More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7238 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  100 
 
 
315 aa  635    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6258  AraC family transcriptional regulator  91.11 
 
 
315 aa  565  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3880  AraC family transcriptional regulator  89.21 
 
 
315 aa  561  1.0000000000000001e-159  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.511713 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5953  AraC family transcriptional regulator  90.79 
 
 
315 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884955  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4722  AraC family transcriptional regulator  88.57 
 
 
315 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3641  AraC family transcriptional regulator  88.57 
 
 
315 aa  559  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500606  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4826  transcriptional regulator, AraC family  56.09 
 
 
320 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478935  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3749  transcriptional regulator, AraC family  56.09 
 
 
320 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0790195  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  50.66 
 
 
317 aa  306  3e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  51.32 
 
 
311 aa  296  2e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  49.35 
 
 
314 aa  296  4e-79  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  49.84 
 
 
322 aa  295  6e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  50.48 
 
 
342 aa  295  6e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  50.8 
 
 
321 aa  295  7e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  50.81 
 
 
314 aa  295  7e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  50.16 
 
 
312 aa  293  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  48.71 
 
 
317 aa  293  3e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  49.03 
 
 
313 aa  292  5e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  48.25 
 
 
316 aa  291  7e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  48.71 
 
 
311 aa  291  8e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  48.87 
 
 
318 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0208  ThiJ/PfpI domain-containing protein  49.2 
 
 
318 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0903161  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  50.16 
 
 
318 aa  282  5.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3724  AraC family transcriptional regulator  49.05 
 
 
330 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4200  AraC family transcriptional regulator  48.73 
 
 
319 aa  280  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1900  transcriptional regulator  48.09 
 
 
320 aa  276  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  48.56 
 
 
313 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  50.36 
 
 
316 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  50.36 
 
 
316 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  50.36 
 
 
316 aa  276  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1705  transcriptional regulator  47.47 
 
 
319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4299  AraC family transcriptional regulator  46.5 
 
 
323 aa  273  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4060  AraC family transcriptional regulator  48.25 
 
 
321 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380555  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4306  AraC family transcriptional regulator  48.25 
 
 
321 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.730191 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  46.62 
 
 
324 aa  269  5.9999999999999995e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3211  AraC family transcriptional regulator  47.15 
 
 
321 aa  267  2e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119122  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  46.3 
 
 
312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  45.98 
 
 
312 aa  264  1e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1650  AraC family transcriptional regulator  50 
 
 
339 aa  264  1e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3069  AraC family transcriptional regulator  43.59 
 
 
316 aa  262  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00244653  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2717  transcriptional regulator  43.17 
 
 
325 aa  260  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  44.13 
 
 
326 aa  259  3e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  47.44 
 
 
315 aa  259  5.0000000000000005e-68  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6170  AraC family transcriptional regulator  44.34 
 
 
318 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00396266 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4441  AraC family transcriptional regulator  46.79 
 
 
318 aa  251  1e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  43.31 
 
 
322 aa  249  5e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4728  transcriptional regulator, AraC family  44.9 
 
 
318 aa  248  7e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.900949 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  45.87 
 
 
312 aa  247  2e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  43.22 
 
 
331 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 
311 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  45.45 
 
 
311 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
312 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  44.44 
 
 
312 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  45.31 
 
 
310 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  45.39 
 
 
338 aa  241  1e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  42.72 
 
 
317 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  45.07 
 
 
338 aa  231  1e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  44.33 
 
 
322 aa  225  9e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  44.85 
 
 
322 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  42.26 
 
 
335 aa  223  4.9999999999999996e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
324 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
324 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  44.67 
 
 
324 aa  222  7e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  41.95 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  41.45 
 
 
332 aa  219  5e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  43 
 
 
334 aa  219  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  39.87 
 
 
349 aa  214  1.9999999999999998e-54  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  40.25 
 
 
319 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  44.01 
 
 
338 aa  211  9e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  44.48 
 
 
322 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  39.94 
 
 
334 aa  206  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  41.35 
 
 
338 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  40.13 
 
 
387 aa  206  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  41.35 
 
 
339 aa  205  8e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  42.86 
 
 
351 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  41.08 
 
 
327 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  39.48 
 
 
325 aa  202  6e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  38.61 
 
 
344 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  41.94 
 
 
342 aa  201  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 
344 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  38.61 
 
 
345 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.61 
 
 
344 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  40 
 
 
327 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 
336 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  41.78 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  38.29 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  41.78 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  41.78 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  41.78 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.29 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.29 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  41.78 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  41.78 
 
 
321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  38.29 
 
 
344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  39.74 
 
 
341 aa  196  6e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2581  AraC family transcriptional regulator  40.84 
 
 
325 aa  194  1e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0339755  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  35.85 
 
 
354 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4365  AraC family transcriptional regulator  37.23 
 
 
324 aa  194  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  39.17 
 
 
341 aa  193  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2121  transcriptional regulator, AraC family  36.22 
 
 
341 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>