More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_40600 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  98.2 
 
 
334 aa  657    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  100 
 
 
334 aa  669    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2164  transcriptional regulator  75.23 
 
 
340 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.0201995 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.85 
 
 
338 aa  285  8e-76  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  50.46 
 
 
338 aa  275  5e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  43.5 
 
 
336 aa  263  2e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  46.67 
 
 
322 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  44.44 
 
 
339 aa  255  9e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  45.29 
 
 
362 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  47.24 
 
 
387 aa  252  7e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  49.4 
 
 
338 aa  251  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  44.71 
 
 
327 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  45.26 
 
 
322 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  43.84 
 
 
336 aa  249  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  45.57 
 
 
324 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  45.57 
 
 
324 aa  248  7e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  45.57 
 
 
324 aa  248  9e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  43.08 
 
 
319 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  48.46 
 
 
369 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  48.46 
 
 
374 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  48.46 
 
 
346 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  48.46 
 
 
369 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  48.46 
 
 
346 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  48.46 
 
 
346 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  48.46 
 
 
343 aa  245  9e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  48.17 
 
 
327 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  43.64 
 
 
338 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  44.85 
 
 
357 aa  243  5e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  44.95 
 
 
334 aa  242  6e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  41.67 
 
 
349 aa  242  6e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  41.69 
 
 
321 aa  241  1e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  45.57 
 
 
322 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  46.5 
 
 
327 aa  241  2e-62  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  43.21 
 
 
317 aa  241  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  40.12 
 
 
341 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  43.16 
 
 
328 aa  239  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  43.36 
 
 
334 aa  238  1e-61  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  42.64 
 
 
329 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  46.22 
 
 
320 aa  237  2e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  42.33 
 
 
348 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  42.33 
 
 
321 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  41.36 
 
 
341 aa  235  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  42.02 
 
 
341 aa  235  7e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  41.16 
 
 
325 aa  235  9e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 
332 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  42.6 
 
 
321 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  43.99 
 
 
327 aa  233  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  42.6 
 
 
321 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  37.08 
 
 
330 aa  232  7.000000000000001e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  42.33 
 
 
338 aa  232  7.000000000000001e-60  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  42.33 
 
 
325 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  41.69 
 
 
351 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  37.65 
 
 
358 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  43.03 
 
 
321 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  41.99 
 
 
321 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  43.03 
 
 
321 aa  231  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  42.73 
 
 
321 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  43.75 
 
 
310 aa  229  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  40.84 
 
 
335 aa  229  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  41.03 
 
 
331 aa  228  1e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  42.47 
 
 
338 aa  228  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  42.77 
 
 
328 aa  228  1e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  39.88 
 
 
333 aa  227  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  40.18 
 
 
319 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1880  AraC family transcriptional regulator  46.18 
 
 
327 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  42.51 
 
 
330 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  40.23 
 
 
346 aa  227  2e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  41.14 
 
 
331 aa  226  3e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  42.94 
 
 
321 aa  226  3e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  42.9 
 
 
336 aa  226  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  41.52 
 
 
345 aa  226  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  48.44 
 
 
437 aa  225  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  43.61 
 
 
319 aa  223  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  40.98 
 
 
356 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  39.14 
 
 
341 aa  223  3e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  40.8 
 
 
320 aa  222  6e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 
320 aa  222  6e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  38.89 
 
 
319 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  39.82 
 
 
327 aa  221  1.9999999999999999e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  37.31 
 
 
334 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
324 aa  220  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  40.18 
 
 
345 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  40.18 
 
 
344 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  40.18 
 
 
344 aa  219  5e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  37.85 
 
 
354 aa  219  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  39.58 
 
 
344 aa  219  7.999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1219  transcriptional regulator  41.09 
 
 
329 aa  217  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4095  AraC family transcriptional regulator  43.2 
 
 
336 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  40.17 
 
 
375 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4745  AraC family transcriptional regulator  43.2 
 
 
336 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3422  AraC family transcriptional regulator  43.2 
 
 
336 aa  217  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  39.88 
 
 
344 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  41.47 
 
 
338 aa  217  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.88 
 
 
344 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.88 
 
 
344 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  39.88 
 
 
344 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5005  AraC family transcriptional regulator  38.84 
 
 
331 aa  216  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.081564 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  41.36 
 
 
311 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  41.36 
 
 
311 aa  216  5e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  39.2 
 
 
320 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>