102  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 299 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 312 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 		 287 aa  98.2  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 		 318 aa  99  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  38.55 
 
 		 361 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  32.64 
 
 		 304 aa  98.2  2e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  35.02 
 
 		 295 aa  97.4  3e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 316 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 292 aa  97.4  3e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  28.7 
 
 		 316 aa  96.7  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4236  AraC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 285 aa  97.1  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.457979 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 316 aa  97.1  4e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 299 aa  96.7  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  31.58 
 
 		 280 aa  95.1  1e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5716  AraC family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 304 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  27.98 
 
 		 289 aa  94.7  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  36.08 
 
 		 301 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 322 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 319 aa  92.8  7e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  41.44 
 
 		 180 aa  92  1e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 304 aa  92  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  33.33 
 
 		 331 aa  91.7  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0276  helix-turn-helix domain-containing protein  35 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  39.01 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  43.45 
 
 		 202 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  32.85 
 
 		 296 aa  92  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 295 aa  91.7  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 223 aa  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  26.55 
 
 		 301 aa  90.9  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  39.45 
 
 		 293 aa  90.9  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  31.67 
 
 		 300 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 306 aa  90.9  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4687  AraC family transcriptional regulator  41.91 
 
 		 287 aa  90.9  3e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  39.37 
 
 		 297 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 277 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 281 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 281 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  38.58 
 
 		 272 aa  89  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  36.43 
 
 		 299 aa  88.6  1e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 279 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>