More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3120 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009832  Spro_3120  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 
324 aa  662    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1844  transcriptional regulator, AraC family  66.56 
 
 
326 aa  458  9.999999999999999e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  43.35 
 
 
336 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  42.95 
 
 
327 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  43.77 
 
 
319 aa  252  6e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  42.32 
 
 
341 aa  248  1e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  40.62 
 
 
334 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  43.3 
 
 
345 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  43.3 
 
 
344 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  43.3 
 
 
344 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  43.08 
 
 
344 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  38.08 
 
 
330 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  42.99 
 
 
344 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.99 
 
 
344 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.99 
 
 
344 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.99 
 
 
344 aa  242  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  39.87 
 
 
341 aa  241  1e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  45.34 
 
 
324 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  45.31 
 
 
322 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  51.19 
 
 
339 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  44.72 
 
 
324 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  41.3 
 
 
328 aa  238  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  44.72 
 
 
324 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  44.1 
 
 
322 aa  237  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  41.25 
 
 
372 aa  236  4e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  43.61 
 
 
334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  40.51 
 
 
356 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  45.92 
 
 
437 aa  235  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  43.65 
 
 
334 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  43.48 
 
 
334 aa  233  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 
351 aa  232  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  44.86 
 
 
375 aa  229  4e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  45.08 
 
 
320 aa  229  4e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  46.69 
 
 
363 aa  228  7e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  47.79 
 
 
387 aa  228  1e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  40.43 
 
 
354 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  40.24 
 
 
345 aa  227  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.63 
 
 
338 aa  227  2e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  47.62 
 
 
334 aa  227  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  42.53 
 
 
338 aa  226  3e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  42.81 
 
 
331 aa  226  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  41.56 
 
 
327 aa  226  4e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  41.74 
 
 
338 aa  226  4e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  41.9 
 
 
336 aa  225  8e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  39.43 
 
 
358 aa  225  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  44.72 
 
 
322 aa  224  1e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  40.56 
 
 
328 aa  224  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  46.1 
 
 
362 aa  223  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  41.69 
 
 
321 aa  224  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  41.69 
 
 
321 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  41.69 
 
 
321 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  41.69 
 
 
321 aa  223  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  41.69 
 
 
321 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  41.69 
 
 
321 aa  223  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  44.87 
 
 
338 aa  222  6e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  39.01 
 
 
319 aa  222  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  42.06 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  41.72 
 
 
338 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  40.31 
 
 
321 aa  220  3e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  38.96 
 
 
319 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  41.42 
 
 
319 aa  219  7e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  40.25 
 
 
321 aa  218  7.999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
321 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  40 
 
 
321 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1615  transcriptional regulator  38.08 
 
 
333 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  37.61 
 
 
344 aa  217  2e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  41.56 
 
 
357 aa  216  2.9999999999999998e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  44.27 
 
 
335 aa  216  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  41.08 
 
 
348 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  41.08 
 
 
321 aa  216  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  40.13 
 
 
341 aa  215  7e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  41.8 
 
 
326 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  39.18 
 
 
349 aa  214  9.999999999999999e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  40.44 
 
 
311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  40.44 
 
 
311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  40.72 
 
 
317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  40.37 
 
 
320 aa  213  3.9999999999999995e-54  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  39.06 
 
 
321 aa  211  1e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1880  AraC family transcriptional regulator  41.9 
 
 
327 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  40.76 
 
 
321 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  40.76 
 
 
321 aa  211  1e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  41.12 
 
 
310 aa  211  2e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  40.45 
 
 
321 aa  210  2e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5155  AraC family transcriptional regulator  37.58 
 
 
348 aa  210  3e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.976904 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  49.2 
 
 
346 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  49.2 
 
 
346 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  49.2 
 
 
346 aa  209  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  49.2 
 
 
369 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  49.2 
 
 
374 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  49.2 
 
 
369 aa  209  7e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  49.2 
 
 
343 aa  208  8e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  38.01 
 
 
320 aa  208  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  41.1 
 
 
325 aa  208  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  44.27 
 
 
327 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  42.72 
 
 
323 aa  206  3e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4246  AraC family transcriptional regulator  37.07 
 
 
319 aa  206  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  43.94 
 
 
315 aa  206  3e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  46.06 
 
 
316 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  46.06 
 
 
316 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  46.06 
 
 
316 aa  206  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0566116 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>