More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3895 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3895  helix-turn-helix domain-containing protein  100 
 
 		 282 aa  568  1e-161  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2898  transcriptional regulator, AraC family  64.89 
 
 		 282 aa  366  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4456  transcriptional regulator, AraC family  26.23 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0480733 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6783  transcriptional regulator, AraC family  26.74 
 
 		 293 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.64784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1991  helix-turn-helix domain-containing protein  27.53 
 
 		 286 aa  86.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4679  transcriptional regulator, AraC family  28.66 
 
 		 293 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.603206  hitchhiker  0.000201737 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2476  transcriptional regulator, AraC family  25.68 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.315462 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4367  transcriptional regulator, AraC family  29.59 
 
 		 286 aa  81.6  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0906731 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4790  Helix-turn-helix, AraC domain protein  28.21 
 
 		 268 aa  82  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.654902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3677  transcriptional regulator, AraC family  24.54 
 
 		 282 aa  81.6  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.627004  normal  0.14963 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5908  transcriptional regulator, AraC family  25.52 
 
 		 286 aa  80.1  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1112  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.683212  normal  0.130895 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1303  transcriptional regulator, AraC family  30.83 
 
 		 129 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.239353  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003334  type III secretion thermoregulatory protein (LcrF,VirF,transcription regulation of virulence plasmid)  28.24 
 
 		 286 aa  77.4  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01697  hypothetical protein  27.82 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5555  transcriptional regulator, AraC family  25.17 
 
 		 271 aa  77.8  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.417705 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  23.28 
 
 		 282 aa  77  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0156  helix-turn-helix domain-containing protein  28.29 
 
 		 266 aa  77.4  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00245012  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4585  transcriptional regulator, AraC family  31.65 
 
 		 291 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0477904  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  30.56 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3277  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6177  transcriptional regulator, AraC family  27.56 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0365179 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2380  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 300 aa  73.9  0.000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0838291  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0914  transcriptional regulator, AraC family  25.95 
 
 		 290 aa  73.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.294163  normal  0.0677642 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 150 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 342 aa  74.7  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 150 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3397  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 150 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.287817 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  38.46 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  31.52 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3893  helix-turn-helix domain-containing protein  26.62 
 
 		 272 aa  73.6  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  36.26 
 
 		 310 aa  73.2  0.000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0584  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  29.79 
 
 		 164 aa  72.8  0.000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 307 aa  72.8  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0450  AraC family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 285 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0724332  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  39.56 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4299  transcriptional regulator, AraC family  32.61 
 
 		 144 aa  72  0.000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2899  helix-turn-helix domain-containing protein  28.87 
 
 		 140 aa  72.4  0.000000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.555623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1802  AraC family transcriptional regulator  24.91 
 
 		 281 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.460896 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4563  transcriptional regulator, AraC family  37.5 
 
 		 255 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0803  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1186  AraC family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 278 aa  71.2  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06300  methylphosphotriester-DNA alkyltransferase  40 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5700  transcriptional regulator, AraC family  26.97 
 
 		 269 aa  71.6  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.554273 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1063  AraC family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.81783  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02019  transcription regulator protein  30.71 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2390  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.245348  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 		 291 aa  70.9  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 299 aa  70.5  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4709  AraC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 327 aa  70.9  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.954804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42390  transcriptional regulator ExsA  23.08 
 
 		 278 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.732807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2282  putative transcriptional regulator  30.77 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1748  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  28.1 
 
 		 270 aa  70.1  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00130809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4142  transcriptional regulator, AraC family  23.4 
 
 		 275 aa  70.1  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.776945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0188  transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 		 286 aa  69.7  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.043939  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 		 322 aa  69.7  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 306 aa  69.7  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0878  AraC family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776666  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0341  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 264 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.729431 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0314  AraC family transcriptional regulator  33 
 
 		 322 aa  69.3  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2509  AraC family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 294 aa  69.3  0.00000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00177278  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0997  AraC/XylS family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 358 aa  68.9  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000441723  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3416  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 279 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0904858  normal  0.667905 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  26.04 
 
 		 286 aa  68.9  0.00000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3385  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0356472  normal  0.653501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4339  transcriptional regulator, AraC family  34.02 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.400268 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6135  transcriptional regulator, AraC family  35.29 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4671  AraC family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  37.76 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4961  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0263791 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0392  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 234 aa  68.6  0.0000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3060  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  30.43 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0924  transcriptional regulator, AraC family  24.08 
 
 		 267 aa  68.6  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.489543  normal  0.138497 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4668  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.622787 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5307  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5196  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 		 264 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.82206  normal  0.599062 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1607  histidine kinase  32.65 
 
 		 1366 aa  67.4  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89561 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  41.3 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4262  transcriptional activator RhaS  27.38 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5386  transcriptional regulator, AraC family  20.24 
 
 		 270 aa  67.4  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 139 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4331  transcriptional activator RhaS  27.38 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0197402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0889  transcriptional regulator, AraC family  30.11 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1692  transcriptional regulator, AraC family  32.14 
 
 		 144 aa  67.8  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623268  normal  0.377935 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3739  helix-turn-helix domain-containing protein  27.88 
 
 		 318 aa  68.2  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.975676  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2063  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 311 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2914  AraC family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 318 aa  67.8  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4377  transcriptional activator RhaS  27.38 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4443  transcriptional activator RhaS  26.62 
 
 		 278 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0900  transcriptional regulator, AraC family  22.34 
 
 		 269 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.899856  normal  0.0742075 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1515  transcriptional regulator, AraC family  24.5 
 
 		 265 aa  67  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5737  transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 164 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>