More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0227 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_0227  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 324 aa  661    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.583389 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  87.93 
 
 		 348 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  87.31 
 
 		 328 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  56.69 
 
 		 316 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  47.02 
 
 		 319 aa  295  1e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  46.82 
 
 		 319 aa  291  1e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  47.3 
 
 		 319 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  45.09 
 
 		 321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  44.19 
 
 		 361 aa  270  2.9999999999999997e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 331 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  43.17 
 
 		 341 aa  266  4e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  40.82 
 
 		 358 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  42.42 
 
 		 333 aa  249  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  39.68 
 
 		 344 aa  246  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 319 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  41.85 
 
 		 317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 336 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  40.61 
 
 		 336 aa  233  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  42.39 
 
 		 338 aa  230  2e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  40.18 
 
 		 362 aa  230  2e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  39.2 
 
 		 341 aa  228  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  37.82 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  40.2 
 
 		 356 aa  222  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  40.44 
 
 		 328 aa  222  8e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  34.46 
 
 		 334 aa  216  5e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  43.56 
 
 		 321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  37.95 
 
 		 338 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  43.23 
 
 		 348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  40.58 
 
 		 321 aa  212  5.999999999999999e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  39.02 
 
 		 338 aa  211  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  38.53 
 
 		 330 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  37.8 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 334 aa  210  2e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  40.81 
 
 		 328 aa  208  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  40.51 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  37.69 
 
 		 327 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  38.2 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  42.24 
 
 		 341 aa  207  3e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  32.3 
 
 		 372 aa  206  3e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  38.55 
 
 		 338 aa  206  6e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 324 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  37.19 
 
 		 324 aa  205  7e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 329 aa  205  9e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 387 aa  204  1e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 324 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  42.57 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  38.7 
 
 		 341 aa  204  2e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  40.76 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  38.72 
 
 		 335 aa  203  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  41.58 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  35.56 
 
 		 325 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  36.56 
 
 		 334 aa  202  6e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  35.06 
 
 		 329 aa  202  7e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  33.33 
 
 		 330 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  40.86 
 
 		 321 aa  200  3e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 338 aa  199  7e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  33.02 
 
 		 320 aa  198  9e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 322 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  39.32 
 
 		 311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1880  AraC family transcriptional regulator  39.94 
 
 		 327 aa  198  1.0000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  39.32 
 
 		 311 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4095  AraC family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  36.14 
 
 		 354 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4745  AraC family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3422  AraC family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 336 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 357 aa  196  4.0000000000000005e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  38.36 
 
 		 369 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.36 
 
 		 369 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 327 aa  196  6e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  38.36 
 
 		 374 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 343 aa  195  7e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  37.35 
 
 		 339 aa  195  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5148  AraC family transcriptional regulator  39.75 
 
 		 328 aa  195  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0642429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 346 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 346 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  38.36 
 
 		 346 aa  195  8.000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  40.13 
 
 		 326 aa  194  2e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  37.69 
 
 		 333 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 345 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  34.34 
 
 		 334 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  39.25 
 
 		 323 aa  192  6e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  34.26 
 
 		 331 aa  192  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  36.22 
 
 		 315 aa  192  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  35.11 
 
 		 326 aa  191  2e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  36.67 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  32.4 
 
 		 344 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  38.11 
 
 		 327 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  33.73 
 
 		 334 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  38.15 
 
 		 351 aa  188  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  36.65 
 
 		 327 aa  187  2e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 321 aa  185  9e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  35.53 
 
 		 320 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  36.06 
 
 		 334 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3120  AraC family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 324 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 324 aa  182  9.000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  36.45 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>