More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0166 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0166  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 284 aa  584  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0847  AraC family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 280 aa  198  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.664852 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0667  helix-turn-helix domain-containing protein  36.59 
 
 		 297 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.145223  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1299  AraC family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 285 aa  176  6e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.736083 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3718  AraC family transcriptional regulator  33.69 
 
 		 305 aa  172  6.999999999999999e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3295  transcriptional regulator, AraC family  34.63 
 
 		 285 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196416  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3708  AraC family transcriptional regulator  34.42 
 
 		 278 aa  169  6e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4722  AraC family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4820  AraC family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 274 aa  143  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6066  transcriptional regulator, AraC family  30.22 
 
 		 289 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.576026  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  34.48 
 
 		 513 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  34 
 
 		 299 aa  69.3  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  32 
 
 		 154 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3229  transcriptional regulator, AraC family  32.39 
 
 		 326 aa  65.9  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.382079  normal  0.686696 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 168 aa  65.5  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2157  two component AraC family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 250 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0322408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2090  AraC family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00753492 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5590  AraC family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 310 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4617  transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 		 296 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.107807 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 278 aa  63.9  0.000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  32.43 
 
 		 306 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1472  AraC family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 292 aa  63.5  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.327977  normal  0.780269 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  29.41 
 
 		 286 aa  63.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  32.04 
 
 		 162 aa  62  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2274  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.348217  normal  0.470943 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0810  AraC family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 306 aa  62  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4842  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 337 aa  62  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.195064 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6355  transcriptional regulator, AraC family  34.31 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0247335 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1106  AraC family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37180  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  32.67 
 
 		 297 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  33 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6041  transcriptional regulator, AraC family  36.36 
 
 		 303 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  26.85 
 
 		 515 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0296  transcriptional regulator  34.94 
 
 		 135 aa  60.8  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00196972  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  36.9 
 
 		 156 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  30.07 
 
 		 287 aa  60.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1993  transcriptional regulator, AraC family  30.77 
 
 		 508 aa  60.8  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.04683  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  28.1 
 
 		 341 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  35.16 
 
 		 288 aa  60.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2354  AraC family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0793456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  27.45 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 361 aa  59.7  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0774  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 278 aa  59.7  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000960474 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2917  transcriptional regulator, AraC family  28.04 
 
 		 118 aa  59.7  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.932782  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1862  transcriptional regulator, AraC family  32.65 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6374  transcriptional regulator, AraC family  34.38 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.169212 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  35 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 338 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6144  transcriptional regulator, AraC family  25.19 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.185797  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3053  transcriptional regulator, AraC family  31.53 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 1201 aa  58.9  0.00000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1246  AraC family transcriptional regulator  35 
 
 		 332 aa  58.9  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.481495  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0844  transcriptional regulator, AraC family  25 
 
 		 312 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3869  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  31.25 
 
 		 298 aa  58.9  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.604271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2441  helix-turn-helix, AraC type  31 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.0002572  decreased coverage  0.000290212 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0484  transcriptional regulator  30.48 
 
 		 356 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1958  response regulator receiver protein  31.25 
 
 		 530 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471781  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2707  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 150 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.766259  normal  0.0137536 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2267  AraC family transcriptional regulator  21.95 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0404948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0991  transcriptional regulator, AraC family  26.29 
 
 		 315 aa  58.5  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0397421  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27420  transcriptional regulator MtlR (AraC family)  28.7 
 
 		 299 aa  58.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.467419  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3086  transcriptional regulator, AraC family  33.01 
 
 		 296 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.164604  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  29 
 
 		 331 aa  58.5  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51400  transcriptional regulator AraC family  36.14 
 
 		 310 aa  58.5  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1134  transcriptional regulator, AraC family  26.11 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.330045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  23.33 
 
 		 301 aa  58.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000994716  hitchhiker  0.0000611237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2180  helix-turn-helix domain-containing protein  32.35 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.971115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2693  helix-turn-helix domain-containing protein  34.83 
 
 		 261 aa  58.5  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.129803  normal  0.168058 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5286  transcriptional regulator, AraC family  32.67 
 
 		 337 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.371656  normal  0.135191 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  34.57 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  32.35 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 326 aa  58.2  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1047  AraC family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 285 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3612  helix-turn-helix domain-containing protein  32.29 
 
 		 144 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3197  DNA-binding transcriptional regulator AraC  28.05 
 
 		 325 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0504834 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3482  AraC family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 140 aa  58.2  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0308  transcriptional regulator, AraC family  33.98 
 
 		 324 aa  57.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0162295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  35.8 
 
 		 328 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7377  two component AraC family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 278 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0377301  normal  0.284562 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  32.26 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2914  AraC family transcriptional regulator  25.72 
 
 		 318 aa  57  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  31.46 
 
 		 331 aa  57.4  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001441  L-rhamnose operon transcriptional activator RhaR  26.34 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0142  transcriptional regulator, AraC family  26.5 
 
 		 760 aa  57  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6995  AraC/XylS family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00467693 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3895  helix-turn-helix domain-containing protein  23.08 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2708  transcriptional activator MltR  30 
 
 		 301 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.215541  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  36.25 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05420  putative transcriptional regulator  32.94 
 
 		 264 aa  57  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0946  helix-turn-helix domain-containing protein  29.63 
 
 		 307 aa  57  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 336 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0572  AraC family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 300 aa  56.6  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4979  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3335  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.602589  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4298  AraC family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 271 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.552158  normal  0.269124 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3346  AraC family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.143712  normal  0.196941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>