More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6950 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  100 
 
 		 310 aa  620  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  76.77 
 
 		 311 aa  471  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  76.77 
 
 		 311 aa  471  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  54.63 
 
 		 331 aa  318  6e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  54.9 
 
 		 312 aa  318  9e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  55.08 
 
 		 312 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  54.69 
 
 		 324 aa  306  2.0000000000000002e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  53.11 
 
 		 322 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  55.63 
 
 		 312 aa  295  9e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  51.78 
 
 		 315 aa  291  1e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  51.28 
 
 		 338 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  47.08 
 
 		 314 aa  271  1e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  52.23 
 
 		 338 aa  270  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  50.96 
 
 		 338 aa  269  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 342 aa  266  4e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  47.1 
 
 		 311 aa  264  1e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  47.42 
 
 		 313 aa  261  8.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  46.1 
 
 		 314 aa  261  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  48.4 
 
 		 322 aa  259  4e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  47.13 
 
 		 327 aa  259  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  47.71 
 
 		 316 aa  259  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 324 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  47.74 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 322 aa  257  2e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  47.76 
 
 		 324 aa  256  4e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  47.44 
 
 		 334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3749  transcriptional regulator, AraC family  49.19 
 
 		 320 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0790195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4826  transcriptional regulator, AraC family  49.19 
 
 		 320 aa  252  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478935  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  45.66 
 
 		 319 aa  251  1e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0208  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.75 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0903161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  47.1 
 
 		 318 aa  248  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  50.48 
 
 		 387 aa  247  2e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  46.75 
 
 		 318 aa  247  2e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  47.59 
 
 		 322 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 316 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  50.16 
 
 		 327 aa  245  6.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4200  AraC family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  44.95 
 
 		 312 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  45.02 
 
 		 335 aa  244  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1705  transcriptional regulator  43.18 
 
 		 319 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3724  AraC family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 330 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4299  AraC family transcriptional regulator  44.16 
 
 		 323 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  44.73 
 
 		 338 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  45.31 
 
 		 315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3211  AraC family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 321 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  43.83 
 
 		 317 aa  242  5e-63  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  46.71 
 
 		 311 aa  241  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  43.79 
 
 		 317 aa  239  2.9999999999999997e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  43.13 
 
 		 325 aa  239  5e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  46.47 
 
 		 327 aa  236  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 313 aa  235  7e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4060  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4306  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.730191 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6170  AraC family transcriptional regulator  45.78 
 
 		 318 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396266 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 334 aa  232  5e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 321 aa  232  6e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  42.95 
 
 		 336 aa  231  9e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 336 aa  230  2e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4876  AraC family transcriptional regulator  51.94 
 
 		 321 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.395791  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 343 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  49.84 
 
 		 369 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  49.84 
 
 		 369 aa  230  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  43.17 
 
 		 339 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5399  transcriptional regulator  42.41 
 
 		 321 aa  230  3e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654414  hitchhiker  0.00149287 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 346 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  49.84 
 
 		 374 aa  229  3e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 334 aa  229  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 346 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  49.84 
 
 		 346 aa  229  3e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4722  AraC family transcriptional regulator  44.01 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3641  AraC family transcriptional regulator  44.01 
 
 		 315 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500606  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 321 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 321 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 321 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  47.68 
 
 		 321 aa  229  6e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3880  AraC family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 315 aa  229  6e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511713 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  47.68 
 
 		 321 aa  229  6e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  45.89 
 
 		 323 aa  228  7e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4728  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 		 318 aa  228  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.900949 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  47.35 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 321 aa  227  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  42.77 
 
 		 362 aa  227  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6258  AraC family transcriptional regulator  45.95 
 
 		 315 aa  226  5.0000000000000005e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 321 aa  226  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  43.87 
 
 		 328 aa  225  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2717  transcriptional regulator  42.53 
 
 		 325 aa  225  9e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  43.23 
 
 		 328 aa  225  9e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  43.26 
 
 		 320 aa  223  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 326 aa  223  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5953  AraC family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 315 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884955  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  43.79 
 
 		 317 aa  222  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  41.83 
 
 		 338 aa  222  6e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5085  transcriptional regulator, AraC family  40.95 
 
 		 358 aa  221  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.145128  normal  0.0831016 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4441  AraC family transcriptional regulator  42.58 
 
 		 318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  41.69 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  42.01 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>