More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1111 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 312 aa  649    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 319 aa  159  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  31.85 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  43.48 
 
 		 282 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  42.94 
 
 		 274 aa  130  3e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  36.31 
 
 		 304 aa  118  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  31.85 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29260  putative transcriptional regulator  31.45 
 
 		 297 aa  116  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  49.11 
 
 		 133 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 304 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  50.49 
 
 		 112 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  29.9 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5827  helix-turn-helix domain-containing protein  30.88 
 
 		 316 aa  109  7.000000000000001e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112164  normal  0.283627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 299 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  49.53 
 
 		 306 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  33.21 
 
 		 292 aa  106  5e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3475  helix-turn-helix domain-containing protein  36.88 
 
 		 292 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2139  helix-turn-helix domain-containing protein  37.96 
 
 		 294 aa  103  3e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.957349  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6717  transcriptional regulator, AraC family  38.69 
 
 		 296 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.121518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1524  transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.753144  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3417  AraC family transcriptional regulator  33.46 
 
 		 299 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.138414  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1549  transcriptional regulator, AraC family  47.12 
 
 		 316 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0143415  hitchhiker  0.00302933 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 322 aa  100  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  47.17 
 
 		 287 aa  98.2  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  42.45 
 
 		 202 aa  97.4  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  41.28 
 
 		 309 aa  95.9  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  31.85 
 
 		 304 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6285  transcriptional regulator, AraC family  39.85 
 
 		 287 aa  95.1  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.671161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 223 aa  95.1  1e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1365  AraC family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 353 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.122979  normal  0.036458 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  28.97 
 
 		 295 aa  94.7  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 291 aa  93.2  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  28.7 
 
 		 289 aa  92.8  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  42.99 
 
 		 300 aa  92  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 291 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  45.19 
 
 		 299 aa  92  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1543  transcriptional regulator, AraC family  43.43 
 
 		 300 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 299 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 291 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  35.34 
 
 		 294 aa  90.9  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1225  AraC family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 249 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615855  normal  0.0441463 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5108  AraC family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.310256  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  39.86 
 
 		 291 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4739  proline utilization regulator  47.06 
 
 		 250 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284133  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3089  helix-turn-helix domain-containing protein  29.6 
 
 		 297 aa  90.1  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.830597 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 291 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 311 aa  90.1  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54190  proline utilization regulator  47.06 
 
 		 250 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 311 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 311 aa  89.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0082  transcriptional regulator, AraC family  33.72 
 
 		 292 aa  89.7  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.628575  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  34.71 
 
 		 291 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5912  AraC family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 281 aa  89  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  28.74 
 
 		 331 aa  89  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 311 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 301 aa  88.6  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 305 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 305 aa  88.2  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3361  helix-turn-helix domain-containing protein  44.55 
 
 		 160 aa  89  1e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  24.91 
 
 		 294 aa  87.8  2e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 290 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 305 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  31.41 
 
 		 293 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3583  transcriptional regulator AraC family  36.69 
 
 		 293 aa  88.2  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05505  putative transcription regulator protein  36.57 
 
 		 270 aa  87.4  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3976  helix-turn-helix domain-containing protein  36.88 
 
 		 336 aa  87.4  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  31.64 
 
 		 291 aa  87  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  28.31 
 
 		 346 aa  86.7  5e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 293 aa  86.7  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  38.41 
 
 		 291 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 293 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 301 aa  86.3  7e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 296 aa  86.3  7e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2669  AraC family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 188 aa  85.9  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.588575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  42 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4687  AraC family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 287 aa  85.5  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 288 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 204 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  37.5 
 
 		 180 aa  84  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 312 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1614  transcriptional regulator, AraC family  44.23 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  30.65 
 
 		 303 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  43.14 
 
 		 280 aa  83.6  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2022  AraC family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 311 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00965402  normal  0.580849 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1857  helix-turn-helix domain-containing protein  39.05 
 
 		 126 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0222434 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4223  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0816  AraC family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 319 aa  83.2  0.000000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4111  transcriptional regulator, AraC family  38.24 
 
 		 299 aa  83.2  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.596036  normal  0.240547 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2453  AraC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 279 aa  83.6  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  unclonable  0.00000000000537916  normal  0.591211 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  30.24 
 
 		 324 aa  82.8  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0983  helix-turn-helix domain-containing protein  34.76 
 
 		 295 aa  82.8  0.000000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  33.81 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1754  transcriptional regulator, AraC family  39.25 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>