More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_1458 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 301 aa  614  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  98.67 
 
 		 301 aa  607  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  40.31 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2883  AraC family transcriptional regulator  40.07 
 
 		 307 aa  186  4e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.858803 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  40.66 
 
 		 299 aa  177  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  41.98 
 
 		 318 aa  177  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  39.59 
 
 		 272 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  38.93 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 306 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 306 aa  162  7e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 306 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  36.28 
 
 		 304 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3976  helix-turn-helix domain-containing protein  32.62 
 
 		 336 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5827  AraC family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5716  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 304 aa  145  1e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5610  AraC family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 302 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00190409  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1279  helix-turn-helix domain-containing protein  39 
 
 		 306 aa  142  5e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.665979 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1980  RC149  38.86 
 
 		 308 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421398  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0681  AraC family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0588  AraC family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 308 aa  134  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0589  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 300 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0682  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 300 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1981  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 384 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.382238  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 319 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 316 aa  112  9e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3977  helix-turn-helix domain-containing protein  30.89 
 
 		 301 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  30.09 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 304 aa  106  6e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1857  helix-turn-helix domain-containing protein  43.52 
 
 		 126 aa  105  9e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2973  AraC family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 127 aa  103  4e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.947385  normal  0.597443 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5244  AraC family transcriptional regulator  39.67 
 
 		 134 aa  101  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.592893  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 312 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  32.55 
 
 		 303 aa  100  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5154  helix-turn-helix domain-containing protein  40.17 
 
 		 120 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  34.32 
 
 		 293 aa  100  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  44.44 
 
 		 316 aa  99  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1960  AraC family transcriptional regulator  39.66 
 
 		 143 aa  99  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  31.68 
 
 		 294 aa  98.6  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  38.41 
 
 		 180 aa  97.4  2e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  34.78 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0228  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 123 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.654381 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  30.54 
 
 		 296 aa  97.8  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 294 aa  97.4  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  32.49 
 
 		 322 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  27.04 
 
 		 292 aa  96.3  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  44.04 
 
 		 291 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 304 aa  95.9  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3232  transcriptional regulator, AraC family  33.51 
 
 		 296 aa  95.9  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0599312  hitchhiker  0.0000105754 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  42.2 
 
 		 293 aa  94.7  2e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  40.37 
 
 		 292 aa  93.6  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 306 aa  93.2  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2577  transcriptional regulator, AraC family  32.02 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.996426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  40.74 
 
 		 291 aa  92.8  7e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  29.87 
 
 		 331 aa  92.4  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  41.07 
 
 		 289 aa  92.4  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  43.81 
 
 		 288 aa  92.4  9e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  48.86 
 
 		 202 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  44.34 
 
 		 306 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  27.69 
 
 		 291 aa  91.7  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  26.55 
 
 		 322 aa  90.9  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  31.75 
 
 		 296 aa  90.9  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 353 aa  90.9  3e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 307 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  28.78 
 
 		 309 aa  90.5  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  25.36 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  43 
 
 		 273 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  42.59 
 
 		 291 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  41.28 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3111  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  27.04 
 
 		 314 aa  89.4  7e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406543  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 299 aa  89.4  8e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  37.27 
 
 		 270 aa  88.2  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  38.89 
 
 		 291 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0583  AraC family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 312 aa  89  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.98908  normal  0.54842 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 290 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 316 aa  87  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 327 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  42.37 
 
 		 287 aa  86.7  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  27.18 
 
 		 293 aa  86.3  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1472  transcriptional regulator, AraC family  45 
 
 		 269 aa  85.9  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 293 aa  85.9  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 		 295 aa  85.1  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 274 aa  85.1  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  33.15 
 
 		 295 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4617  transcriptional regulator, AraC family  29.61 
 
 		 296 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107807 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5999  AraC family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 179 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 		 223 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  48.78 
 
 		 266 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  30.43 
 
 		 289 aa  84.7  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0479  AraC family transcriptional regulator  46.32 
 
 		 279 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109362 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0608  AraC family transcriptional regulator  25.2 
 
 		 305 aa  84.7  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5342  AraC family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 276 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.975436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 289 aa  83.6  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  25.35 
 
 		 294 aa  83.6  0.000000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>