More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1645 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  100 
 
 		 327 aa  660    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  58.64 
 
 		 324 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  59.01 
 
 		 334 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  59.38 
 
 		 322 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 324 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  58.33 
 
 		 324 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  60.06 
 
 		 322 aa  354  1e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  60.12 
 
 		 338 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  57.54 
 
 		 338 aa  340  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  59.08 
 
 		 322 aa  338  5.9999999999999996e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  54.29 
 
 		 327 aa  329  4e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  57.54 
 
 		 338 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  56.29 
 
 		 387 aa  326  3e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  58.23 
 
 		 343 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  58.54 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  58.54 
 
 		 369 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  58.23 
 
 		 346 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  58.23 
 
 		 346 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  58.23 
 
 		 346 aa  316  3e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  58.23 
 
 		 374 aa  315  6e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4876  AraC family transcriptional regulator  60.82 
 
 		 321 aa  311  6.999999999999999e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 327 aa  298  7e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  50.78 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  50.78 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  50.78 
 
 		 321 aa  280  2e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 		 320 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  42.95 
 
 		 320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  47.11 
 
 		 335 aa  269  4e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  47.04 
 
 		 331 aa  269  5.9999999999999995e-71  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  48.35 
 
 		 338 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  47.5 
 
 		 325 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  45.86 
 
 		 336 aa  261  1e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  47.08 
 
 		 339 aa  256  4e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  45.14 
 
 		 336 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  47.74 
 
 		 312 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  44.38 
 
 		 344 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  44.69 
 
 		 345 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  44.69 
 
 		 344 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  44.69 
 
 		 344 aa  251  9.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  45.48 
 
 		 319 aa  251  2e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  46.03 
 
 		 312 aa  250  3e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  46.13 
 
 		 362 aa  249  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  44.38 
 
 		 344 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  44.38 
 
 		 344 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  44.38 
 
 		 344 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  44.38 
 
 		 344 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  44.55 
 
 		 334 aa  248  7e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  48.4 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  44.11 
 
 		 334 aa  246  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  46.77 
 
 		 322 aa  245  6e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  42.33 
 
 		 349 aa  242  7e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 351 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 363 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  46.5 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  45.65 
 
 		 317 aa  241  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 329 aa  239  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  46.5 
 
 		 334 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  48.61 
 
 		 323 aa  240  2.9999999999999997e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1912  AraC family transcriptional regulator  58.41 
 
 		 215 aa  239  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 321 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  43.96 
 
 		 321 aa  238  9e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 		 354 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  47.43 
 
 		 357 aa  237  2e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  43.87 
 
 		 321 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  45.4 
 
 		 324 aa  236  4e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  46.47 
 
 		 310 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  43.67 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  46.01 
 
 		 315 aa  234  2.0000000000000002e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  43.16 
 
 		 319 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  42.14 
 
 		 342 aa  233  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  37.89 
 
 		 334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  43.65 
 
 		 341 aa  232  8.000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  45.57 
 
 		 311 aa  231  9e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  45.25 
 
 		 312 aa  231  9e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  45.57 
 
 		 311 aa  231  9e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  43.31 
 
 		 338 aa  231  1e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  51.15 
 
 		 437 aa  231  1e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  44.03 
 
 		 375 aa  230  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  43.75 
 
 		 327 aa  229  7e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  42.25 
 
 		 319 aa  229  7e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  42.77 
 
 		 317 aa  228  9e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  43.03 
 
 		 356 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  41.72 
 
 		 314 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 320 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2164  transcriptional regulator  46.67 
 
 		 340 aa  226  3e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.0201995 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  45.79 
 
 		 320 aa  226  3e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  41.93 
 
 		 319 aa  226  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  41.16 
 
 		 341 aa  226  5.0000000000000005e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  41.36 
 
 		 328 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2581  AraC family transcriptional regulator  43.52 
 
 		 325 aa  223  3e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0339755  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3225  transcriptional regulator, AraC family  43.63 
 
 		 322 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.448526 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  41.72 
 
 		 311 aa  223  4e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  40.91 
 
 		 332 aa  222  6e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  41.85 
 
 		 313 aa  222  7e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  41.85 
 
 		 314 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  45.09 
 
 		 342 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  39.06 
 
 		 358 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>