More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2139 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 282 aa  567  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2212  AraC family transcriptional regulator  38.93 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0125  transcriptional regulator, AraC family  33.45 
 
 		 300 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0353  MSM (multiple sugar metabolism) operon regulatory protein  30.94 
 
 		 301 aa  92  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001016  transcriptional regulator AraC/XylS family  25.2 
 
 		 270 aa  89.4  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0540486  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07095  hypothetical protein  24.22 
 
 		 270 aa  89  8e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4427  helix-turn-helix domain-containing protein  24.21 
 
 		 257 aa  88.6  9e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 168 aa  86.7  4e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2101  putative DNA-binding protein  26.72 
 
 		 286 aa  86.3  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.326102  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4587  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 291 aa  85.5  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2461  AraC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1137  transcriptional regulator, AraC family  29.2 
 
 		 287 aa  83.6  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000101216  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0859  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 291 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.775109  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3256  AraC family transcriptional regulator  25.64 
 
 		 292 aa  83.6  0.000000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  32.41 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 300 aa  83.2  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0180  AraC family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 223 aa  82.4  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0841  transcriptional regulator, AraC family  26.24 
 
 		 300 aa  82.4  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1393  transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 		 303 aa  82.4  0.000000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  31.73 
 
 		 322 aa  82  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0820  HTH-type transcriptional regulator, AraC-family  26.29 
 
 		 259 aa  82  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2401  transcriptional regulator, AraC family  26.22 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3397  AraC family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 298 aa  81.3  0.00000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000136095  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 309 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  40.35 
 
 		 291 aa  80.1  0.00000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4732  helix-turn-helix domain-containing protein  32.08 
 
 		 293 aa  80.1  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0052536 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3861  two component AraC family transcriptional regulator  37.69 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2057  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 293 aa  79.3  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.227096  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  30.39 
 
 		 291 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6737  AraC family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 251 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4258  AraC family transcriptional regulator  29 
 
 		 327 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1536  putative AraC family DNA-binding protein  21.72 
 
 		 310 aa  78.2  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0517  helix-turn-helix domain-containing protein  33.67 
 
 		 180 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970363 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 293 aa  78.6  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0168  AraC/XylS family transcriptional regulator  23.32 
 
 		 287 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000293268  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 		 513 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4464  helix-turn-helix domain-containing protein  31.63 
 
 		 291 aa  77.4  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4605  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01004  Transcriptional regulator containing an amidase domain and an AraC-type DNA-binding HTH domain  37.89 
 
 		 329 aa  77  0.0000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0283206  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1548  transcriptional regulator, AraC family  24.45 
 
 		 276 aa  76.6  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1829  transcriptional regulator, AraC family  41.25 
 
 		 517 aa  76.6  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.719428  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2020  DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II / transcriptional regulator Ada  41.25 
 
 		 517 aa  76.6  0.0000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.416366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2634  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 204 aa  76.3  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2635  transcriptional regulator, AraC family  25.78 
 
 		 285 aa  76.3  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.82539 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3119  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  40.59 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00676861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  27 
 
 		 346 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 293 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1638  transcriptional regulator Ada / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase / DNA-3-methyladenine glycosylase II  32.17 
 
 		 504 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.414253  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5475  transcriptional regulator, AraC family  30.61 
 
 		 305 aa  75.9  0.0000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.59164  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3000  AraC family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 515 aa  75.5  0.0000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 330 aa  75.9  0.0000000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1101  Ada metal-binding domain-containing protein  40 
 
 		 511 aa  75.5  0.0000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.12283  normal  0.610277 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3844  helix-turn-helix domain-containing protein  25.29 
 
 		 257 aa  75.5  0.0000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.290293  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  26.56 
 
 		 309 aa  75.5  0.0000000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 338 aa  75.5  0.0000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5167  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 493 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  30.19 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4071  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3450  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 492 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1001  transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 		 307 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01665  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.19 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01654  hypothetical protein  25.19 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 156 aa  74.7  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2507  transcriptional regulator, AraC family  30.39 
 
 		 291 aa  73.9  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0624  AraC family transcriptional regulator  22.75 
 
 		 299 aa  74.3  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.401422 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1250  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 263 aa  74.3  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1596  transcriptional regulator, AraC family  28.06 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  27.63 
 
 		 294 aa  74.3  0.000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2467  two component transcriptional regulator, AraC family  39.34 
 
 		 251 aa  74.7  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1935  AraC family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 303 aa  74.7  0.000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0147604 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1946  transcriptional regulator, AraC family  25.28 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.192766  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05428  transcription regulator protein  30.48 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1103  helix-turn-helix domain-containing protein  25.74 
 
 		 298 aa  73.9  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.403298  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1899  transcriptional regulator, AraC family  25.28 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2412  transcriptional regulator, AraC family  25.28 
 
 		 303 aa  73.6  0.000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  36.46 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2795  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  36.96 
 
 		 453 aa  73.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126967  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42360  transcriptional regulator, AraC family  31.63 
 
 		 318 aa  73.9  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  34.95 
 
 		 530 aa  73.9  0.000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1912  AraC family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1500  AraC family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.831009  normal  0.0187399 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0709  AraC family transcriptional regulator  27.49 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0936  transcriptional regulator, AraC family  20.97 
 
 		 289 aa  73.2  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.352467  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 148 aa  73.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5912  transcriptional regulator Ada / DNA-3-methyladenine glycosylase II / DNA-O6-methylguanine--protein-cysteine S-methyltransferase  32.67 
 
 		 500 aa  73.2  0.000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.838028 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  38.3 
 
 		 1201 aa  72.8  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2898  transcriptional regulator, AraC family  25.77 
 
 		 282 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1219  transcriptional regulator, AraC family  27.19 
 
 		 492 aa  72.8  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.627471  normal  0.0317838 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2239  AraC family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 295 aa  72.8  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2237  putative transcriptional regulator  21.19 
 
 		 278 aa  72.8  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4704  putative DNA-binding protein  26 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000153171  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1003  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 332 aa  72.4  0.000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.194559  hitchhiker  0.0000278765 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1111  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 312 aa  72.4  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3778  AraC family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 329 aa  72.4  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3318  AraC family transcriptional regulator  38 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.877504 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3175  helix-turn-helix domain-containing protein  38 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4687  AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1196  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 287 aa  72.4  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26330  AraC family transcriptional regulator  24.03 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.643276  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>