More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3749 on replicon NC_012857
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4826  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 320 aa  635    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.478935  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3749  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 320 aa  635    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0790195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4475  transcriptional regulator  57.01 
 
 		 311 aa  355  6.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072916 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6096  AraC family transcriptional regulator  58.86 
 
 		 342 aa  349  5e-95  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0128  transcriptional regulator, AraC family  56.09 
 
 		 314 aa  347  1e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3969  transcriptional regulator, AraC family  55.59 
 
 		 313 aa  343  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7238  transcriptional regulator  56.09 
 
 		 315 aa  340  2e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.402407  normal  0.120552 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  56.65 
 
 		 316 aa  338  8e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  53.87 
 
 		 314 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3263  transcriptional regulator  55.84 
 
 		 322 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4719  AraC family transcriptional regulator  54.49 
 
 		 317 aa  332  7.000000000000001e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  53.61 
 
 		 324 aa  323  2e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  53.33 
 
 		 317 aa  322  7e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0719  transcriptional regulator, AraC family  54.78 
 
 		 318 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2955  AraC family transcriptional regulator  54.49 
 
 		 321 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.743835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0208  ThiJ/PfpI domain-containing protein  54.78 
 
 		 318 aa  320  3e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0903161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0152  transcriptional regulator, AraC family  54.78 
 
 		 318 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.143566 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3880  AraC family transcriptional regulator  53.99 
 
 		 315 aa  316  3e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.511713 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5953  AraC family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 315 aa  315  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.884955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4722  AraC family transcriptional regulator  53.35 
 
 		 315 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4201  AraC family transcriptional regulator  53.21 
 
 		 312 aa  315  5e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3641  AraC family transcriptional regulator  53.35 
 
 		 315 aa  315  5e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0500606  normal  0.893051 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6258  AraC family transcriptional regulator  55.13 
 
 		 315 aa  315  6e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3567  AraC family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 311 aa  315  8e-85  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.138362 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2886  AraC family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 322 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0162981  normal  0.0527553 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4229  transcriptional regulator  53.38 
 
 		 312 aa  310  2e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  53.23 
 
 		 315 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2701  transcriptional regulator, AraC family  52.58 
 
 		 312 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0248694  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4728  transcriptional regulator, AraC family  52.56 
 
 		 318 aa  298  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.900949 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4522  AraC family transcriptional regulator  50.16 
 
 		 313 aa  291  1e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0983647  decreased coverage  0.00465183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3030  AraC family transcriptional regulator  53.47 
 
 		 312 aa  290  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.331387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6170  AraC family transcriptional regulator  50.64 
 
 		 318 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00396266 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3724  AraC family transcriptional regulator  49.2 
 
 		 330 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.135775  normal  0.890756 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1705  transcriptional regulator  48.88 
 
 		 319 aa  288  1e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5069  AraC family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 316 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3160  AraC family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 316 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5208  AraC family transcriptional regulator  50.81 
 
 		 316 aa  288  1e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0566116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4060  AraC family transcriptional regulator  50.16 
 
 		 321 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.380555  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4200  AraC family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 319 aa  286  4e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.90323  normal  0.0968553 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4306  AraC family transcriptional regulator  50.16 
 
 		 321 aa  286  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.730191 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  48.22 
 
 		 331 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1650  AraC family transcriptional regulator  52.58 
 
 		 339 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.225984 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3211  AraC family transcriptional regulator  49.52 
 
 		 321 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.119122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1900  transcriptional regulator  48.73 
 
 		 320 aa  280  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2717  transcriptional regulator  46.98 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.787301 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3069  AraC family transcriptional regulator  47.65 
 
 		 316 aa  280  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00244653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4299  AraC family transcriptional regulator  48.88 
 
 		 323 aa  279  4e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  49.19 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  50.32 
 
 		 311 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  50.32 
 
 		 311 aa  268  7e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5075  AraC family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 326 aa  266  4e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  46.18 
 
 		 338 aa  265  8e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  46.5 
 
 		 338 aa  257  2e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3166  AraC family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 312 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5202  AraC family transcriptional regulator  47.8 
 
 		 312 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0605893 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  45.66 
 
 		 327 aa  255  6e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  46.6 
 
 		 351 aa  255  7e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5187  AraC family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 317 aa  249  4e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4441  AraC family transcriptional regulator  47.28 
 
 		 318 aa  244  9.999999999999999e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.951524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  46.5 
 
 		 327 aa  244  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  44.69 
 
 		 322 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  44.38 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  44.38 
 
 		 324 aa  243  3e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  44.38 
 
 		 324 aa  242  5e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 322 aa  242  7e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  44.06 
 
 		 334 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  43.67 
 
 		 336 aa  240  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  46.23 
 
 		 338 aa  239  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  41.99 
 
 		 335 aa  238  1e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  43.17 
 
 		 338 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  45.22 
 
 		 387 aa  231  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  41.35 
 
 		 332 aa  230  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  43.89 
 
 		 322 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  42.72 
 
 		 339 aa  226  3e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  46.03 
 
 		 323 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  39.74 
 
 		 349 aa  226  4e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  40.76 
 
 		 325 aa  225  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  41.38 
 
 		 319 aa  225  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  48.07 
 
 		 437 aa  224  1e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  42.14 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  44.67 
 
 		 363 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  43.59 
 
 		 375 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  43.51 
 
 		 321 aa  222  6e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  39.13 
 
 		 372 aa  222  7e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  41.5 
 
 		 338 aa  221  9e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4827  transcriptional regulator, AraC family  42.09 
 
 		 319 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  38.49 
 
 		 330 aa  220  1.9999999999999999e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  44.52 
 
 		 327 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  43.18 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  43.18 
 
 		 321 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  43.55 
 
 		 342 aa  219  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 321 aa  219  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 321 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  42.19 
 
 		 334 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  41.61 
 
 		 349 aa  219  6e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 321 aa  219  6e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  37.94 
 
 		 320 aa  219  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>