More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0296 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0296  transcriptional regulator  100 
 
 		 135 aa  284  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00196972  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0423  transcriptional regulator, AraC family  65.93 
 
 		 311 aa  201  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736171  hitchhiker  0.000000152275 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 338 aa  80.9  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7634  transcriptional regulator AraC family  31.73 
 
 		 304 aa  77  0.00000000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.63081  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 348 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0804  transcriptional regulator, AraC family  28.71 
 
 		 145 aa  75.1  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2499  helix-turn-helix- domain containing protein AraC type  37.23 
 
 		 156 aa  75.1  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.401459  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 328 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  33.02 
 
 		 513 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3070  helix-turn-helix domain-containing protein  37 
 
 		 131 aa  73.9  0.0000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.362329  normal  0.0397869 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1207  putative transcriptional regulator  30.93 
 
 		 293 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3653  helix-turn-helix domain-containing protein  31.86 
 
 		 240 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2736  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.66637 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3497  AraC family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 198 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.27794  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1650  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 316 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3129  AraC family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0227  AraC family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 324 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3317  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 327 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.672566 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3833  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 327 aa  71.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.699646 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2469  AraC family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 361 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3921  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 311 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.892105 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5215  helix-turn-helix domain-containing protein  32.61 
 
 		 331 aa  71.2  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0798  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 311 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3628  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3508  AraC family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 196 aa  70.9  0.000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0210792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3156  two component transcriptional regulator, AraC family  30.08 
 
 		 515 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.949308  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1506  helix-turn-helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 240 aa  70.9  0.000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0345  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 311 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0829  AraC family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 311 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0210284  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1459  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  35.29 
 
 		 198 aa  70.5  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000164097 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3772  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  35.29 
 
 		 198 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3751  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  35.29 
 
 		 198 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000128468 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2146  AraC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536281  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1602  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 330 aa  69.7  0.00000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0091  AraC family transcriptional regulator  32.98 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2934  helix-turn-helix domain-containing protein  32.63 
 
 		 310 aa  69.3  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0219137  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0315  transcriptional regulator, AraC family  29.47 
 
 		 168 aa  69.3  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0932  AraC family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1148  transcriptional regulator, AraC family  30.85 
 
 		 309 aa  69.3  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2986  transcriptional regulator, AraC family  28.12 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3585  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  34.31 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3042  putative transcriptional regulator, AraC family, isolated domain protein  30.77 
 
 		 141 aa  68.6  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.319564  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2463  transcriptional regulator, AraC family  30.69 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.400735  normal  0.926275 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2224  AraC family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 278 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000575993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3869  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  34.31 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1284  transcriptional regulator, AraC family  36.17 
 
 		 150 aa  68.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00113344 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 333 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1806  helix-turn-helix domain-containing protein  31.86 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.851329  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4642  AraC family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 318 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6955  transcriptional regulator, AraC family  27.96 
 
 		 346 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1432  transcriptional regulator, AraC family  33.66 
 
 		 387 aa  68.2  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.185359  normal  0.618503 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1284  AraC family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 168 aa  68.6  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3485  AraC family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.781082  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0085  transcriptional regulator, AraC family  30.11 
 
 		 296 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0195711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1041  helix-turn-helix, AraC type:Arac protein, arabinose-binding/dimerisation  26.53 
 
 		 291 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29946 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3840  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  34.31 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13470  AraC family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 293 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0899227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1980  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 293 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.949603 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3788  Ada regulatory protein/6-O-methylguanine-DNA methyltransferase  34.31 
 
 		 198 aa  68.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  28 
 
 		 282 aa  67.8  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2413  transcriptional regulator, AraC family  27.27 
 
 		 322 aa  67.8  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 333 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1093  AraC family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 331 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2042  AraC family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 301 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  31.63 
 
 		 316 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3740  helix-turn-helix domain-containing protein  32.14 
 
 		 301 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.436963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1405  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 251 aa  67.4  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000697123  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  28.16 
 
 		 319 aa  67.4  0.00000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6617  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 287 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.131937 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2701  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 315 aa  67  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.137316  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5494  transcriptional regulator, AraC family  31.96 
 
 		 144 aa  67  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00194637  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1853  transcriptional regulator, AraC family  31.18 
 
 		 294 aa  67.4  0.00000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.801816 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4427  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 325 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3588  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 325 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0511949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3940  AraC family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 325 aa  67.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2058  transcriptional regulator, AraC family  31 
 
 		 286 aa  67.4  0.00000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4336  AraC family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 311 aa  67  0.00000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1909  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 315 aa  67  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.190572  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0867  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 315 aa  67  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000394258  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2046  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 291 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0173792  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3482  AraC family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 299 aa  67  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.675068  normal  0.589184 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06540  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  28.91 
 
 		 278 aa  67  0.00000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.977824 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5964  transcriptional regulator, AraC family  30.3 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1715  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  29.67 
 
 		 333 aa  66.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3203  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.10279  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3164  AraC family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0245945  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1736  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228742  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1895  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 277 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1783  AraC family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 146 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.244044  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2139  transcriptional regulator, AraC family  33.09 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.669919  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6275  transcriptional regulator, AraC family  30 
 
 		 330 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1213  transcriptional regulator, AraC family  25.51 
 
 		 291 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0489  transcriptional regulator, AraC family  34.07 
 
 		 147 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0134  AraC family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 322 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2791  AraC family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 327 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0540  transcriptional regulator, AraC family  31.68 
 
 		 289 aa  65.5  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.516999  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0009  transcriptional regulator, AraC family  30.48 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2425  transcriptional regulator, AraC family  32.98 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0298532  hitchhiker  0.00178687 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0236  AraC/XylS family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 277 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>