More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2463 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 162 aa  328  3e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  54.1 
 
 		 168 aa  133  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  52.54 
 
 		 168 aa  114  5e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1399  transcriptional regulator, AraC family  53.91 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1022  transcriptional regulator, AraC family  44.85 
 
 		 145 aa  105  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532062  normal  0.274495 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  43.86 
 
 		 156 aa  104  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  51.28 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4744  transcriptional regulator, AraC family  46.03 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.235772  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6338  transcriptional regulator, AraC family  47.5 
 
 		 145 aa  99.8  1e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  47.2 
 
 		 141 aa  99.4  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5952  AraC family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 142 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.149338 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2677  AraC family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 147 aa  93.6  9e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.968923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  52 
 
 		 139 aa  93.6  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  42.28 
 
 		 148 aa  93.2  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  40.8 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 146 aa  93.2  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2345  AraC family transcriptional regulator  56.47 
 
 		 148 aa  92.4  2e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.215475  normal  0.707211 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  39.2 
 
 		 134 aa  92.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4645  transcriptional regulator, AraC family  50.96 
 
 		 112 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0412729 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4513  transcriptional regulator, AraC family  49.51 
 
 		 133 aa  92  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  48.48 
 
 		 145 aa  92.4  3e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2070  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 		 151 aa  90.5  9e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  41.46 
 
 		 150 aa  90.5  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  44.96 
 
 		 156 aa  90.5  9e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3008  helix-turn-helix domain-containing protein  45.61 
 
 		 149 aa  90.5  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.501023  normal  0.487473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0210  AraC family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 274 aa  90.1  1e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.85611 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2645  AraC family transcriptional regulator  49.11 
 
 		 156 aa  90.1  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0110  transcriptional regulator, AraC family  43.22 
 
 		 148 aa  89.7  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  31.93 
 
 		 286 aa  89.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1762  transcriptional regulator, AraC family  51.76 
 
 		 155 aa  89  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.00442451  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0074  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 168 aa  89  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0082  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 168 aa  88.2  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.802043 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  43.59 
 
 		 144 aa  88.2  4e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2229  helix-turn-helix domain-containing protein  48 
 
 		 160 aa  88.2  5e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0623  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  46.3 
 
 		 150 aa  87.8  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.464134  normal  0.0376434 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2020  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 		 143 aa  87.8  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.206011  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  43.64 
 
 		 147 aa  87  9e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3415  AraC family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 266 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5551  transcriptional regulator, AraC family  41.67 
 
 		 133 aa  87  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.832185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3902  AraC family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 154 aa  86.3  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0560  AraC family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 281 aa  85.9  2e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000376127 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  54.76 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2902  transcriptional regulator, AraC family  47.06 
 
 		 148 aa  86.3  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000233249  hitchhiker  0.0000148724 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  40.16 
 
 		 144 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  49.51 
 
 		 147 aa  85.9  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2347  AraC family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.745211  normal  0.339255 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4177  AraC family transcriptional regulator  51.65 
 
 		 147 aa  85.1  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0005743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  39.06 
 
 		 164 aa  84.7  5e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  36.04 
 
 		 513 aa  84.7  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 150 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 150 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 150 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2081  transcriptional regulator, AraC family  37.82 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.256  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  40.52 
 
 		 140 aa  84  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0872  AraC family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 292 aa  83.2  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2180  helix-turn-helix domain-containing protein  41.96 
 
 		 281 aa  83.6  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.971115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5694  AraC family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 319 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.730665  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7719  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  46.53 
 
 		 134 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1537  transcriptional regulator, AraC family  36 
 
 		 282 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.164062  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3172  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 		 147 aa  82  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000984429 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 306 aa  82  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  44.32 
 
 		 255 aa  81.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2380  transcriptional regulator, AraC family  47.31 
 
 		 300 aa  81.3  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0838291  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0841  transcriptional regulator, AraC family  36.64 
 
 		 176 aa  81.6  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 312 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12670  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  38.71 
 
 		 250 aa  81.3  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0536  AraC family transcriptional regulator  43.43 
 
 		 304 aa  81.3  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1506  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 182 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.325288 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  43.01 
 
 		 278 aa  80.9  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4104  transcriptional regulator, AraC family  45.78 
 
 		 250 aa  80.5  0.000000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 322 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1268  transcriptional regulator, AraC family  40.21 
 
 		 300 aa  79.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7015  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0570551 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1480  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  42.86 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6349  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0502154  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  32.48 
 
 		 515 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4632  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 316 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.569454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2527  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 278 aa  79  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2594  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 278 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2693  AraC family transcriptional regulator  41.41 
 
 		 278 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5610  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 302 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00190409  normal  0.169642 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5827  AraC family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 302 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 291 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1047  transcriptional regulator, AraC family  39.8 
 
 		 273 aa  78.2  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.859066 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  40.59 
 
 		 303 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  38.84 
 
 		 322 aa  78.2  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  36.79 
 
 		 261 aa  77.8  0.00000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 291 aa  77.8  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  38.98 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 261 aa  77.8  0.00000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3971  putative transcriptional regulator  36 
 
 		 272 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2855  AraC family substrate binding transcriptional regulator  35.64 
 
 		 280 aa  77  0.00000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.222069  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2431  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  35.14 
 
 		 294 aa  77.4  0.00000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.690566  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  38.64 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3104  response regulator receiver protein  34.31 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  41.94 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 299 aa  77  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>