More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3583 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 314 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  68.49 
 
 		 316 aa  428  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  66.24 
 
 		 314 aa  427  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  65.26 
 
 		 311 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  65.03 
 
 		 312 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  63.26 
 
 		 317 aa  408  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  64.29 
 
 		 313 aa  408  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  65 
 
 		 311 aa  404  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  62.34 
 
 		 322 aa  401  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  62.42 
 
 		 342 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  63.96 
 
 		 317 aa  398  9.999999999999999e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  63.99 
 
 		 313 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  61.89 
 
 		 318 aa  388  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  60.91 
 
 		 318 aa  385  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0208  ThiJ/PfpI domain-containing protein  60.91 
 
 		 318 aa  383  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0903161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  58.82 
 
 		 321 aa  369  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4060  AraC family transcriptional regulator  61.15 
 
 		 321 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4306  AraC family transcriptional regulator  61.15 
 
 		 321 aa  369  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.730191 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1705  transcriptional regulator  61.09 
 
 		 319 aa  367  1e-100  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4728  transcriptional regulator, AraC family  60.06 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.900949 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3211  AraC family transcriptional regulator  60.83 
 
 		 321 aa  366  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6170  AraC family transcriptional regulator  59.42 
 
 		 318 aa  364  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396266 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3069  AraC family transcriptional regulator  58.97 
 
 		 316 aa  361  9e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3724  AraC family transcriptional regulator  59.87 
 
 		 330 aa  360  2e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4200  AraC family transcriptional regulator  59.87 
 
 		 319 aa  359  4e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4299  AraC family transcriptional regulator  59.49 
 
 		 323 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  59.15 
 
 		 316 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2717  transcriptional regulator  56.45 
 
 		 325 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  59.15 
 
 		 316 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  59.15 
 
 		 316 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1900  transcriptional regulator  58.52 
 
 		 320 aa  354  8.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 326 aa  323  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1650  AraC family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 339 aa  318  6e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3749  transcriptional regulator, AraC family  53.16 
 
 		 320 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0790195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4826  transcriptional regulator, AraC family  53.16 
 
 		 320 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 324 aa  310  2e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4441  AraC family transcriptional regulator  52.75 
 
 		 318 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  51.66 
 
 		 312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  50.16 
 
 		 312 aa  296  4e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  50.81 
 
 		 315 aa  295  7e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  48.55 
 
 		 317 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3880  AraC family transcriptional regulator  47.88 
 
 		 315 aa  292  5e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511713 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4722  AraC family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 315 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3641  AraC family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 315 aa  292  6e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500606  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  50.16 
 
 		 312 aa  287  2e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6258  AraC family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 315 aa  285  9e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5953  AraC family transcriptional regulator  47.56 
 
 		 315 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  49.51 
 
 		 322 aa  282  5.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  51.44 
 
 		 315 aa  282  6.000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  49.37 
 
 		 331 aa  278  7e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  47.77 
 
 		 312 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  46.1 
 
 		 310 aa  261  1e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  45.51 
 
 		 311 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  45.51 
 
 		 311 aa  256  4e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  44.65 
 
 		 338 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  42.49 
 
 		 332 aa  238  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  43.18 
 
 		 338 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  44.34 
 
 		 338 aa  235  8e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  41.48 
 
 		 335 aa  233  4.0000000000000004e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  42.36 
 
 		 322 aa  230  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  41.21 
 
 		 334 aa  229  6e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  43.13 
 
 		 339 aa  228  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  42.09 
 
 		 328 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  41.72 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 324 aa  227  2e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  44.32 
 
 		 327 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 324 aa  226  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  41.08 
 
 		 322 aa  226  4e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 336 aa  226  6e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  39.87 
 
 		 354 aa  225  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  42.49 
 
 		 344 aa  225  9e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.41 
 
 		 344 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  42.41 
 
 		 345 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.41 
 
 		 344 aa  223  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 344 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.09 
 
 		 344 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.09 
 
 		 344 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.09 
 
 		 344 aa  220  3e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 334 aa  219  6e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  48.18 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  41.03 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 351 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  41.03 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  39.31 
 
 		 336 aa  216  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  41.46 
 
 		 338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  39.88 
 
 		 334 aa  213  3.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2415  AraC family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 345 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  40.13 
 
 		 328 aa  211  1e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  43.45 
 
 		 363 aa  210  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  40.25 
 
 		 362 aa  211  2e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  40.88 
 
 		 321 aa  211  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  39.01 
 
 		 327 aa  209  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  40.97 
 
 		 342 aa  208  9e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  39.87 
 
 		 319 aa  208  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  41.31 
 
 		 317 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  38.66 
 
 		 321 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  48.58 
 
 		 369 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  48.58 
 
 		 369 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>