More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_1041 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  100 
 
 		 291 aa  595  1e-169  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  89.69 
 
 		 291 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  77.51 
 
 		 291 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  74.74 
 
 		 291 aa  443  1e-123  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  73.7 
 
 		 291 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  74.05 
 
 		 291 aa  437  1e-121  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  71.63 
 
 		 291 aa  426  1e-118  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3238  AraC family transcriptional regulator  68.17 
 
 		 290 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.996927 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  53.1 
 
 		 293 aa  294  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  53.08 
 
 		 293 aa  293  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5332  AraC family transcriptional regulator  52.33 
 
 		 301 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5804  AraC family transcriptional regulator  47.86 
 
 		 305 aa  260  1e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  49.12 
 
 		 327 aa  257  2e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  48.01 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  48.01 
 
 		 311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  48.01 
 
 		 311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  48.01 
 
 		 311 aa  252  6e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  47.84 
 
 		 346 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  46.07 
 
 		 324 aa  248  6e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  47.81 
 
 		 291 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4214  transcriptional regulator, AraC family  45.36 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4324  transcriptional regulator, AraC family  45.36 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0282215 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  47.81 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  47.81 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  47.81 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  47.81 
 
 		 315 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  47.81 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3218  AraC family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 678 aa  236  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000051538  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0725  AraC family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 311 aa  231  8.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.576949 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1732  transcriptional regulator, AraC family  44.32 
 
 		 288 aa  231  9e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0803469 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0708  AraC family transcriptional regulator  47.45 
 
 		 311 aa  231  1e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2555  AraC family transcriptional regulator  47.08 
 
 		 311 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6513  transcriptional regulator, AraC family  44.81 
 
 		 306 aa  229  6e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 251 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  42.66 
 
 		 304 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2907  transcriptional regulator, AraC family  41.13 
 
 		 289 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0560618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  37.82 
 
 		 293 aa  213  3.9999999999999995e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  37.46 
 
 		 291 aa  200  3e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  39.15 
 
 		 287 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 322 aa  196  3e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2337  AraC family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 289 aa  182  5.0000000000000004e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000580503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1881  transcriptional regulator, AraC family  36.77 
 
 		 305 aa  179  5.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.831794  normal  0.0117859 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5208  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 314 aa  174  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.360222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  35.13 
 
 		 287 aa  171  1e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  34.77 
 
 		 287 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3174  helix-turn-helix domain-containing protein  36.26 
 
 		 287 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2932  transcriptional regulator, AraC family  35.64 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  35.61 
 
 		 310 aa  166  2.9999999999999998e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2093  AraC family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 287 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.369123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  30.32 
 
 		 309 aa  115  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4318  AraC family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 305 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00219342 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3996  helix-turn-helix domain-containing protein  32.58 
 
 		 289 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5000  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5860  AraC family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 305 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.499461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2981  AraC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 292 aa  106  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3244  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 301 aa  105  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432164 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5093  AraC family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.467029 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5245  AraC family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 		 294 aa  102  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1318  AraC family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 294 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.761239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  41.43 
 
 		 318 aa  100  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 277 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4172  AraC family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 295 aa  99  9e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0833223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1673  AraC family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 314 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.310754 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 316 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0716  AraC family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 296 aa  95.9  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00193737 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2383  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 281 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.499508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1989  AraC family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 277 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.753386  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3312  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 281 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.403912 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  35.63 
 
 		 303 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  40.65 
 
 		 299 aa  95.1  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21720  AraC family transcriptional regulator  51.58 
 
 		 284 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1852  putative transcriptional regulator  32.84 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.687343  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0027  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 299 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.618912  normal  0.0626425 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  35.51 
 
 		 296 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  32.86 
 
 		 331 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4978  transcriptional regulator, AraC family  33.8 
 
 		 318 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.327567  normal  0.11746 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  30.63 
 
 		 304 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3975  helix-turn-helix domain-containing protein  50.53 
 
 		 302 aa  93.6  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6198  transcriptional regulator, AraC family  32.69 
 
 		 285 aa  93.6  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 306 aa  92.8  5e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1458  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 301 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3327  AraC family transcriptional regulator  47.96 
 
 		 279 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.414693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6370  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 301 aa  92.8  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  48.39 
 
 		 278 aa  92.8  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4229  transcriptional regulator, AraC family  32.44 
 
 		 278 aa  92.4  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7037  AraC family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 301 aa  92.8  7e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.283867  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2326  transcriptional regulator, AraC family  32.92 
 
 		 295 aa  92.4  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0937352 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 319 aa  92.4  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  41.51 
 
 		 294 aa  92.4  9e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6068  AraC family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 287 aa  92.4  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 300 aa  92  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3869  AraC family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 304 aa  91.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  44.23 
 
 		 305 aa  91.7  1e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 322 aa  90.9  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2379  AraC family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 304 aa  90.5  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0538221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  46 
 
 		 202 aa  90.5  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>