More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_5675 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
320 aa  622  1e-177  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  54.4 
 
 
321 aa  304  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  53.46 
 
 
324 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  53.46 
 
 
324 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  54.4 
 
 
321 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  54.4 
 
 
321 aa  301  8.000000000000001e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  53.14 
 
 
324 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  53.63 
 
 
322 aa  300  2e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  52.05 
 
 
322 aa  295  7e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  52.37 
 
 
334 aa  294  1e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.78 
 
 
338 aa  293  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  53.63 
 
 
322 aa  287  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  48.41 
 
 
319 aa  285  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  52.05 
 
 
320 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  50.47 
 
 
338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  50.81 
 
 
338 aa  279  4e-74  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  46.79 
 
 
327 aa  277  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  51.89 
 
 
336 aa  275  5e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  48.56 
 
 
317 aa  272  4.0000000000000004e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 
387 aa  272  6e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  45.11 
 
 
336 aa  270  2.9999999999999997e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  50.31 
 
 
357 aa  269  4e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  46.75 
 
 
342 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  43.93 
 
 
341 aa  267  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  50.77 
 
 
338 aa  266  5e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  46.25 
 
 
327 aa  265  5.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  47.96 
 
 
328 aa  265  5.999999999999999e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  44.01 
 
 
356 aa  264  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  50.94 
 
 
323 aa  262  6e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  46.42 
 
 
362 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  47.22 
 
 
327 aa  260  2e-68  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 
325 aa  260  3e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  44.48 
 
 
325 aa  258  7e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  45.4 
 
 
336 aa  258  7e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  48.71 
 
 
321 aa  258  7e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  48.29 
 
 
338 aa  258  9e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  47.39 
 
 
339 aa  258  9e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  45.69 
 
 
319 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  48.25 
 
 
328 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  44.59 
 
 
319 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  46.13 
 
 
341 aa  255  7e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  47.96 
 
 
351 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  46.22 
 
 
334 aa  255  8e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  46.22 
 
 
334 aa  255  9e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  47.5 
 
 
330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1880  AraC family transcriptional regulator  48.29 
 
 
327 aa  253  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  48.39 
 
 
348 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 
343 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1008  Fis family transcriptional regulator  46.67 
 
 
346 aa  253  3e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.254492 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  47.04 
 
 
338 aa  253  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  44.69 
 
 
332 aa  253  3e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 
346 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 
321 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  50.32 
 
 
327 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 
321 aa  253  3e-66  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 
346 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  49.84 
 
 
374 aa  253  3e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 
346 aa  253  3e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  49.84 
 
 
369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  49.84 
 
 
369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  49.35 
 
 
321 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  44.69 
 
 
335 aa  252  5.000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  41.38 
 
 
334 aa  251  1e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  47.42 
 
 
341 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  47.65 
 
 
321 aa  250  2e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  43.77 
 
 
319 aa  248  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  47.15 
 
 
315 aa  248  1e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  49.24 
 
 
333 aa  248  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  45.79 
 
 
327 aa  246  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  41.67 
 
 
349 aa  245  8e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4095  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 
336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4745  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 
336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3422  AraC family transcriptional regulator  45 
 
 
336 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  43.85 
 
 
321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  43.85 
 
 
321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  47.54 
 
 
319 aa  243  3e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  49.31 
 
 
437 aa  243  3e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  43.53 
 
 
321 aa  242  5e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5148  AraC family transcriptional regulator  48.12 
 
 
328 aa  242  7e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0642429  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  46.18 
 
 
363 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  38.87 
 
 
320 aa  241  9e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  50 
 
 
375 aa  241  1e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  46.98 
 
 
324 aa  240  2e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  37.58 
 
 
330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  45.45 
 
 
312 aa  239  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  42.33 
 
 
331 aa  239  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.59 
 
 
344 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.59 
 
 
344 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  48.74 
 
 
326 aa  239  5.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5829  AraC family transcriptional regulator  44.88 
 
 
338 aa  239  5.999999999999999e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  42.59 
 
 
345 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  42.27 
 
 
344 aa  238  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  44.81 
 
 
322 aa  238  1e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  42.9 
 
 
344 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  43.2 
 
 
345 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.9 
 
 
344 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.9 
 
 
344 aa  237  2e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>