More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene pE33L466_0353 on replicon NC_007103
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  100 
 
 
301 aa  625  1e-178  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1312  AraC family transcriptional regulator  36.49 
 
 
309 aa  206  5e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0474  AraC family transcriptional regulator  36.4 
 
 
284 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23290  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 
276 aa  149  4e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0768  AraC family transcriptional regulator  30.4 
 
 
261 aa  145  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  30.4 
 
 
273 aa  143  4e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  30.56 
 
 
278 aa  135  9e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3428  transcriptional regulator, AraC family  31.75 
 
 
265 aa  129  6e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3104  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 
282 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.187437 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0749  lactose operon transcriptional activator  26.49 
 
 
279 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0693788  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0765  AraC family transcriptional regulator  25.75 
 
 
279 aa  99.4  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.448457  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.45 
 
 
310 aa  98.2  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2032  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.45 
 
 
310 aa  97.4  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.527693  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0611  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.24 
 
 
280 aa  95.1  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88985  normal  0.0110602 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.21 
 
 
314 aa  91.7  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.64 
 
 
292 aa  92  1e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  30.94 
 
 
282 aa  92  1e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00066  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.64 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3535  transcriptional regulator, AraC family  27.64 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0068  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.64 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.64 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3593  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.64 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000000316606 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0066  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.64 
 
 
281 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.269311  normal  0.445846 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2134  AraC protein, arabinose-binding/dimerisation  24.82 
 
 
306 aa  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00065  hypothetical protein  27.64 
 
 
292 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0069  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.64 
 
 
309 aa  90.9  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  26.5 
 
 
306 aa  89.4  8e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.21 
 
 
316 aa  88.6  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.49 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000211757 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.53 
 
 
281 aa  87  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0110  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.53 
 
 
281 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.234129 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0111  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.53 
 
 
281 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.311813 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.53 
 
 
281 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  0.0929131 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0108  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.53 
 
 
281 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.88 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1996  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.88 
 
 
310 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2264  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.49 
 
 
310 aa  83.2  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0464  AraC family transcriptional regulator  33.68 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  35.19 
 
 
513 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0320  AraC family transcriptional regulator  24.6 
 
 
281 aa  82.4  0.000000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.996721  hitchhiker  0.0000353353 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  23.33 
 
 
290 aa  82  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0192  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0179  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0147136  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0211  transcriptional regulator, AraC family  39.05 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0191  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 
299 aa  81.3  0.00000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0719  transcriptional regulator, AraC family  24 
 
 
281 aa  81.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1575  AraC family transcriptional regulator  39.64 
 
 
339 aa  80.9  0.00000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5603  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 
409 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0216  transcriptional regulator, AraC family  38.1 
 
 
299 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0182  AraC family transcriptional regulator  39.05 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0176  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 
299 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2388  AraC family transcriptional regulator  25.5 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.262251  unclonable  0.0000340178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 
1201 aa  77.4  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1627  transcriptional regulator, AraC family  25.65 
 
 
273 aa  77  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000116038  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  25.61 
 
 
282 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0937  transcriptional regulator, AraC family  22.63 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127184  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0692  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 
287 aa  76.6  0.0000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4578  AraC family transcriptional regulator  34.29 
 
 
409 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0591899  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  25.52 
 
 
286 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  25.1 
 
 
298 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1862  transcriptional regulator, AraC family  23.18 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4562  AraC family transcriptional regulator  34.62 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00627934  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4969  transcriptional regulator, AraC family  34.62 
 
 
409 aa  74.3  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  20.47 
 
 
325 aa  74.7  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2291  transcriptional regulator, AraC family  24.28 
 
 
292 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3127  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2110  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 
185 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.695339  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  26.16 
 
 
300 aa  74.3  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  21.37 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000994716  hitchhiker  0.0000611237 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0089  helix-turn-helix domain-containing protein  26.21 
 
 
745 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0092  helix-turn-helix domain-containing protein  26.21 
 
 
745 aa  73.6  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0951  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 
571 aa  73.2  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00021324  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1378  AraC family transcriptional regulator  22.9 
 
 
293 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4074  AraC family transcriptional regulator  30.08 
 
 
290 aa  73.2  0.000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.63505 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37180  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  22.75 
 
 
297 aa  72.8  0.000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5735  transcriptional regulator AraC family  23.79 
 
 
311 aa  72.4  0.000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.582182  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  23.36 
 
 
313 aa  71.6  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1809  transcriptional regulator, AraC family  38.53 
 
 
273 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000729156  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06729  hypothetical protein  35.71 
 
 
288 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  35.48 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3436  AraC family transcriptional regulator  25.19 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  33.68 
 
 
515 aa  72  0.00000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  34.02 
 
 
332 aa  71.6  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2562  transcriptional regulator, AraC family  24.91 
 
 
306 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0914693  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2894  AraC family transcriptional regulator  32.08 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00223441  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3148  transcriptional regulator, AraC family  32.08 
 
 
409 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.322003 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1509  transcriptional regulator, AraC family  35.51 
 
 
272 aa  71.6  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4320  transcriptional regulator, AraC family  29.37 
 
 
427 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 
293 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0991  transcriptional regulator, AraC family  24.36 
 
 
276 aa  70.5  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0102  two component transcriptional regulator, AraC family  35.42 
 
 
519 aa  70.5  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  37.93 
 
 
310 aa  70.9  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2634  DNA-binding transcriptional regulator AraC  24.71 
 
 
294 aa  70.1  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2641  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 
308 aa  70.5  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  32.14 
 
 
302 aa  70.1  0.00000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0862  transcriptional regulator, AraC family  22.96 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000330517  normal  0.0669751 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  23.45 
 
 
301 aa  69.7  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1732  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 
323 aa  69.7  0.00000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0413947  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>