More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0793 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 363 aa  726    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  74.72 
 
 		 375 aa  501  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  79.8 
 
 		 437 aa  454  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.71 
 
 		 338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  49.26 
 
 		 322 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  49.27 
 
 		 338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 324 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 324 aa  280  4e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  47.97 
 
 		 324 aa  279  6e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  48.82 
 
 		 342 aa  278  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  47.79 
 
 		 334 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  43.19 
 
 		 330 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 351 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  56.32 
 
 		 387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  47.38 
 
 		 339 aa  270  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  46.78 
 
 		 338 aa  268  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  45.98 
 
 		 338 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 322 aa  268  2e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  44.61 
 
 		 327 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  44.16 
 
 		 335 aa  265  1e-69  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  56.82 
 
 		 369 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  56.82 
 
 		 369 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  56.82 
 
 		 374 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 343 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 346 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  48.39 
 
 		 327 aa  262  8e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 346 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  56.44 
 
 		 346 aa  262  8e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  46.51 
 
 		 322 aa  258  9e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  44.58 
 
 		 319 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 336 aa  250  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  42.06 
 
 		 320 aa  247  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  43.93 
 
 		 334 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  41.81 
 
 		 320 aa  245  9e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 345 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  42.4 
 
 		 328 aa  243  5e-63  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  41.32 
 
 		 332 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  44.02 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  40.61 
 
 		 362 aa  236  4e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  42.56 
 
 		 341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4876  AraC family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 321 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  40.99 
 
 		 336 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  44.08 
 
 		 356 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  44.54 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  44.54 
 
 		 321 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 321 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 321 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 321 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  44.57 
 
 		 323 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  44.54 
 
 		 321 aa  234  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  42.47 
 
 		 317 aa  232  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  41.32 
 
 		 325 aa  230  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  42.69 
 
 		 341 aa  229  5e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 324 aa  225  7e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  38.29 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  41.48 
 
 		 334 aa  223  4e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  42.52 
 
 		 315 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  38.08 
 
 		 354 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  42.52 
 
 		 330 aa  220  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  42.02 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  46.18 
 
 		 320 aa  219  3.9999999999999997e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  44.83 
 
 		 333 aa  219  5e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  39.3 
 
 		 321 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  40.12 
 
 		 331 aa  217  2e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  39.59 
 
 		 321 aa  217  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2581  AraC family transcriptional regulator  42.43 
 
 		 325 aa  217  2e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0339755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  39.18 
 
 		 334 aa  216  4e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  43.59 
 
 		 344 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  44.57 
 
 		 344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  44.57 
 
 		 344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  44.57 
 
 		 344 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  39.76 
 
 		 331 aa  213  3.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.2 
 
 		 344 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.2 
 
 		 344 aa  213  4.9999999999999996e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  39.36 
 
 		 334 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  43.82 
 
 		 345 aa  213  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 		 372 aa  212  7e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3120  AraC family transcriptional regulator  46.69 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  46.34 
 
 		 322 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 336 aa  211  2e-53  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  43.45 
 
 		 314 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  39.53 
 
 		 329 aa  209  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  42.16 
 
 		 326 aa  209  5e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  39.53 
 
 		 358 aa  208  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1912  AraC family transcriptional regulator  50.89 
 
 		 215 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  44.63 
 
 		 321 aa  206  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  42.6 
 
 		 310 aa  206  5e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2164  transcriptional regulator  40.23 
 
 		 340 aa  206  6e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.0201995 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 		 319 aa  206  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 331 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 316 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 316 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 316 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  43.55 
 
 		 314 aa  204  2e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  40.23 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  40.12 
 
 		 327 aa  203  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>