More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6986 on replicon NC_012858
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
356 aa  725    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  80.12 
 
 
341 aa  557  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  68.47 
 
 
327 aa  457  1e-127  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  51.1 
 
 
319 aa  333  4e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  52.38 
 
 
317 aa  326  3e-88  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  50.32 
 
 
328 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  46.1 
 
 
319 aa  278  8e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  46.1 
 
 
319 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  46.25 
 
 
319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.48 
 
 
338 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  46.33 
 
 
321 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  45.79 
 
 
338 aa  268  7e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  43.96 
 
 
336 aa  268  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  49.21 
 
 
326 aa  267  2e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1617  transcriptional regulator  41.07 
 
 
344 aa  266  4e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  44.95 
 
 
333 aa  263  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  45.81 
 
 
321 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  45.81 
 
 
321 aa  263  4e-69  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  44.84 
 
 
341 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  45.81 
 
 
325 aa  262  8e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  41.85 
 
 
334 aa  260  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  44.41 
 
 
348 aa  261  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  45.16 
 
 
321 aa  260  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  41.69 
 
 
358 aa  260  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  46.01 
 
 
328 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  44.09 
 
 
321 aa  258  2e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  44.52 
 
 
338 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  43.67 
 
 
321 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  43.99 
 
 
321 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  43.67 
 
 
321 aa  251  1e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  44.38 
 
 
362 aa  249  5e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  45.34 
 
 
319 aa  249  5e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  41.09 
 
 
341 aa  249  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5148  AraC family transcriptional regulator  47.06 
 
 
328 aa  247  2e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0642429  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  39.56 
 
 
341 aa  247  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  43.49 
 
 
329 aa  246  4.9999999999999997e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  42.81 
 
 
327 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  40.81 
 
 
372 aa  245  8e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  39.24 
 
 
331 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  44.01 
 
 
320 aa  244  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  42.99 
 
 
336 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  44.08 
 
 
363 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  44.73 
 
 
321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  39.94 
 
 
354 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  39.51 
 
 
330 aa  243  3e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1956  transcriptional regulator  41.83 
 
 
316 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  45.32 
 
 
338 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 
331 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  43.35 
 
 
322 aa  241  1e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  43.44 
 
 
339 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  43.35 
 
 
324 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 
324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 
324 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  43.67 
 
 
322 aa  239  5e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4484  transcriptional regulator  38.92 
 
 
361 aa  239  5.999999999999999e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  42.41 
 
 
334 aa  238  9e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  44.79 
 
 
338 aa  238  9e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  44.3 
 
 
387 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  40.31 
 
 
327 aa  238  2e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  39.51 
 
 
344 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  40.74 
 
 
334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  40.27 
 
 
375 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  40.31 
 
 
349 aa  233  3e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  40.25 
 
 
351 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  43.99 
 
 
322 aa  233  5e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  42.51 
 
 
342 aa  233  5e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  40.98 
 
 
334 aa  232  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  40.56 
 
 
327 aa  232  6e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  41.16 
 
 
345 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  41.16 
 
 
344 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  41.16 
 
 
344 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  40.84 
 
 
344 aa  232  8.000000000000001e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  41.72 
 
 
334 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5245  AraC family transcriptional regulator  39.53 
 
 
328 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.608948  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1880  AraC family transcriptional regulator  44.55 
 
 
327 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  43.03 
 
 
327 aa  231  1e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  48.84 
 
 
437 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  39.75 
 
 
344 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.75 
 
 
344 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4095  AraC family transcriptional regulator  44.94 
 
 
336 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4745  AraC family transcriptional regulator  44.94 
 
 
336 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.75 
 
 
344 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3422  AraC family transcriptional regulator  44.94 
 
 
336 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.75 
 
 
344 aa  230  2e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  39.2 
 
 
348 aa  230  3e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  40.38 
 
 
325 aa  229  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  41.64 
 
 
338 aa  229  5e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  40.43 
 
 
330 aa  229  6e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  43.3 
 
 
323 aa  228  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  39.51 
 
 
345 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  43.03 
 
 
369 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  43.03 
 
 
369 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  43.03 
 
 
374 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  43.79 
 
 
336 aa  223  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  38.39 
 
 
329 aa  223  4e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  43.03 
 
 
343 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  43.03 
 
 
346 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  43.03 
 
 
346 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  43.03 
 
 
346 aa  222  6e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3120  AraC family transcriptional regulator  40.51 
 
 
324 aa  222  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>