More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1581 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  100 
 
 
335 aa  685    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  52.63 
 
 
338 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  51.68 
 
 
327 aa  326  4.0000000000000003e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  52.81 
 
 
387 aa  324  1e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  50.31 
 
 
324 aa  317  1e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  50 
 
 
332 aa  317  1e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.07 
 
 
338 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  50.31 
 
 
324 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  50.31 
 
 
324 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  51.4 
 
 
322 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  54.09 
 
 
343 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 
322 aa  310  2.9999999999999997e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  54.09 
 
 
346 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  54.09 
 
 
369 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  54.09 
 
 
369 aa  309  4e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  54.09 
 
 
346 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  54.09 
 
 
346 aa  309  4e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  53.12 
 
 
374 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  50.76 
 
 
338 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  49.84 
 
 
334 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 
322 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  47.8 
 
 
334 aa  296  3e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  48.78 
 
 
338 aa  288  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  52.04 
 
 
327 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  45.73 
 
 
342 aa  281  2e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  44.51 
 
 
325 aa  278  7e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  46.32 
 
 
351 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  47.11 
 
 
327 aa  269  4e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  45.79 
 
 
339 aa  265  8.999999999999999e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  44.16 
 
 
363 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4876  AraC family transcriptional regulator  51.27 
 
 
321 aa  261  1e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  46.79 
 
 
311 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  46.79 
 
 
311 aa  260  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
324 aa  256  3e-67  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  44.27 
 
 
362 aa  255  7e-67  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2581  AraC family transcriptional regulator  44.82 
 
 
325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0339755  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  42.9 
 
 
312 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  42.33 
 
 
336 aa  252  6e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  43.37 
 
 
336 aa  251  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  46.54 
 
 
321 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  43.12 
 
 
320 aa  249  4e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  46.54 
 
 
321 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  46.54 
 
 
321 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  46.54 
 
 
321 aa  249  5e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  42.77 
 
 
328 aa  249  5e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  46.54 
 
 
321 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  46.54 
 
 
321 aa  249  5e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  44.65 
 
 
338 aa  249  7e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0468  AraC family transcriptional regulator  44.75 
 
 
357 aa  249  7e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  43.95 
 
 
319 aa  248  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  45.6 
 
 
317 aa  248  1e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  42.9 
 
 
317 aa  245  6e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  42.33 
 
 
334 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  44.82 
 
 
328 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  48.44 
 
 
437 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  41.72 
 
 
315 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  42.41 
 
 
331 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  45.02 
 
 
310 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  43.38 
 
 
375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  43.91 
 
 
322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  42.41 
 
 
321 aa  243  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  43.95 
 
 
312 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  42.25 
 
 
341 aa  242  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2560  transcriptional regulator, AraC family  45.62 
 
 
333 aa  240  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  42.68 
 
 
316 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  44.69 
 
 
320 aa  240  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  44.23 
 
 
318 aa  239  5.999999999999999e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  40.06 
 
 
320 aa  238  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  42.63 
 
 
345 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.63 
 
 
344 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.63 
 
 
344 aa  237  2e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  39.69 
 
 
354 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  42.19 
 
 
344 aa  236  4e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  43.91 
 
 
318 aa  235  7e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  42.54 
 
 
342 aa  235  8e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1145  AraC family transcriptional regulator  45.11 
 
 
326 aa  235  9e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.480921  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6979  transcriptional regulator, AraC family  41.4 
 
 
319 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  42.32 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.32 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.32 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  40.75 
 
 
321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0208  ThiJ/PfpI domain-containing protein  43.91 
 
 
318 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0903161  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  39.81 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.32 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  41.34 
 
 
334 aa  233  3e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  41.48 
 
 
314 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  42.28 
 
 
320 aa  232  5e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  40.5 
 
 
321 aa  233  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2640  AraC family transcriptional regulator  40.57 
 
 
329 aa  232  7.000000000000001e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708344  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  44.44 
 
 
323 aa  232  8.000000000000001e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3004  transcriptional regulator  41.08 
 
 
319 aa  232  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000291789  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  41.12 
 
 
321 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  42.31 
 
 
311 aa  231  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  42.9 
 
 
317 aa  231  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2043  transcriptional regulator, AraC family  44.14 
 
 
330 aa  231  1e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.437  normal  0.109712 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2747  transcriptional regulator  43.03 
 
 
338 aa  230  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  43.49 
 
 
312 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  41.61 
 
 
322 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  40.38 
 
 
321 aa  230  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  40.5 
 
 
321 aa  230  3e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>