More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1093 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1093  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 331 aa  680    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1736  AraC family transcriptional regulator  75.08 
 
 		 333 aa  509  1e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.409703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1739  transcriptional regulator  53.25 
 
 		 329 aa  324  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.911829  normal  0.577621 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1096  transcriptional regulator  51.38 
 
 		 331 aa  317  1e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2800  AraC family transcriptional regulator  50.61 
 
 		 333 aa  309  5e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6251  transcriptional regulator, AraC family  49.84 
 
 		 331 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2791  AraC family transcriptional regulator  46.79 
 
 		 327 aa  280  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6249  transcriptional regulator, AraC family  50.33 
 
 		 356 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6275  transcriptional regulator, AraC family  47.72 
 
 		 330 aa  278  8e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1098  AraC family transcriptional regulator  47.02 
 
 		 327 aa  272  6e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3868  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 330 aa  229  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2476  AraC family transcriptional regulator  43.09 
 
 		 333 aa  227  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.336808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1458  transcriptional regulator, AraC family  44.27 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0816  transcriptional regulator, AraC family  43.23 
 
 		 327 aa  223  4e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2983  transcriptional regulator  43.49 
 
 		 331 aa  218  1e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00333809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6738  AraC family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 333 aa  190  4e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6703  AraC family transcriptional regulator  36.01 
 
 		 329 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3266  AraC family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2480  AraC family transcriptional regulator  37.46 
 
 		 354 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6170  AraC family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 356 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5902  AraC family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 356 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.271322  normal  0.206192 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3224  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3262  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 326 aa  162  7e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3276  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 348 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1350  AraC family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 349 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.956797  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3734  AraC family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7403  AraC family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.708436 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3737  AraC family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 348 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.116286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5527  AraC family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 363 aa  135  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.658693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6737  AraC family transcriptional regulator  49.61 
 
 		 251 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4476  AraC family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6256  transcriptional regulator, AraC family  29.81 
 
 		 355 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4936  AraC family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 353 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.712836 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3723  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.497805  normal  0.164029 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3801  AraC family transcriptional regulator  35.81 
 
 		 372 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.113275 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4562  AraC family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 360 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  29.39 
 
 		 322 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2295  AraC family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 309 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.289815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 334 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 324 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 324 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 324 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 322 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  26.42 
 
 		 321 aa  107  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  26.05 
 
 		 320 aa  103  3e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  28.13 
 
 		 362 aa  99.8  5e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  28 
 
 		 322 aa  99.4  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  24.77 
 
 		 338 aa  99  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  24.07 
 
 		 328 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  25.62 
 
 		 327 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  27.73 
 
 		 320 aa  96.7  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  27.51 
 
 		 341 aa  96.7  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  26.32 
 
 		 336 aa  96.7  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  27.47 
 
 		 345 aa  96.7  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 344 aa  96.7  6e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 344 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 344 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 336 aa  95.5  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  25.7 
 
 		 325 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4046  transcriptional regulator, AraC family  38 
 
 		 327 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.188489  normal  0.0112256 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  27.59 
 
 		 344 aa  95.1  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3892  transcriptional regulator, AraC family  26.96 
 
 		 332 aa  94  4e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  23.75 
 
 		 354 aa  93.6  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  35.76 
 
 		 330 aa  92.8  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  25.08 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  25.08 
 
 		 319 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 348 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0227  AraC family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 324 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  25.63 
 
 		 319 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  24.78 
 
 		 341 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 328 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4910  AraC family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 368 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942326 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  26.77 
 
 		 314 aa  89.7  6e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4299  AraC family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 323 aa  89.4  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0323  AraC family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 368 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0318  AraC family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 368 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.120478 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0298  AraC family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 368 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000218642 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 311 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 336 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  27.73 
 
 		 316 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5236  transcriptional regulator  25.29 
 
 		 367 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.59007  normal  0.0230056 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  31.72 
 
 		 341 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  24.55 
 
 		 348 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  30.52 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  25.47 
 
 		 319 aa  87.8  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  24.61 
 
 		 349 aa  87.4  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4708  helix-turn-helix, AraC type:ThiJ/PfpI  25.67 
 
 		 367 aa  87  4e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 351 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1880  AraC family transcriptional regulator  25.87 
 
 		 327 aa  86.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 321 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 387 aa  86.3  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  31.37 
 
 		 372 aa  85.9  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  28.05 
 
 		 358 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  26.3 
 
 		 345 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  25.87 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 321 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>